基于密码子偏性和分枝聚类的密码子置换模型的统计推断
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-19页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·本文主要研究工作 | 第10-11页 |
| ·预备知识 | 第11-19页 |
| ·生物学基础知识 | 第11-13页 |
| ·系统发生分析预备知识 | 第13-15页 |
| ·最大似然估计法 | 第15-17页 |
| ·EM 算法 | 第17-19页 |
| 第二章 基于密码子偏性的置换模型的统计推断 | 第19-27页 |
| ·引言 | 第19页 |
| ·模型方法 | 第19-23页 |
| ·密码子置换模型 | 第20-22页 |
| ·最大似然法估计参数 | 第22-23页 |
| ·模型比较 | 第23页 |
| ·模型的数据集应用 | 第23-24页 |
| ·结果 | 第24页 |
| ·讨论 | 第24-27页 |
| 第三章 基于聚类分析法的密码子模型检测选择压力 | 第27-34页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·理论与方法 | 第27-32页 |
| ·密码子置换模型 | 第27-28页 |
| ·聚类分析 | 第28-29页 |
| ·最大似然法 | 第29-32页 |
| ·模型比较方法 | 第32页 |
| ·数据集应用 | 第32-33页 |
| ·结果及结论 | 第33-34页 |
| 第四章 基于 EM 算法估计序列伽马距离 | 第34-40页 |
| ·引言 | 第34-35页 |
| ·系统发生树的基本元素 | 第35页 |
| ·两种简单的核苷酸置换模型 | 第35-36页 |
| ·JC69 模型 | 第35-36页 |
| ·K80 模型 | 第36页 |
| ·EM 算法估计序列距离 | 第36-39页 |
| ·系统发生树可靠性的检验 | 第39-40页 |
| 第五章 总结及展望 | 第40-42页 |
| ·本文总结 | 第40页 |
| ·工作展望 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第46页 |
