| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述：与生命科学研究相关的现代信息技术 | 第11-27页 |
| 1 引言 | 第11页 |
| 2 生物信息的管理技术 | 第11-18页 |
| ·生物信息的类型 | 第12-13页 |
| ·数据信息 | 第12页 |
| ·文献信息 | 第12页 |
| ·专利信息 | 第12-13页 |
| ·工具信息 | 第13页 |
| ·生物信息的管理技术 | 第13-16页 |
| ·数据库 | 第13页 |
| ·元数据和资源描述框架 | 第13-14页 |
| ·本体 | 第14-16页 |
| ·关联数据和大数据 | 第16页 |
| ·生物信息的检索 | 第16-18页 |
| 3 生物信息的挖掘和分析技术 | 第18-25页 |
| ·生物信息的数据挖掘 | 第18页 |
| ·生物信息的文本挖掘 | 第18-20页 |
| ·生物学文献文本挖掘的意义 | 第18-19页 |
| ·生物学文献文本挖掘的方法 | 第19-20页 |
| ·含文本挖掘技术的检索工具 | 第20-24页 |
| ·PosMed | 第20页 |
| ·agriGO | 第20-21页 |
| ·STRING和STITCH | 第21-23页 |
| ·ChemWorX和Utopia | 第23-24页 |
| ·专利文献的分析方法 | 第24-25页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第25-27页 |
| 第二章 植物病理学研究中的生物信息学分析—以“西瓜果斑病菌T2SS分泌系统”为例 | 第27-59页 |
| 1 引言 | 第27-32页 |
| ·BFB病原 | 第27-28页 |
| ·果斑病菌的传播途径 | 第28页 |
| ·果斑病菌的致病因子 | 第28-30页 |
| ·果斑病的防治 | 第30-32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-34页 |
| ·研究数据 | 第32-33页 |
| ·文献数据 | 第32页 |
| ·序列数据 | 第32-33页 |
| ·研究方法 | 第33-34页 |
| ·A.citrulli AAC00-1菌株的T2SS基因结构分析 | 第33页 |
| ·A.citrulli同源T2SS分泌蛋白序列比对 | 第33页 |
| ·分泌蛋白信号肽分析 | 第33页 |
| ·分泌蛋白的功能预测 | 第33-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-57页 |
| ·A.citrulli AAC00-1菌株的T2SS基因结构 | 第34-36页 |
| ·预测的A.citrulli T2SS分泌蛋白 | 第36-41页 |
| ·T2SS分泌蛋白信号肽 | 第41页 |
| ·T2SS分泌蛋白功能预测 | 第41-57页 |
| ·T2SS分泌蛋白之间的互作网络 | 第41-43页 |
| ·T2SS分泌蛋白与其它蛋白的互作关系 | 第43-52页 |
| ·T2SS分泌蛋白涉及的代谢通路 | 第52-55页 |
| ·T2SS分泌的鞭毛蛋白 | 第55-57页 |
| ·分泌蛋白在植物细胞中的定位预测 | 第57页 |
| 4 讨论 | 第57-59页 |
| 第三章 植物病理学研究中的专利分析—以“灰霉病生物防治研究”为例 | 第59-72页 |
| 1 引言 | 第59-60页 |
| ·灰霉病的危害 | 第59页 |
| ·灰葡萄孢的生物防治 | 第59-60页 |
| 2 材料与方法 | 第60-61页 |
| ·专利文献来源 | 第60页 |
| ·专利分析方法 | 第60-61页 |
| ·专利结构数据分析 | 第60-61页 |
| ·专利文献内容分析 | 第61页 |
| 3 结果与分析 | 第61-70页 |
| ·灰霉病生防专利检索结果 | 第61页 |
| ·灰霉病生防专利结构数据分析结果 | 第61-68页 |
| ·灰霉病生防专利申请量按国别/机构分布的趋势 | 第61-64页 |
| ·灰霉病生防专利技术细分 | 第64-66页 |
| ·专利权人分析 | 第66-68页 |
| ·专利文献内容分析结果 | 第68-70页 |
| ·灰霉病生防专利中涉及到的防治对象 | 第68页 |
| ·灰霉病生防专利中涉及到的用途 | 第68-69页 |
| ·灰霉病防专利中的生防菌株 | 第69-70页 |
| 4 讨论 | 第70-72页 |
| 全文总结和展望 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 致谢 | 第82-84页 |
| 附录1 植物病原细菌T2SS分泌蛋白谱 | 第84-87页 |
| 附录2 灰霉病生防菌株 | 第87-90页 |
