| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第1章 ESR的理论和应用简介 | 第11-27页 |
| ·引言 | 第11-12页 |
| ·电子自旋共振现象 | 第12-13页 |
| ·蛋白质位点特异性突变和自旋标记 | 第13-14页 |
| ·利用SDSL-ESR方法研究蛋白质的动力学和结构性质 | 第14-15页 |
| ·利用ESR对蛋白质结构的距离测量 | 第15-20页 |
| ·双电子电子共振介绍 | 第15-18页 |
| ·DEER在结构生物学中的应用 | 第18-20页 |
| ·利用饱和转移ESR实验对不同自由基成份的研究 | 第20-27页 |
| ·饱和转移实验理论介绍 | 第20-23页 |
| ·饱和转移实验应用 | 第23-27页 |
| 第2章 核磁共振结合ESR对多结构域蛋白Rv0899的研究 | 第27-41页 |
| ·引言 | 第27-29页 |
| ·实验材料和方法 | 第29-32页 |
| ·Rv0899蛋白质实验样品的表达、纯化和自旋标记 | 第29-30页 |
| ·Rv0899顺磁共振增强实验光谱的采集、谱峰归属和弛豫分析 | 第30-31页 |
| ·Rv0899蛋白质双电子电子共振实验样品的制备和实验过程 | 第31-32页 |
| ·利用NOE, PRE和DEER的距离约束对蛋白质进行结构计算 | 第32页 |
| ·结果与分析 | 第32-39页 |
| ·未引入顺磁共振增强和双电子电子共振距离约束时的结构 | 第32-33页 |
| ·对蛋白质主链的弛豫分析和X射线小角散射对蛋白刚性的研究 | 第33-35页 |
| ·引入顺磁共振增强和双电子电子共振距离约束后的结构 | 第35-38页 |
| ·距离相关性分析 | 第38-39页 |
| ·本章小结 | 第39-41页 |
| 第3章 利用双电子电子共振实验对甘油二酯激酶DAGK晶体和液体核磁结构的验证 | 第41-51页 |
| ·引言 | 第41-43页 |
| ·实验材料与方法 | 第43-44页 |
| ·甘油二酯激酶DAGK蛋白实验样品的表达、纯化和自旋标记 | 第43页 |
| ·甘油二酯激酶DAGK质双电子电子共振实验和数据处理 | 第43-44页 |
| ·结果与分析 | 第44-49页 |
| ·DAGK蛋白样品的DEER光谱测量和距离结果 | 第44-46页 |
| ·MTSL分子整合入晶体结构和液体核磁结构的计算及自旋标记物之间的距离 | 第46-49页 |
| ·晶体结构与液体核磁结构与双电子电子共振实验结果的比较 | 第49页 |
| ·本章小结 | 第49-51页 |
| 第4章 利用ESR对Ndi1蛋白电子传递过程的研究 | 第51-71页 |
| ·引言 | 第51-54页 |
| ·对Ndi1蛋白的饱和转移ESR实验 | 第54-57页 |
| ·实验准备和过程 | 第54-57页 |
| ·ESR对野生型Ndi1蛋白电子传递过程中的反铁磁现象的研究 | 第57-63页 |
| ·背景介绍 | 第57-59页 |
| ·样品制备 | 第59页 |
| ·对Ndi1(DDM)-NADH样品和Ndi1(DDM)-NADH-NADH样品中反铁磁现象的ESR低温实验 | 第59-60页 |
| ·对Ndi1(DDM)-NADH样品的超导量子干涉器实验 | 第60-61页 |
| ·实验结果 | 第61-63页 |
| ·经过自旋标记的GadC蛋白作为对照的研究 | 第63-67页 |
| ·简介 | 第63-65页 |
| ·GadC蛋白样品制备 | 第65-66页 |
| ·Gadc蛋白样品的温度依赖的ESR实验 | 第66-67页 |
| ·对Ndi1样品突变体的ESR低温实验研究 | 第67-69页 |
| ·简介 | 第67页 |
| ·Ndi1样品突变的样品制备 | 第67-68页 |
| ·Ndi1突变体的温度依赖的ESR实验 | 第68页 |
| ·低温实验结果 | 第68-69页 |
| ·本章小结 | 第69-71页 |
| 第5章 利用量子化学对Ndi1蛋白电子传递过程的研究 | 第71-79页 |
| ·电子自旋密度的计算 | 第71-74页 |
| ·背景简介 | 第71-72页 |
| ·对Ndi1(DDM)-NADH Ndi1(DDM)-NADH-NADH电子传递过程中自旋密度的计算 | 第72-73页 |
| ·结论和讨论 | 第73-74页 |
| ·海森堡J耦合常数的计算 | 第74-77页 |
| ·理论背景简介 | 第74-75页 |
| ·对Ndi1(DDM)-NADH和Ndi1(DDM)-NADH-NADH样品中反铁磁现象中海森堡J耦合常数的计算以及海森堡J耦合常数和分子取向的关系 | 第75-77页 |
| ·本章小结 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-87页 |
| 附录1 van Vleck公式推导 | 第87-89页 |
| 附录2 自旋密度表和二面角定义 | 第89-92页 |
| 附录3 ONIOM方法介绍,CASSCF简介 | 第92-105页 |
| 致谢 | 第105-107页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第107页 |
