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肺炎链球菌糖苷酶StrH和BglA-2的结构与功能的研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
目录第9-13页
第一部分 肺炎链球菌表面β-N-乙酰氨基己糖苷酶StrH的结构与功能研究第13-63页
 第一章 StrH研究背景第13-29页
   ·引言第13-29页
     ·肺炎链球菌的研究背景第13-15页
     ·肺炎链球菌的毒力因子——表面糖苷酶第15-23页
     ·肺炎链球菌表面β-N-乙酰氨基己糖苷酶第23-26页
     ·GH20家族β-N-乙酰氨基己糖苷酶的催化机制可能的催化机制第26-29页
 第二章 StrH实验材料与方法第29-35页
   ·StrH的质粒构建及蛋白表达第29-31页
     ·StrH(35-977)-pLIM01和StrH(175-642)-p28质粒构建第29-30页
     ·StrH(35-977)和StrH(175-642)重组蛋白的表达第30-31页
   ·StrH(35-977)和StrH(175-642)重组蛋白质纯化第31页
   ·晶体筛选与优化第31-32页
   ·晶体衍射数据的收集与处理第32页
   ·体外酶活检测第32页
   ·1-Phenyl-3-methyl-5-pyrazolone(PMP)衍生化处理第32页
   ·HPLC分析第32页
   ·二级结构测定第32-33页
   ·StrH与乳铁蛋白的酶联免疫吸附实验第33-35页
 第三章 StrH实验结果第35-45页
   ·StrH(35-977)重组蛋白的纯化及结晶第35-36页
   ·StrH(35-977)部分酶解第36页
   ·StrH(175-642)亚克隆质粒的构建和重组蛋白的表达检测第36-37页
   ·StrH(175-642)重组蛋白的纯化第37-39页
   ·StrH(175-642)晶体初筛及优化第39-40页
   ·StrH(175-642)衍射数据收集、处理及蛋白结构解析第40-41页
   ·StrH体外活性测定第41-42页
   ·二级结构测定第42-43页
   ·StrH与乳铁蛋白的酶联免疫吸附实验结果第43-45页
 第四章 StrH分析与讨论第45-61页
   ·StrH的结构域组成第45-46页
   ·StrH(175-642)的整体结构第46-49页
   ·StrH的GH20-1的活性位点第49-51页
   ·StrH两个GH20结构域的活性分析第51-52页
   ·StrH的底物特异性第52-59页
   ·StrH的两个GH20结构域的协同效应研究第59-61页
 小结第61-63页
第二部分 肺炎链球菌6-磷酸β-葡萄糖苷酶BglA-2的结构与功能研究第63-97页
 第五章 BglA-2研究背景第63-73页
   ·肺炎链球菌的糖转运系统第63-68页
   ·肺炎链球菌6-磷酸β-葡萄糖苷酶第68-71页
   ·肺炎链球菌6-磷酸β-葡萄糖苷酶的催化机制第71-72页
   ·GH-1家族糖苷酶的研究进展第72-73页
 第六章 BglA-2实验材料与方法第73-79页
   ·BglA-2的质粒构建第73-74页
   ·BglA-2的表达及纯化第74-75页
     ·重组蛋白的表达第74-75页
     ·重组蛋白质纯化第75页
   ·晶体筛选与优化第75页
   ·晶体衍射数据的收集与处理第75页
   ·动态光散射测定第75-76页
   ·体外酶活检测第76页
     ·BglA-2对通用底物硝基苯6-磷酸β-D-葡萄糖的酶活测定第76页
     ·1-Phenyl-3-methyl-5-pyrazolone(PMP)衍生化处理第76页
     ·HPLC分析第76页
   ·平衡解离常数Kd的测定第76页
   ·二级结构测定第76-77页
   ·基因敲除菌株的构建及生长曲线的测定第77-79页
     ·基因敲除菌株的构建第77页
     ·生长曲线的测定第77-79页
 第七章 BglA-2实验结果第79-85页
   ·BglA-2构建及蛋白表达纯化第79-80页
   ·BglA-2重组蛋白的晶体筛选和优化第80-81页
   ·BglA-2的晶体数据收集及处理第81-82页
   ·BglA-2酶活测定第82-83页
   ·平衡解离常数Kd的测定第83页
   ·二级结构测定第83-84页
   ·生长曲线的测定第84-85页
 第八章 BglA-2实验分析与讨论第85-95页
   ·BglA-2的整体结构第85-86页
   ·BglA-2的活性位点第86-87页
   ·BglA-2的底物特异性第87-93页
     ·对subsite+1特异性的关键氨基酸第88-91页
     ·对稳定磷酸根起关键作用的氨基酸第91页
     ·一个色氨酸区分了GH-1家族里的6-磷酸β-葡萄糖苷酶和的6-磷酸β-半乳糖苷酶第91-93页
   ·6-磷酸-β-糖苷酶提供了一个替代(非必须的)路径来利用β-连接的二糖第93-95页
 小结第95-97页
参考文献第97-111页
附录第111-127页
致谢第127-129页
在读期间发表的学术论文与参加的学术会议第129页

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