| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-29页 |
| ·计算机辅助药物设计 | 第11-13页 |
| ·概述 | 第11-12页 |
| ·计算机辅助药物设计的原理及分类 | 第12-13页 |
| ·虚拟筛选与分子对接 | 第13-19页 |
| ·分子对接理论 | 第13-15页 |
| ·分子对接方法的分类 | 第15-16页 |
| ·分子对接常用软件 | 第16-18页 |
| ·基于分子对接方法的虚拟筛选 | 第18-19页 |
| ·分子动力学模拟 | 第19-22页 |
| ·分子动力学模拟简介 | 第19-20页 |
| ·分子动力学模拟在生物分子研究中的应用 | 第20-21页 |
| ·分子动力学模拟常用软件包介绍 | 第21-22页 |
| ·阿尔兹海默症研究进展 | 第22-23页 |
| ·阿尔兹海默症简介 | 第22页 |
| ·阿尔兹海默症的致病原因 | 第22-23页 |
| ·β分泌酶抑制剂的研究 | 第23-27页 |
| ·β分泌酶的研究现状 | 第23-25页 |
| ·BACE1抑制剂的研究进展 | 第25-27页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第27-29页 |
| 2 基于MICAD和DrugBank数据库的虚拟筛选 | 第29-53页 |
| ·引言 | 第29-30页 |
| ·BACE1受体集合的建立 | 第30-34页 |
| ·收集多构型BACE1受体结构 | 第30-31页 |
| ·受体库的预处理 | 第31-34页 |
| ·基于MICAD数据库的筛选 | 第34-36页 |
| ·MICAD数据库的简介 | 第34页 |
| ·MICAD中配体库的建立 | 第34-36页 |
| ·虚拟数据库筛选 | 第36页 |
| ·基于DrugBank数据库的虚拟筛选 | 第36-38页 |
| ·DrugBank数据库简介 | 第36-37页 |
| ·DrugBank数据库中配体库的建立 | 第37页 |
| ·虚拟数据库筛选 | 第37-38页 |
| ·实验结果与讨论 | 第38-51页 |
| ·MICAD中FIPSDock结果的聚类分析 | 第38-40页 |
| ·MICAD中四类分子的对接结果分析 | 第40-45页 |
| ·DrugBank中对接结果的聚类分析 | 第45-48页 |
| ·DrugBank中与BACE1结合最好的四个分子 | 第48-50页 |
| ·运用多受体分子进行筛选的优势 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 3 BACE1分子动力学研究 | 第53-67页 |
| ·引言 | 第53页 |
| ·Gromacs软件介绍 | 第53-54页 |
| ·分子动力学模拟的方法与步骤 | 第54-59页 |
| ·体系的准备及参数设定 | 第54-58页 |
| ·动力学模拟步骤 | 第58-59页 |
| ·模拟结果分析 | 第59-65页 |
| ·Gefitinib与BACE1的模拟结果 | 第59-64页 |
| ·Imatinib与BACE1的模拟结果 | 第64-65页 |
| ·本章小结 | 第65-67页 |
| 4 Gefitinib生物活性验证 | 第67-77页 |
| ·引言 | 第67页 |
| ·实验材料与设备 | 第67-70页 |
| ·实验材料及试剂 | 第67-68页 |
| ·实验设备 | 第68-69页 |
| ·试剂配制 | 第69-70页 |
| ·实验方法 | 第70-73页 |
| ·BACE1酶活测定实验 | 第70页 |
| ·细胞活性测试 | 第70页 |
| ·ELISA法检测细胞Aβ蛋白的表达量 | 第70-71页 |
| ·Western Blot检测蛋白表达 | 第71-73页 |
| ·实验结果 | 第73-76页 |
| ·Gefinitib对BACE1的抑制活性 | 第73-74页 |
| ·Gefinitib对神经细胞活性的影响 | 第74页 |
| ·Gefitinib对Aβ_(40)和Aβ_(42)蛋白表达量的影响 | 第74-75页 |
| ·不同浓度的Gefinitib对APP蛋白表达量的影响 | 第75-76页 |
| ·本章小结 | 第76-77页 |
| 结论 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-81页 |
| 附录A 虚拟筛选脚本语言 | 第81-83页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第83-84页 |
| 致谢 | 第84-85页 |
