| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-16页 |
| ·课题背景 | 第9-14页 |
| ·HIV的生命周期 | 第9页 |
| ·HIV-PR | 第9-12页 |
| ·氨基酸 | 第12-14页 |
| ·国内外研究现状 | 第14-15页 |
| ·本文的工作内容 | 第15-16页 |
| 2 模式识别 | 第16-22页 |
| ·分类器 | 第16-19页 |
| ·BP神经网络 | 第16-17页 |
| ·SVM | 第17-19页 |
| ·特征降维 | 第19-20页 |
| ·信息融合 | 第20-21页 |
| ·数据集 | 第21-22页 |
| 3 基于改进CAFS特征选择的HIV-PR剪切位点预测 | 第22-38页 |
| ·CAFS | 第22-23页 |
| ·特征提取 | 第23-24页 |
| ·基于序列信息的特征提取 | 第23页 |
| ·基于氨基酸物理化学性质的特征提取 | 第23-24页 |
| ·改进的算法流程 | 第24-27页 |
| ·确定最终特征子集 | 第27-30页 |
| ·结果分析 | 第30-37页 |
| ·评价参数 | 第30-32页 |
| ·三种原始特征与融合后的预测性能 | 第32-33页 |
| ·特征子集分析 | 第33-37页 |
| ·特征子集与融合后的预测性能 | 第37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 4 基于改进BPFS特征选择的HIV-PR剪切位点预测 | 第38-48页 |
| ·LPP | 第38-39页 |
| ·BPFS | 第39-40页 |
| ·协熵 | 第39-40页 |
| ·算法介绍 | 第40页 |
| ·改进的BPFS方法 | 第40-44页 |
| ·改进的算法流程 | 第41-43页 |
| ·确定特征子集的最优特征维数 | 第43-44页 |
| ·SVM参数优化及结果分析 | 第44-47页 |
| ·基于准确率优化SVM参数 | 第44-45页 |
| ·基于MCC值优化SVM参数 | 第45-46页 |
| ·基于AUC值优化SVM参数 | 第46-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 5 基于生物相似度的HIV-PR剪切位点预测 | 第48-60页 |
| ·序列比对 | 第48-49页 |
| ·序列比对方法 | 第49-50页 |
| ·全局比对与局部比对 | 第49-50页 |
| ·序列比对与多序列比对 | 第50页 |
| ·替换矩阵 | 第50-52页 |
| ·基于无空位全序列比对相似度的HIV-PR剪切位点预测 | 第52-59页 |
| ·全序列比对相似度 | 第52-53页 |
| ·试验结果与分析 | 第53-59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-64页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第66页 |
