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轮枝镰孢菌(Fusarium verticillioide)孢子表面蛋白提取、基因克隆表达与功能分析

中文摘要第1-12页
Abstract第12-14页
1 前言第14-28页
   ·菌寄生研究现状与进展第14-16页
     ·疏水蛋白的研究现状与进展第16-17页
     ·疏水蛋白的性质第16页
     ·疏水蛋白在不同物相之间的互动组装第16-17页
     ·疏水蛋白的功能第17页
   ·轮枝镰孢菌疏水蛋白的研究现状与进展第17-18页
   ·巴斯德毕赤酵母表达系统的研究现状与进展第18-21页
     ·巴斯德毕赤酵母生物学和遗传学特点第18页
     ·巴斯德毕赤酵母表达系统的构成第18-20页
       ·宿主菌株第18-19页
       ·表达载体第19-20页
     ·表达外源基因的机制第20-21页
     ·巴斯德毕赤酵母表达系统的优点第21页
   ·镍柱亲和层析第21-22页
   ·植物病原基因敲除功能研究现状与进展第22-23页
   ·轮枝镰孢菌遗传转化系统的研究现状与进展第23-25页
     ·根癌农杆菌第23页
     ·农杆菌Ti质粒的结构第23页
     ·根癌农杆菌介导真菌遗传转化的机理第23-24页
     ·根癌农杆菌介导丝状真菌转化的特点第24-25页
   ·选题的目的意义、研究内容和技术路线第25-28页
     ·目的意义第25-26页
     ·研究内容第26-27页
     ·技术路线第27-28页
2 材料与方法第28-54页
   ·材料第28-32页
     ·供试菌株第28页
     ·菌株与质粒第28页
     ·主要生化和分子生物学试剂、酶第28页
     ·仪器第28-29页
     ·培养基第29-30页
     ·溶液配制第30-32页
   ·实验方法第32-54页
     ·轮枝镰孢菌孢子表面蛋白的提取方法第32-33页
       ·菌种培养第32页
       ·疏水蛋白的分离纯化第32-33页
       ·聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第33页
       ·N-端氨基酸测序第33页
     ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因克隆表达与功能分析第33-47页
       ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因的克隆第33-38页
         ·F.verticillioide总RNA的提取(Trizol法)及检测第33-34页
         ·反转录cDNA第一链的合成第34-35页
         ·引物设计第35页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因cDNA全长克隆第35-36页
         ·PCR产物回收第36页
         ·载体连接第36-37页
         ·大肠杆菌E.coli感受态细胞的制备和转化第37-38页
           ·大肠杆菌E.coli感受态的制备第37页
           ·大肠杆菌E.coli感受态的转化第37-38页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因序列测定第38页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因全长序列的生物信息学分析第38页
       ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因成熟肽基因序列的分离第38-41页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因成熟肽序列的限制性酶切位点分析第38页
         ·引物设计第38-39页
         ·质粒提取第39-40页
         ·质粒DNA的双酶切鉴定第40-41页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因序列测定第41页
       ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因在毕赤酵母中的表达第41-44页
         ·酵母表达载体的构建第41页
         ·线性化质粒DNA制备第41-42页
           ·线性化酶切第41-42页
           ·线状质粒DNA的纯化第42页
         ·酵母转化第42-44页
           ·Pichia pastoris GS115感受态细胞的制备(电击法)第42-43页
           ·重组表达质粒电击转化感受态酵母GS115细胞第43页
           ·酵母转化子甲醇利用表型的平板筛选第43页
           ·酵母转化子的PCR鉴定第43-44页
       ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因的表达与产物纯化第44-47页
         ·酵母工程菌的培养及HydⅠ、HydⅡ基因的诱导分泌表达第44-45页
         ·表达产物hydrophobinⅠ、hydrophobinⅡ的纯化第45-47页
           ·蛋白样品的预处理第45页
           ·Ni-NTA亲和层析纯化第45页
           ·表达产物纯化后蛋白制品SDS-PAGE分析第45-46页
           ·蛋白质含量测定第46-47页
       ·F.verticillioide hydrophobinⅠ、hydrophobinⅡ对孢子凝集作用的研究第47页
         ·pH值对孢子凝聚的影响第47页
     ·根癌农杆菌介导轮枝镰孢遗传转化所用转化载体的构建第47-54页
       ·突变载体的构建第47-50页
         ·构建策略及流程第47-49页
         ·HydⅡ基因上下游基因序列的PCR扩增第49页
         ·重组第49-50页
       ·pUCATPH-X-S与pROKⅡ的重构第50-52页
         ·构建策略及流程第51-52页
         ·质粒pROKⅡ和pUCATPH-X-S的双酶切第52页
         ·连接第52页
       ·转化大肠杆菌感受态,筛选阳性重组克隆第52-54页
         ·大肠杆菌五.C0//感受态的制备(参照2.2.2.1.7.1)第52页
         ·大肠杆菌感受态的转化(参照2.2.2.1.7.2 )第52页
         ·重组质粒的筛选与鉴定第52-53页
         ·碱法小量提取质粒DNA(参照2.2.2.2.3)第53页
         ·酶切和PCR鉴定第53-54页
3 结果与分析第54-85页
   ·F.verticillioide孢子表面疏水蛋白的提取第54-55页
     ·SDS-PAGE电泳结果第54-55页
     ·F.verticillioide疏水蛋白基因HydⅠ、HydⅡ克隆表达与凝聚功能分析第55-79页
     ·HydⅠ、HydⅡ基因克隆第55-64页
       ·总RNA的提取(Trizol法)第55页
       ·HydⅠ、HydⅡ目的基因的分离第55-56页
       ·HydⅠ、HydⅡ基因核苷酸序列及氨基酸序列分析第56-60页
       ·Fusarium verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因成熟肽基因序列的分离第60-64页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因成熟肽序列的限制性酶切位点分析结果第60页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ成熟肽基因的氨基酸序列分析第60-62页
         ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ编码序列的分离第62-64页
     ·F.verticillioide HydⅠ、HydⅡ基因在毕赤酵母中的表达第64-73页
       ·酵母表达载体的构建和鉴定第64-70页
       ·表达质粒转化Pichia pastoris GS115及酵母转化子的筛选第70-73页
         ·酵母转化子的甲醇利用表型的筛选第70-71页
         ·酵母转化子的PCR鉴定第71-72页
         ·F.verticillioide HydⅠ和HydⅡ基因酵母多拷贝整合子的筛选第72-73页
     ·表达产物的纯化第73-75页
     ·疏水蛋白对孢子凝聚作用的研究第75-79页
       ·疏水蛋白对轮枝镰孢菌和纤细齿梗孢孢子凝聚作用研究第75-77页
       ·疏水蛋白对其它孢子的凝聚作用研究第77-78页
       ·pH对孢子凝聚作用的影响第78-79页
   ·F.verticillioide HydⅡ基因敲除载体的构建第79-85页
     ·HydⅡ基因全长与延伸片段的获得第79-81页
     ·HydⅡ基因上下游片段的分离第81页
     ·突变载体pROKⅡ-PtrpC-hph-TtrpC的构建第81-83页
       ·第一次重组第81-82页
       ·第二次重组第82-83页
     ·pUCATPH-X-S与pROKⅡ的重构第83-85页
       ·质粒pROKⅡ和pUCATPH-X-S的双酶切产物第83页
       ·含潮霉素抗性基因的DNA片段的插入识别第83-85页
4 讨论第85-87页
   ·F.verticillioide孢子表面蛋白的提取第85页
   ·F.verticillioide HydⅠ和HydⅡ基因的克隆表达与功能分析第85-86页
   ·F.verticillioide HydⅡ基因敲除载体的构建第86-87页
5 结论与建议第87-89页
   ·结论第87-88页
   ·下一步工作建议第88-89页
参考文献第89-101页
致谢第101页

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