| 缩略词对照表 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 前言 | 第14-18页 |
| 第一章 肝脏亚细胞器分离方法的建立及评价 | 第18-30页 |
| 1 试剂及器材 | 第18-19页 |
| 2.方法 | 第19-22页 |
| ·小鼠肝脏的取出及保存 | 第19页 |
| ·肝脏亚细胞组分提取及评价 | 第19-21页 |
| ·亚细胞组分的蛋白质得率和纯度评价 | 第21页 |
| ·Western blot鉴定细胞器纯度 | 第21-22页 |
| 3 结果与讨论 | 第22-28页 |
| ·细胞器的分离 | 第23-25页 |
| ·组织保存方法对细胞器提取的影响 | 第25-28页 |
| 参考文献 | 第28-30页 |
| 第二章 C57小鼠肝脏细胞器蛋白质表达谱构建及无标记定量分析 | 第30-48页 |
| 1 试剂及器材 | 第30-31页 |
| 2 方法 | 第31-35页 |
| ·蛋白质提取及亚细胞器的分离 | 第31-32页 |
| ·质谱半定量方法的建立和测定 | 第32-33页 |
| ·质谱数据的搜库和数据过滤标准的确定 | 第33页 |
| ·质谱半定量数据的校正和定量曲线的绘制 | 第33-34页 |
| ·C57小鼠肝脏细胞器鉴定蛋白的聚类分析 | 第34页 |
| ·k最近邻算法对亚细胞组分鉴定蛋白质的定位预测 | 第34-35页 |
| ·GO功能注释分析 | 第35页 |
| 3 结果与讨论 | 第35-45页 |
| ·质谱定量的准确性的分析 | 第35-37页 |
| ·C57小鼠肝脏细胞器蛋白质的鉴定、聚类分析及GO功能注释 | 第37-40页 |
| ·鉴定蛋白质亚细胞定位的机器学习分类 | 第40页 |
| ·鉴定蛋白质细胞器定位的最终划分 | 第40-45页 |
| 参考文献 | 第45-48页 |
| 第三章 C57小鼠肝脏细胞器蛋白质表达谱的数据分析阐释 | 第48-64页 |
| 1 数据处理与分析方法 | 第48-50页 |
| ·GO数据分类对鉴定蛋白质的功能描述 | 第48页 |
| ·C57小鼠蛋白质相互作用网络的构建 | 第48-49页 |
| ·蛋白质相互作用数据集与C57小鼠肝脏细胞器蛋白质的整合 | 第49页 |
| ·蛋白质相互作用网络复合体的找寻 | 第49-50页 |
| 2 结果与讨论 | 第50-61页 |
| ·GO数据库对鉴定蛋白质的总体描述 | 第50-52页 |
| ·C57小鼠蛋白质相互作用网络的建立及应用 | 第52-61页 |
| 参考文献 | 第61-64页 |
| 第四章 成人肝脏细胞核蛋白质表达谱的构建及数据分析 | 第64-80页 |
| 1 试剂及器材 | 第64-65页 |
| 2 方法 | 第65-69页 |
| ·细胞器的分离、蛋白质鉴定及数据标准的确定 | 第65页 |
| ·贝叶斯模型(Bayes Model)的建立及蛋白质的亚细胞定位预测 | 第65-69页 |
| ·成人肝脏细胞核蛋白质数据分析 | 第69页 |
| 3 结果及讨论 | 第69-79页 |
| ·成人肝脏细胞器分离 | 第69-70页 |
| ·细胞核蛋白质鉴定情况 | 第70页 |
| ·贝叶斯模型的构建及对细胞核蛋白质定位的划分 | 第70-72页 |
| ·成人肝脏细胞核蛋白质表达谱的数据分析 | 第72-79页 |
| 参考文献 | 第79-80页 |
| 全文结论 | 第80-82页 |
| 附录 | 第82-136页 |
| 文献综述 | 第136-142页 |
| 发表论文 | 第142-156页 |
| 作者简历 | 第156-157页 |
| 致谢 | 第157页 |
