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IGFs、LYZ基因和EAV-HP DNA序列SNPs与京海黄鸡经济性状的关联分析

中文摘要第1-14页
英文摘要第14-17页
第一章 文献综述第17-34页
 1 家禽分子遗传标记研究进展第17-25页
   ·分子遗传标记研究方法第17-18页
   ·几种常规分子遗传标记技术第18-24页
     ·RFLP技术第18-19页
     ·RAPD技术第19-20页
     ·微卫星标记技术第20页
     ·AFLP技术第20-21页
     ·SSCP技术第21-24页
     ·DNA指纹第24页
   ·单核苷酸标记(SNPs)及其应用第24-25页
 2 胰岛素样生长因子(IGFs)及其基因研究进展第25-29页
 3 溶菌酶(lysozyme, LYZ)及其基因研究进展第29-30页
 4 内源性禽逆转录病毒EAV研究进展第30-32页
 5 京海黄鸡品种简介第32-33页
 6 本研究的目的和意义第33-34页
第二章 京海黄鸡生长发育规律的研究第34-49页
 1 材料与方法第34-36页
   ·实验数据来源第34页
   ·饲养标准第34-35页
   ·统计方法第35-36页
     ·生长速度第35页
     ·生长曲线拟合第35页
     ·产蛋率第35页
     ·产蛋曲线拟合第35-36页
 2 结果与分析第36-46页
   ·京海黄鸡生长速度第36页
   ·J~+和 J品系早期体重比较第36-38页
   ·生长曲线拟合第38-41页
     ·三种不同生长模型参数估计第38-39页
     ·拟合曲线方程理论值与实测值的比较第39-41页
   ·周产蛋率第41-42页
   ·产蛋率曲线拟合第42-46页
     ·产蛋率模型参数估计第42-44页
     ·拟合曲线方程理论值与实测值的比较第44-46页
 3 讨论第46-49页
   ·京海黄鸡生长发育规律第46页
   ·J 带标记与鸡生长速度的关系第46-47页
   ·京海黄鸡生长曲线拟合第47-48页
   ·京海黄鸡产蛋率曲线拟合第48-49页
第三章 鸡胰岛素样生长因子 1(IGF1)基因多态性及其与经济性状的关联分析第49-67页
 1 材料与方法第49-54页
   ·材料第49-51页
     ·实验材料第49页
     ·实验仪器第49-50页
     ·实验试剂第50页
     ·主要试剂的配置第50-51页
   ·方法第51-54页
     ·基因组DNA 提取第51页
     ·基因组DNA浓度和纯度的检测以及稀释第51页
     ·引物设计与合成第51-52页
     ·PCR扩增第52-53页
     ·琼脂糖检测第53页
     ·SSCP分析第53页
     ·硝酸银染色第53页
     ·序列的测定第53-54页
   ·统计分析第54页
     ·基因频率、基因型频率分布的差异检验第54页
     ·基因与经济性状的关联分析第54页
 2 结果与分析第54-60页
   ·基因组 DNA 提取第54-55页
   ·鸡 IGF1 基因多态性检测第55-58页
     ·PCR 产物大小检测第55-56页
     ·SSCP 检测第56页
     ·测序结果与序列比对分析第56-58页
   ·基因频率和基因型频率及Hardy-Weinberg平衡检验第58页
   ·IGF1 基因多态性与经济性状的关系第58-60页
     ·IGF1 基因型与经济性状的相关性分析第58-60页
     ·IGF1 基因单倍型与经济性状的相关性分析第60页
 3 讨论第60-67页
   ·IGF1 基因单碱基突变的研究第60-63页
   ·IGF1 基因型分布的遗传学分析第63-64页
   ·IGF1 基因型与生长性状的关系第64-65页
   ·IGF1 基因型与繁殖性状的关系第65-66页
   ·IGF1 基因联合位点的遗传效应分析第66-67页
第四章 鸡胰岛素样生长因子2(IGF2)基因多态性及其与经济性状的关联分析第67-81页
 1 材料与方法第67-68页
   ·材料第67页
   ·方法第67页
     ·DNA 提取及检测第67页
     ·引物设计与合成第67页
     ·PCR-SSCP 及测序第67页
   ·统计分析第67-68页
 2 结果与分析第68-76页
   ·鸡IGF2 基因多态性检测第68-72页
     ·PCR 产物第68-69页
     ·SSCP检测第69-70页
     ·测序分析第70-72页
   ·基因频率和基因型频率及Hardy-Weinberg 平衡检验第72-73页
   ·IGF2基因多态性与经济性状的关系第73-76页
     ·IGF2 基因型与经济性状的相关性分析第73-76页
     ·IGF2单倍型与经济性状的相关性分析第76页
 3 讨论第76-81页
   ·IGF2 基因单碱基突变的研究第76页
   ·IGF2 基因型分布的遗传学分析第76-79页
   ·IGF2 基因多态性与生长性状的关系第79-80页
   ·IGF2 基因多态性与繁殖性状的关系第80-81页
第五章 鸡溶菌酶基因(LYZ)多态性及其与经济性状的关联分析第81-105页
 1 材料与方法第82-84页
   ·材料第82页
     ·实验材料第82页
     ·实验仪器、试剂第82页
   ·方法第82页
     ·鸡蛋蛋清中溶菌酶的测定第82页
     ·DNA 提取及检测第82页
     ·引物设计与合成第82页
     ·PCR 扩增体系和产物检测第82页
     ·SSCP 检测及测序第82页
   ·统计分析第82-84页
     ·基因频率、基因型频率分布的差异检验第82-83页
     ·基因与经济性状的关联分析第83-84页
 2 结果与分析第84-101页
   ·基因组提取第84页
   ·鸡IGF2 基因多态性检测第84-87页
     ·PCR 产物第84页
     ·SSCP 检测第84-85页
     ·测序分析第85-87页
   ·群体遗传学分析第87-88页
   ·LYZ 基因多态性与经济性状的关联分析第88-101页
     ·LYZ 基因型与经济性状的关联分析第88-97页
     ·LYZ 基因型组合与经济性状的关联分析第97页
     ·单倍型与经济性状的关联分析第97-101页
 3 讨论第101-105页
   ·LYZ 基因突变位点的发现第101页
   ·LYZ 基因型的遗传分布第101-102页
   ·LYZ 基因与经济性状的关系第102-105页
第六章 禽内源性逆转录病毒(EAV-HP)DNA 序列多态性及其与生长性状的关联分析第105-128页
 1 材料与方法第105-107页
   ·材料第105页
     ·实验材料第105页
     ·实验仪器、试剂第105页
   ·方法第105-106页
     ·DNA 提取及检测第106页
     ·引物设计与合成第106页
     ·PCR 扩增体系和产物检测第106页
     ·SSCP 检测及测序第106页
   ·统计分析第106-107页
     ·基因频率、基因型频率分布的差异检验第106-107页
     ·基因与经济性状的关联分析第107页
 2 结果与分析第107-125页
   ·PCR 产物检测第107-108页
   ·SSCP分析第108-110页
   ·测序结果第110-112页
   ·基因频率和基因型频率及Hardy-Weinberg平衡检验第112-114页
   ·基因多态性与生长性状的关系第114-125页
     ·各引物基因型与生长性状的关系第114-119页
     ·基因型联合与生长性状的关系第119页
     ·单倍型分析第119-125页
 3 讨论第125-128页
   ·鸡EAV-HP 突变位点的发现第125页
   ·基因型在 J~+品系和 J~-品系中的分布第125-126页
   ·gag-env 基因多态性与生长性状的关系第126-128页
第七章 多基因综合标记分析第128-140页
 1 材料与方法第128-129页
   ·材料第128页
   ·方法第128-129页
     ·IGF1 基因和IGF2 基因综合标记第128-129页
     ·LYZ基因和EAV-HP DNA序列综合标记第129页
 2 结果与分析第129-136页
   ·IGF1 基因和IGF2 基因对经济性状的互作效应第129-131页
     ·IGF1 基因和IGF2 基因对生长性状的互作效应第129-130页
     ·IGF1 基因和IGF2 基因对繁殖性状的互作效应第130-131页
   ·IGF1 和IGF2 基因型组合对经济性状的互作效应分析第131-133页
     ·IGF1 和IGF2 基因型组合对生长性状的互作效应分析第131页
     ·IGF1 和IGF2 基因型组合对繁殖性状的互作效应分析第131-133页
   ·LYZ 基因和gag-env 基因对生长性状的互作效应第133-134页
   ·LYZ 和gag-env 基因型组合对生长性状的互作效应分析第134-136页
 3 讨论第136-140页
   ·京海黄鸡IGF1 基因和IGF2 基因的互作效应第136-137页
   ·京海黄鸡IGF1 和IGF2 基因型组合效应第137-138页
   ·京海黄鸡LYZ 基因和gag-env 基因的互作效应第138页
   ·京海黄鸡 LYZ和gag-env基因型组合效应第138-140页
附属实验:鸡蛋蛋清中溶菌酶含量和活力测定方法的建立第140-151页
 1 材料与方法第140-144页
   ·蛋清中溶菌酶含量的测定第140-142页
     ·原理第140页
     ·试剂与材料第140-141页
     ·仪器与设备第141页
     ·分析步骤第141页
     ·结果的计算与表述第141-142页
   ·蛋清中溶菌酶活力的测定第142-144页
     ·原理第142页
     ·试剂与材料第142页
     ·仪器和设备第142-143页
     ·分析步骤第143-144页
   ·精密度、准确度和灵敏度试验第144页
   ·重复性试验第144页
   ·伊萨鸡蛋和京海黄鸡蛋蛋清中溶菌酶的测定第144页
   ·统计分析第144页
 2 结果与分析第144-148页
   ·溶菌酶标准曲线第144-145页
   ·精密度、准确度和灵敏度试验结果第145-147页
     ·精密度第145-146页
     ·准确度第146页
     ·灵敏度第146-147页
   ·重复性检验结果第147-148页
   ·伊萨鸡蛋和京海黄鸡蛋蛋清中溶菌酶的测定结果第148页
 3 讨论第148-150页
   ·溶菌酶含量的测定第148-149页
   ·溶菌酶活力的测定第149-150页
 4 小结第150-151页
全文总结第151-153页
论文创新点第153-154页
参考文献第154-167页
致谢第167-169页
攻读学位期间发表论文第169页

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