| 中文摘要 | 第1-16页 |
| ABSTRACT | 第16-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-46页 |
| 1. 遗传多样性的概念、意义及研究方法 | 第20-26页 |
| ·遗传多样性的概念 | 第20页 |
| ·遗传多样性研究的作用和意义 | 第20-21页 |
| ·动物遗传多样性的研究方法 | 第21-26页 |
| ·形态学方法 | 第21-22页 |
| ·细胞遗传学方法 | 第22页 |
| ·生化检测方法 | 第22-23页 |
| ·DNA 分子标记方法 | 第23-26页 |
| 2. 微卫星标记及在遗传育种中的运用 | 第26-33页 |
| ·微卫星标记的概况 | 第26-27页 |
| ·微卫星的功能和形成机理 | 第27-28页 |
| ·微卫星的功能 | 第27页 |
| ·微卫星的形成机理 | 第27-28页 |
| ·微卫星标记在遗传育种中的运用 | 第28-33页 |
| ·构建遗传图谱 | 第28-29页 |
| ·QTL 定位和分子标记辅助育种 | 第29-30页 |
| ·个体及亲缘关系的鉴定 | 第30-31页 |
| ·遗传多样性的评估 | 第31-32页 |
| ·DNA 指纹图的制作 | 第32-33页 |
| 3. Myostatin 基因的研究进展 | 第33-38页 |
| ·Myostatin 基因的发现 | 第33页 |
| ·Myostatin 基因的定位 | 第33-34页 |
| ·Myostatin 基因的结构 | 第34页 |
| ·Myostatin 作用机理 | 第34-35页 |
| ·Myostatin 基因的生物学功能 | 第35-36页 |
| ·Myostatin 基因的多态性与生产性能的关系 | 第36-38页 |
| 4. 实时荧光定量PCR 技术 | 第38-44页 |
| ·实时荧光定量 PCR 技术的基本原理 | 第38-39页 |
| ·荧光定量 PCR 的定量方法 | 第39页 |
| ·荧光定量 PCR 反应方法的分类 | 第39-41页 |
| ·非特异性DNA 结合染料法 | 第39页 |
| ·探针法 | 第39-41页 |
| ·实时荧光定量 PCR 的应用 | 第41-44页 |
| ·病毒检测上的应用 | 第41页 |
| ·肿瘤检测上的应用 | 第41-42页 |
| ·转基因生物中的应用 | 第42页 |
| ·畜牧研究领域的应用 | 第42-44页 |
| 5. 边鸡以及3 个对照鸡种介绍 | 第44-45页 |
| 6. 本研究的目的和意义 | 第45-46页 |
| 第二章 边鸡微卫星 DNA 遗传多样性分析 | 第46-65页 |
| 1 材料和方法 | 第46-53页 |
| ·实验材料 | 第46-49页 |
| ·样本的采集 | 第46-47页 |
| ·主要实验仪器 | 第47页 |
| ·实验试剂 | 第47页 |
| ·主要试剂的配置 | 第47-49页 |
| ·试验方法 | 第49-51页 |
| ·鸡血液DNA 的提取 | 第49-50页 |
| ·微卫星引物 | 第50-51页 |
| ·PCR 扩增 | 第51页 |
| ·统计分析 | 第51-53页 |
| ·群体内遗传多样性的分析 | 第51-52页 |
| ·群体间遗传关系 | 第52-53页 |
| ·统计软件的运用 | 第53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-61页 |
| ·微卫星引物的PCR 产物电泳 | 第53-54页 |
| ·品种内的遗传变异分析 | 第54-58页 |
| ·等位基因数（特有等位基因数） | 第54-55页 |
| ·多态信息含量、期望杂合度和观察杂合度 | 第55-58页 |
| ·品种的遗传分化 | 第58页 |
| ·哈代温伯格平衡 | 第58页 |
| ·近交系数 | 第58-61页 |
| 3 讨论 | 第61-65页 |
| ·样本量的确定 | 第61-62页 |
| ·群体内的遗传多样性 | 第62-63页 |
| ·群体内的近交系数 | 第63-64页 |
| ·群体间的遗传分化 | 第64-65页 |
| 第三章 边鸡群体的保种效果 | 第65-72页 |
| 1 材料和方法 | 第65-66页 |
| ·试验材料 | 第65页 |
| ·主要实验仪器 | 第65-66页 |
| ·主要实验试剂及配制方法 | 第66页 |
| ·微卫星引物 | 第66页 |
| ·统计分析方法 | 第66页 |
| 2 结果与分析 | 第66-69页 |
| ·2 个世代边鸡的微卫星座位的等位基因数 | 第66-67页 |
| ·多态信息含量 | 第67页 |
| ·期望杂合度 | 第67-68页 |
| ·观察杂合度 | 第68页 |
| ·近交系数 | 第68-69页 |
| 3 讨论 | 第69-72页 |
| ·世代间群体遗传多样性的变化 | 第69-70页 |
| ·世代间近交系数的变化 | 第70页 |
| ·对边鸡保种的建议 | 第70-72页 |
| 第四章 Myostatin 基因的多态性及其与边鸡生长和繁殖性状的关联分析 | 第72-131页 |
| 1 材料与方法 | 第72-79页 |
| ·试验材料 | 第72-73页 |
| ·主要仪器 | 第73页 |
| ·主要试剂及配制 | 第73页 |
| ·引物设计及 PCR 扩增 | 第73-75页 |
| ·分析工具 | 第75页 |
| ·SSCP 分析 | 第75页 |
| ·PCR 产物的回收 | 第75-76页 |
| ·PCR 产物的克隆 | 第76-77页 |
| ·连接反应 | 第76-77页 |
| ·转化 | 第77页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第77页 |
| ·数据的统计分析 | 第77-78页 |
| ·群体基因频率、基因型频率的计算以及卡方检验 | 第77-78页 |
| ·遗传多样性参数 | 第78页 |
| ·统计分析模型和软件 | 第78-79页 |
| 2 结果与分析 | 第79-118页 |
| ·鸡基因组 DNA 和 PCR 产物结果 | 第79-81页 |
| ·基因组 DNA 提取结果 | 第79页 |
| ·SSCP 引物基因组DNA 的PCR 扩增 | 第79-81页 |
| ·Myostatin 基因 SSCP 检测及序列分析 | 第81-90页 |
| ·SSCP 检测 | 第81-85页 |
| ·序列分析结果 | 第85-90页 |
| ·转录因子结合位点的预测 | 第90-94页 |
| ·边鸡Myostatin 基因氨基酸序列分析 | 第94-95页 |
| ·边鸡Myostatin 蛋白的理化性质和功能域预测 | 第95-96页 |
| ·群体遗传学分析 | 第96-105页 |
| ·Myostatin 基因5′调控区群体遗传学分析 | 第96-102页 |
| ·Myostatin 基因外显子区的群体遗传学分析 | 第102-105页 |
| ·Myostatin 基因与生长和繁殖性状的关联分析 | 第105-115页 |
| ·Myostatin 基因与生长性状的关联分析 | 第105-111页 |
| ·Myostatin 5′调控区与生长性状的关联分析 | 第105-108页 |
| ·Myostatin 外显子区与生长性状的关联分析 | 第108-111页 |
| ·Myostatin 基因与繁殖性状的关联分析 | 第111-115页 |
| ·Myostatin 5′调控区与繁殖性状的关联分析 | 第111-113页 |
| ·Myostatin 外显子区与繁殖性状的关联分析 | 第113-115页 |
| ·Myostatin 基因不同位点间的互作效应 | 第115-118页 |
| ·Myostatin 基因不同位点对边鸡生长性状的互作效应 | 第115-116页 |
| ·Myostatin 基因不同位点对边鸡繁殖性状的互作效应 | 第116-118页 |
| 3 讨论 | 第118-131页 |
| ·4 个鸡品种 Myostatin 基因的群体遗传学分析 | 第118-119页 |
| ·Myostatin 基因转录因子结合位点的功能 | 第119-121页 |
| ·Myostatin 基因的多态性 | 第121-122页 |
| ·Myostatin 基因与生长性状的关联分析 | 第122-126页 |
| ·5′调控区与生长性状的关联分析 | 第122-124页 |
| ·外显子区与生长性状的关联分析 | 第124-126页 |
| ·Myostatin 基因与繁殖性状的相关性分析 | 第126-129页 |
| ·5′调控区与繁殖性状的相关性 | 第126页 |
| ·外显子区与繁殖性状的相关性 | 第126-129页 |
| ·Myostatin 基因不同位点对生长和繁殖性状的互作效应 | 第129-131页 |
| 第五章 Myostatin 基因表达的研究 | 第131-151页 |
| 1 材料与方法 | 第131-138页 |
| ·试验鸡群和样本采集 | 第131-133页 |
| ·主要试剂 | 第133页 |
| ·主要仪器设备 | 第133页 |
| ·分析工具软件 | 第133页 |
| ·实验方法 | 第133-136页 |
| ·主要试剂配制 | 第133页 |
| ·鸡组织总RNA 的提取和检测（Trizol 法） | 第133-134页 |
| ·引物设计和PCR 扩增 | 第134-135页 |
| ·反转录 | 第135页 |
| ·目的基因和内参基因的 PCR 扩增 | 第135-136页 |
| ·扩增片段的回收和克隆测序 | 第136页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第136页 |
| ·目的基因和内参基因标准曲线的绘制 | 第136页 |
| ·统计软件和方法 | 第136-138页 |
| 2 结果与分析 | 第138-146页 |
| ·RNA 的提取结果 | 第138页 |
| ·常规 PCR 及测序结果 | 第138-139页 |
| ·目的基因和内参基因的溶解曲线 | 第139-141页 |
| ·Myostatin 基因的扩增曲线 | 第141-142页 |
| ·目的基因和内参基因的标准曲线 | 第142-143页 |
| ·3 种基因型的表达水平相对定量分析 | 第143-145页 |
| ·3 种组织中 Myostatin 基因的表达水平分析 | 第145-146页 |
| 3 讨论 | 第146-151页 |
| ·内参基因的选择 | 第146-147页 |
| ·荧光定量 PCR 引物的设计 | 第147-148页 |
| ·Myostatin 基因的组织表达 | 第148-149页 |
| ·Myostatin 基因的表达与生产性状的关系 | 第149-151页 |
| 全文结论 | 第151-153页 |
| 创新之处 | 第153-154页 |
| 参考文献 | 第154-167页 |
| 致谢 | 第167-168页 |
| 攻读学位期间发表学术论文 | 第168页 |
