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猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其基因组测序分析

摘要第8-9页
英文摘要第9-10页
1 前言第11-19页
    1.1 PED流行病学特征第11-12页
    1.2 PEDV病原学特性第12-13页
        1.2.1 PEDV的分类及理化性质第12-13页
        1.2.2 PEDV体外培养特性第13页
    1.3 PEDV基因组结构特征第13-16页
        1.3.1 PEDV非编码区生物学功能第13-14页
        1.3.2 PEDV非结构蛋白生物学功能第14-15页
        1.3.3 PEDV结构蛋白生物学功能第15-16页
    1.4 PEDV的致病机理第16页
    1.5 PED临床症状与病理变化第16-17页
    1.6 PED的诊断与防治第17-18页
        1.6.1 PED的诊断第17页
        1.6.2 PED的防治第17-18页
    1.7 研究目的和意义第18-19页
2 材料与方法第19-29页
    2.1 实验材料第19-21页
        2.1.1 病料第19页
        2.1.2 细胞、毒株和菌株第19页
        2.1.3 主要实验试剂及培养基的配制第19-20页
        2.1.4 实验仪器设备第20-21页
        2.1.5 实验所用到的鉴定引物第21页
    2.2 实验方法第21-29页
        2.2.1 疑似病料的采集和处理第21-22页
        2.2.2 病理组织学切片制作与观察第22页
        2.2.3 病毒样品的RT-PCR鉴定第22-23页
        2.2.4 猪小肠上皮细胞(IPEC-J2)的病毒分离鉴定第23-24页
        2.2.5 PEDV HLJ株间接免疫荧光鉴定第24页
        2.2.6 PEDV HLJ株透射电镜观察第24页
        2.2.7 PEDV HLJ株毒力测定和生长曲线测定第24页
        2.2.8 PEDV HLJ株全基因组片段RT-PCR分段扩增第24-25页
        2.2.9 目的基因的克隆及序列测定第25-27页
        2.2.10 PEDV全基因组序列的生物信息学分析第27页
        2.2.11 PEDV HLJ株S蛋白的结构分析第27-28页
        2.2.12 数据统计第28-29页
3 结果第29-47页
    3.1 临床症状和病理组织学观察第29页
    3.2 疑似PEDV病料RT-PCR检测第29-30页
    3.3 PEDV的分离鉴定第30-33页
        3.3.1 细胞病变观察第30页
        3.3.2 细胞上清液RT-PCR鉴定第30-32页
        3.3.3 PEDV HLJ株的间接免疫荧光鉴定第32页
        3.3.4 PEDV HLJ株的电镜观察第32-33页
    3.4 PEDV HLJ株TCID_(50)的测定和生长曲线第33页
    3.5 PEDV HLJ株全基因组RT-PCR分段扩增第33-34页
    3.6 PEDV HLJ株各基因片段重组质粒PCR鉴定第34页
    3.7 PEDV HLJ株生物信息学分析第34-47页
        3.7.1 全基因组序列拼接第34-35页
        3.7.2 基因组结构分析第35-38页
        3.7.3 序列同源性分析第38-40页
        3.7.4 系统进化树分析第40-43页
        3.7.5 PEDV S蛋白结构分析第43-47页
4 讨论第47-50页
    4.1 PEDV HLJ株的分离鉴定第47页
    4.2 PEDV全基因组分段扩增第47-48页
    4.3 PEDV HLJ株生物信息学分析第48页
    4.4 PEDV S蛋白结构分析第48-50页
5 结论第50-51页
致谢第51-52页
参考文献第52-59页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第59页

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