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基于病毒—宿主互作转录组解析STAU2促禽流感病毒复制作用机理

摘要第6-7页
abstract第7页
英文缩略表第12-13页
第一章 引言第13-30页
    1.1 流感病毒的病原特性第13-16页
        1.1.1 流感病毒的结构第13-14页
        1.1.2 流感病毒的复制过程第14-15页
        1.1.3 流感病毒跨种传播第15-16页
    1.2 流感病毒的蛋白组成及功能第16-21页
        1.2.1 非结构蛋白NS第17-18页
        1.2.2 非结构蛋白NS第18页
        1.2.3 基质蛋白M第18-19页
        1.2.4 基质蛋白M第19页
        1.2.5 核蛋白NP第19-20页
        1.2.6 PB1 Frame2(PB1-F2)第20页
        1.2.7 聚合酶复合物(PA、PB1、PB2)第20-21页
    1.3 病原-宿主互作转录组研究第21-27页
        1.3.1 互作转录组第21-22页
        1.3.2 病原-宿主转录组研究进展第22-23页
        1.3.3 Dual RNA-seq的方法和应用第23-27页
    1.4 抗禽流感鸡的培育第27-28页
    1.5 本试验的目的与意义第28-29页
    1.6 技术路线第29-30页
第二章 禽流感病毒-鸡宿主互作转录组研究第30-64页
    2.1 试验材料与方法第30-34页
        2.1.1 试验材料第30页
        2.1.2 主要仪器和试验配置第30-31页
        2.1.3 试验方法第31-34页
    2.2 结果与分析第34-55页
        2.2.1 DF1 细胞攻毒后的表型状态第34页
        2.2.2 RNA提取及质量检测第34-35页
        2.2.3 互作转录组测序评估第35-38页
        2.2.4 病毒基因表达水平分析第38-39页
        2.2.5 禽流感病毒感染宿主基因表达水平分析第39-53页
        2.2.6 基因在不同组之间的基因集富集分析(GSEA)第53页
        2.2.7 禽流感病毒感染过程中表达显著差异的宿主互作基因第53-54页
        2.2.8 候选基因功能验证第54-55页
    2.3 讨论第55-62页
        2.3.1 禽流感病毒感染过程中的关键信号通路第55-58页
        2.3.2 宿主互作基因在病毒感染过程中的表达模式第58-62页
    2.4 本章结论第62-64页
第三章 STAU2 促进禽流感病毒复制研究第64-86页
    3.1 试验材料与方法第64-72页
        3.1.1 试验材料第64页
        3.1.2 主要仪器和试验配置第64-66页
        3.1.3 试验方法第66-72页
    3.2 结果与分析第72-82页
        3.2.1 NS1和STAU2 蛋白表达载体的构建第72页
        3.2.2 免疫共沉淀验证NS1与STAU2 存在相互作用第72-73页
        3.2.3 激光共聚焦验证NS1与STAU2 细胞共定位第73-74页
        3.2.4 STAU2 siRNA干扰效率检测第74-75页
        3.2.5 细胞活性检测第75-76页
        3.2.6 STAU2 促进H5N1 禽流感病毒的复制效率第76页
        3.2.7 STAU2 提高病毒感染后宿主细胞的免疫反应第76-77页
        3.2.8 STAU2 促进H5N1 禽流感病毒NS1 mRNA的出核第77-80页
        3.2.9 STAU2 抗细胞凋亡作用第80-81页
        3.2.10 不同鸡品种间STAU2 基因多态性分析第81-82页
    3.3 讨论第82-85页
        3.3.1 Staufen双链RNA结合蛋白家族影响多种病毒的复制第82-83页
        3.3.2 细胞凋亡与病毒复制的相互影响第83-84页
        3.3.3 STAU2 转运NS1 mRNA的作用机制第84-85页
    3.4 本章结论第85-86页
第四章 全文结论第86-87页
    4.1 全文结论第86页
    4.2 创新点第86-87页
参考文献第87-102页
附录第102-104页
致谢第104-105页
作者简历第105页

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