摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第1章 研究背景 | 第12-28页 |
1.1 长非编码RNA的研究背景 | 第12-19页 |
1.1.1 长非编码RNA的基本信息 | 第12-13页 |
1.1.2 长非编码RNA的分类 | 第13-14页 |
1.1.3 长非编码RNA的作用机制 | 第14-17页 |
1.1.4 长非编码RNA与肿瘤 | 第17-19页 |
1.2 原癌基因c-Myc的研究背景 | 第19-26页 |
1.2.1 c-Myc的转录功能 | 第20-21页 |
1.2.2 c-Myc与长非编码RNA | 第21-22页 |
1.2.3 c-Myc与细胞周期 | 第22-25页 |
1.2.4 c-Myc与肿瘤 | 第25-26页 |
1.3 CCND1基因的概述 | 第26-28页 |
第2章 实验材料与方法 | 第28-56页 |
2.1 实验材料 | 第28-37页 |
2.1.1 实验所用到的裸鼠 | 第28页 |
2.1.2 实验所用到的细胞 | 第28页 |
2.1.3 实验所用到的抗体 | 第28页 |
2.1.4 实验所用到的试剂以及试剂盒 | 第28-29页 |
2.1.5 实验所用到的质粒信息 | 第29-30页 |
2.1.6 实验所用到的引物信息 | 第30-37页 |
2.2 实验方法 | 第37-56页 |
2.2.1 PCR(聚合酶链式反应) | 第37页 |
2.2.2 PCR片段以及载体的酶切 | 第37-38页 |
2.2.3 从琼脂糖凝胶中回收DNA片段以及酶切的载体 | 第38-39页 |
2.2.4 目的片段与载体的连接 | 第39页 |
2.2.5 质粒或连接产物的转化 | 第39-40页 |
2.2.6 从大肠杆菌中提取质粒 | 第40-42页 |
2.2.7 细胞的保种、复苏、培养以及传代 | 第42-43页 |
2.2.8 质粒的转染 | 第43页 |
2.2.9 病毒的包装 | 第43-44页 |
2.2.10 基因敲低细胞以及过表达细胞的构建 | 第44页 |
2.2.11 细胞总RNA的提取 | 第44页 |
2.2.12 RNA的逆转录 | 第44-45页 |
2.2.13 实时荧光定量PCR (Real-time RT-PCR) | 第45页 |
2.2.14 蛋白质免疫印迹实验(Western blotting) | 第45-47页 |
2.2.15 体外RNA的合成 | 第47页 |
2.2.16 Northern blot实验 | 第47-49页 |
2.2.17 细胞RNA荧光原位杂交(FISH)实验 | 第49-50页 |
2.2.18 RIP实验以及RIP sequencing | 第50-51页 |
2.2.19 Biotin pulldown 实验 | 第51页 |
2.2.20 EMSA实验 | 第51-52页 |
2.2.21 双荧光素酶报告系统 | 第52-53页 |
2.2.22 细胞核质分离实验 | 第53页 |
2.2.23 染色体免疫共沉淀实验(CHIP) | 第53-54页 |
2.2.24 裸鼠皮下成瘤实验 | 第54页 |
2.2.25 流式测细胞周期 | 第54-55页 |
2.2.26 克隆形成实验 | 第55页 |
2.2.27 数据处理与分析 | 第55-56页 |
第3章 实验结果与分析 | 第56-90页 |
3.1 LAST的发现 | 第56-58页 |
3.2 LAST的大小、定位和在细胞中的拷贝数 | 第58-60页 |
3.3 c-Myc正调控LAST | 第60-61页 |
3.4 c-Myc通过转录调控LAST | 第61-63页 |
3.5 LAST促进细胞周期的运转 | 第63-64页 |
3.6 LAST上调CCND1 mRNA水平 | 第64-66页 |
3.7 LAST不影响邻近基因的表达 | 第66页 |
3.8 LAST增强CCND1 mRNA的稳定性 | 第66-68页 |
3.9 LAST和CNBP蛋白共同影响CCND1 mRNA稳定性 | 第68-72页 |
3.10 LAST和CNBP结合在CCND1 mRNA的5'UTR区域 | 第72-75页 |
3.11 CNBP结合LAST和CCND1 mRNA 5'UTR的Grich motifs | 第75-78页 |
3.12 LAST调控其他基因mRNA的稳定性 | 第78-81页 |
3.13 LAST促进肿瘤的生长 | 第81-90页 |
第4章 讨论 | 第90-94页 |
参考文献 | 第94-106页 |
附录1 CNBP RIP seq与LAST mRNA seq交集基因 | 第106-112页 |
附录2 TCGA肿瘤样本中CCND1和LAST的相关性 | 第112-114页 |
致谢 | 第114-116页 |
在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第116页 |