| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 中英文缩略词表(Abbreviation) | 第12-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-25页 |
| 1.1 MC4R研究进展 | 第14-18页 |
| 1.1.1 MC4R表达部位和蛋白结构 | 第14-15页 |
| 1.1.2 MC4R的拮抗剂和激动剂 | 第15页 |
| 1.1.3 MC4R细胞内信号通路 | 第15-17页 |
| 1.1.4 MC4R的功能 | 第17-18页 |
| 1.2 MC4R与温度适应性的关系 | 第18-21页 |
| 1.2.1 BAT的脂肪分解产热活动 | 第18页 |
| 1.2.2 MC4R系统对BAT脂肪分解产热活动的影响 | 第18-19页 |
| 1.2.3 MC4R系统调控BAT脂肪分解的通路 | 第19页 |
| 1.2.4 MC4R系统可能调控米色脂肪组织的脂肪分解代谢活动 | 第19-20页 |
| 1.2.5 BAT产热对哺乳动物温度适应能力的影响 | 第20-21页 |
| 1.2.6 MC4R可能对动物温度适应能力的影响 | 第21页 |
| 1.3 SNP与蛋白结构和功能的关系 | 第21-22页 |
| 1.4 SNP与生物对环境的适应性 | 第22-23页 |
| 1.5 分子进化研究进展 | 第23-24页 |
| 1.5.1 物种间分子进化分析 | 第23页 |
| 1.5.2 物种内分子进化分析 | 第23-24页 |
| 1.6 目的与意义 | 第24页 |
| 1.7 技术路线 | 第24-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1 进化分析所用物种序列 | 第25页 |
| 2.1.2 绵羊山羊血液样品采集 | 第25-26页 |
| 2.2 实验仪器及试剂 | 第26-28页 |
| 2.2.1 主要试剂 | 第26-27页 |
| 2.2.2 主要仪器 | 第27页 |
| 2.2.3 缓冲液的配置 | 第27-28页 |
| 2.3 实验方法 | 第28-29页 |
| 2.3.1 血样DNA的提取及质量检测 | 第28页 |
| 2.3.2 测序及分型 | 第28-29页 |
| 2.4 数据分析 | 第29-33页 |
| 2.4.1 等位基因频率计算、哈代温伯格平衡检验及连锁不平衡检验 | 第29页 |
| 2.4.2 温度数据收集处理 | 第29-30页 |
| 2.4.3 卡方检验 | 第30页 |
| 2.4.4 群体遗传距离 | 第30页 |
| 2.4.5 Mantel检验 | 第30-31页 |
| 2.4.6 蛋白三维结构预测分析 | 第31页 |
| 2.4.7 氨基酸保守性分析 | 第31页 |
| 2.4.8 密码子偏好性分析 | 第31页 |
| 2.4.9 分子进化分析 | 第31-33页 |
| 2.4.9.1 种间进化树构建 | 第31-32页 |
| 2.4.9.2 种间分子进化分析 | 第32页 |
| 2.4.9.3 种内分子进化分析 | 第32-33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-54页 |
| 3.1 绵羊MC4R基因变异情况及分析 | 第33-42页 |
| 3.1.1 SNP分布 | 第33页 |
| 3.1.2 等位基因频率及哈代温伯格平衡检验 | 第33-34页 |
| 3.1.3 卡方检验 | 第34-35页 |
| 3.1.4 连锁不平衡分析 | 第35-36页 |
| 3.1.5 群体遗传学分析 | 第36-39页 |
| 3.1.5.1 群体遗传距离 | 第36-37页 |
| 3.1.5.2 群体结构 | 第37页 |
| 3.1.5.3 群体杂合度 | 第37-39页 |
| 3.1.6 突变效应分析 | 第39-42页 |
| 3.1.6.1 密码子偏好性分析 | 第39页 |
| 3.1.6.2 MC4R蛋白二维及三维结构 | 第39-41页 |
| 3.1.6.3 MC4R蛋白氨基酸保守性预测分析 | 第41-42页 |
| 3.2 选择压力分析 | 第42-45页 |
| 3.2.1 群体间Fst逃逸分析 | 第42页 |
| 3.2.2 进化树构建 | 第42-43页 |
| 3.2.3 选择检验 | 第43-45页 |
| 3.3 宜昌白山羊MC4R基因变异情况及分析 | 第45-54页 |
| 3.3.1 SNP分布 | 第45页 |
| 3.3.2 等位基因频率及哈代温伯格平衡检验 | 第45-46页 |
| 3.3.3 连锁不平衡分析 | 第46-47页 |
| 3.3.4 群体遗传学分析 | 第47页 |
| 3.3.5 突变效应分析 | 第47-49页 |
| 3.3.5.1 密码子偏好性分析 | 第47-48页 |
| 3.3.5.2 MC4R蛋白二维及三维结构 | 第48-49页 |
| 3.3.5.3 MC4R蛋白氨基酸保守性预测分析 | 第49页 |
| 3.3.6 绵羊和山羊MC4R基因和蛋白比对 | 第49-54页 |
| 3.3.6.1 绵羊和山羊MC4R基因序列差异 | 第49页 |
| 3.3.6.2 绵羊和山羊MC4R蛋白三维结构比对 | 第49-53页 |
| 3.3.6.3 绵羊和山羊MC4R基因突变比对 | 第53-54页 |
| 4 讨论 | 第54-61页 |
| 4.1 MC4R基因影响绵羊的气温适应性 | 第54页 |
| 4.2 绵羊MC4R基因突变影响蛋白功能可能的机制 | 第54-55页 |
| 4.3 迁徙对绵羊群体间遗传距离的影响 | 第55-56页 |
| 4.4 纯化选择维持物种间MC4R结构和功能的保守性 | 第56-57页 |
| 4.5 绵羊群体间MC4R基因受到中性选择的原因 | 第57-58页 |
| 4.5.1 强烈的纯化选择清扫掉纯化选择位点 | 第57页 |
| 4.5.2 家养改善绵羊生活条件 | 第57-58页 |
| 4.5.3 迁徙改善了绵羊群体生活气温环境 | 第58页 |
| 4.6 严峻的全球气温变暖对生物的影响 | 第58-60页 |
| 4.7 检测到的SNP在动物育种中的应用 | 第60-61页 |
| 5 结语 | 第61-62页 |
| 5.1 结论 | 第61页 |
| 5.2 进一步研究计划 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-76页 |
| 附录Ⅰ在读期间发表的论文情况 | 第76-77页 |
| 附表 | 第77-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
