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棉花线粒体atp1基因RNA编辑与纤维生长发育关系的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
英文缩略语表第11-12页
第一章 文献综述第12-32页
    1.1 棉花基本概况第12-17页
        1.1.1 棉花纤维的生长发育第12-15页
        1.1.2 棉花基因组学研究第15-17页
    1.2 高等植物线粒体第17-25页
        1.2.1 线粒体的形态结构第18-19页
        1.2.2 高等植物线粒体基因组结构及特征第19-21页
        1.2.3 线粒体ATP合酶的结构第21-22页
        1.2.4 高等植物线粒体基因表达调控第22-25页
    1.3 RNA编辑第25-31页
        1.3.1 高等植物中RNA编辑的特点第26-27页
        1.3.2 高等植物RNA编辑的生物学功能第27-29页
        1.3.3 RNA编辑的分子机制第29-31页
    1.4 本课题的研究目的和意义第31-32页
第二章 棉花线粒体RNA编辑位点的测定及分析第32-58页
    2.1 实验材料第32页
        2.1.1 植物材料第32页
        2.1.2 菌种及质粒第32页
    2.2 试剂及仪器第32-33页
        2.2.1 主要试剂第32-33页
        2.2.2 实验仪器第33页
    2.3 实验方法第33-40页
        2.3.1 棉花DNA提取第33-34页
        2.3.2 棉花RNA提取第34页
        2.3.3 cDNA模板的合成第34-36页
        2.3.4 棉花线粒体RNA编辑位点分析第36-40页
    2.4 结果与分析第40-58页
        2.4.1 RNA检测及线粒体转录组测序实验流程第40-41页
        2.4.2 RNA编辑位点分析及U-C类编辑的验证第41-42页
        2.4.3 棉花线粒体RNA编辑特征分析第42-45页
        2.4.4 棉花野生型和突变体线粒体差异编辑位点的分析第45-48页
        2.4.5 Ghatp1的RNA编辑事件对蛋白结构的影响第48-50页
        2.4.6 Ghatp1的RNA编辑位点相关编辑因子的分析第50-55页
        2.4.7 Ghatp1的RNA编辑在纤维发育过程中的功能分析第55-58页
第三章 棉花纤维发育与能量之间的关系第58-68页
    3.1 实验材料第58页
    3.2 试剂及仪器第58页
    3.3 实验方法第58-62页
        3.3.1 组织ATP、ADP提取第58页
        3.3.2 HPLC分析ATP、ADP含量第58-59页
        3.3.3 组织线粒体的提取第59页
        3.3.4 蛋白浓度测定第59-60页
        3.3.5 线粒体ATP合酶活性测定第60-61页
        3.3.6 棉花胚珠体外培养第61-62页
        3.3.7 QRT-PCR分析基因表达量第62页
    3.4 结果与分析第62-68页
        3.4.1 不同纤维发育时期ATP合酶活性分析第62-64页
        3.4.2 棉花不同发育时期纤维ATP合酶基因表达分析第64-66页
        3.4.3 外源ATP对棉花纤维细胞伸长的影响第66-68页
第四章 Ghatp1基因RNA编辑的生物学功能分析第68-88页
    4.1 实验材料第68页
    4.2 试剂及仪器第68页
    4.3 实验方法第68-78页
        4.3.1 酵母表达载体构建第68-69页
        4.3.2 不同位点突变的酵母表达载体构建第69-70页
        4.3.3 酵母感受态细胞制备及转化第70-71页
        4.3.4 酵母菌spotting点板法第71页
        4.3.5 酵母菌生长曲线测定第71页
        4.3.6 酵母菌线粒体提取第71-72页
        4.3.7 酵母菌扫描电镜观察第72页
        4.3.8 蛋白原核表达及纯化第72-74页
        4.3.9 体外蛋白结合实验(Pull-down)第74页
        4.3.10 SDS-PAGE电泳第74-76页
        4.3.11 Western blot实验第76-78页
    4.4 结果与分析第78-88页
        4.4.1 Ghatp1的RNA编辑在酵母中的功能分析第78-80页
        4.4.2 Ghatp1的RNA编辑影响α与β亚基的互作第80-85页
        4.4.3 ATP合酶α亚基与β亚基的互作影响ATP产生第85-88页
第五章 Ghatp1基因RNA编辑影响拟南芥表皮毛和根的发育第88-100页
    5.1 实验材料第88页
    5.2 试剂及仪器第88页
    5.3 实验方法第88-92页
        5.3.1 拟南芥原生质体制备及荧光观测第88-90页
        5.3.2 BN-PAGE分离线粒体复合物第90-92页
    5.4 结果与分析第92-100页
        5.4.1 Mito-TP-GhAtp1融合蛋白亚细胞定位检测第92-94页
        5.4.2 GhAtp1拟南芥过表达表型观测及ATP酶活测定第94-97页
        5.4.3 ATP对拟南芥表皮毛及根伸长的影响第97-100页
第六章 讨论第100-104页
    6.1 棉花线粒体基因组中存在大量的RNA编辑位点第100-101页
    6.2 C1292和C1415位的编辑在高等植物中非常保守第101页
    6.3 C1292和C1415位的编辑影响ATP合酶α亚基与β亚基的互作第101-102页
    6.4 ATP合酶产生的能量对细胞的生长非常重要第102-104页
第七章 结论第104-106页
参考文献第106-134页
附录第134-152页
致谢第152-154页
攻读学位期间的研究成果第154页

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