摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-7页 |
英文缩略语表 | 第11-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-32页 |
1.1 棉花基本概况 | 第12-17页 |
1.1.1 棉花纤维的生长发育 | 第12-15页 |
1.1.2 棉花基因组学研究 | 第15-17页 |
1.2 高等植物线粒体 | 第17-25页 |
1.2.1 线粒体的形态结构 | 第18-19页 |
1.2.2 高等植物线粒体基因组结构及特征 | 第19-21页 |
1.2.3 线粒体ATP合酶的结构 | 第21-22页 |
1.2.4 高等植物线粒体基因表达调控 | 第22-25页 |
1.3 RNA编辑 | 第25-31页 |
1.3.1 高等植物中RNA编辑的特点 | 第26-27页 |
1.3.2 高等植物RNA编辑的生物学功能 | 第27-29页 |
1.3.3 RNA编辑的分子机制 | 第29-31页 |
1.4 本课题的研究目的和意义 | 第31-32页 |
第二章 棉花线粒体RNA编辑位点的测定及分析 | 第32-58页 |
2.1 实验材料 | 第32页 |
2.1.1 植物材料 | 第32页 |
2.1.2 菌种及质粒 | 第32页 |
2.2 试剂及仪器 | 第32-33页 |
2.2.1 主要试剂 | 第32-33页 |
2.2.2 实验仪器 | 第33页 |
2.3 实验方法 | 第33-40页 |
2.3.1 棉花DNA提取 | 第33-34页 |
2.3.2 棉花RNA提取 | 第34页 |
2.3.3 cDNA模板的合成 | 第34-36页 |
2.3.4 棉花线粒体RNA编辑位点分析 | 第36-40页 |
2.4 结果与分析 | 第40-58页 |
2.4.1 RNA检测及线粒体转录组测序实验流程 | 第40-41页 |
2.4.2 RNA编辑位点分析及U-C类编辑的验证 | 第41-42页 |
2.4.3 棉花线粒体RNA编辑特征分析 | 第42-45页 |
2.4.4 棉花野生型和突变体线粒体差异编辑位点的分析 | 第45-48页 |
2.4.5 Ghatp1的RNA编辑事件对蛋白结构的影响 | 第48-50页 |
2.4.6 Ghatp1的RNA编辑位点相关编辑因子的分析 | 第50-55页 |
2.4.7 Ghatp1的RNA编辑在纤维发育过程中的功能分析 | 第55-58页 |
第三章 棉花纤维发育与能量之间的关系 | 第58-68页 |
3.1 实验材料 | 第58页 |
3.2 试剂及仪器 | 第58页 |
3.3 实验方法 | 第58-62页 |
3.3.1 组织ATP、ADP提取 | 第58页 |
3.3.2 HPLC分析ATP、ADP含量 | 第58-59页 |
3.3.3 组织线粒体的提取 | 第59页 |
3.3.4 蛋白浓度测定 | 第59-60页 |
3.3.5 线粒体ATP合酶活性测定 | 第60-61页 |
3.3.6 棉花胚珠体外培养 | 第61-62页 |
3.3.7 QRT-PCR分析基因表达量 | 第62页 |
3.4 结果与分析 | 第62-68页 |
3.4.1 不同纤维发育时期ATP合酶活性分析 | 第62-64页 |
3.4.2 棉花不同发育时期纤维ATP合酶基因表达分析 | 第64-66页 |
3.4.3 外源ATP对棉花纤维细胞伸长的影响 | 第66-68页 |
第四章 Ghatp1基因RNA编辑的生物学功能分析 | 第68-88页 |
4.1 实验材料 | 第68页 |
4.2 试剂及仪器 | 第68页 |
4.3 实验方法 | 第68-78页 |
4.3.1 酵母表达载体构建 | 第68-69页 |
4.3.2 不同位点突变的酵母表达载体构建 | 第69-70页 |
4.3.3 酵母感受态细胞制备及转化 | 第70-71页 |
4.3.4 酵母菌spotting点板法 | 第71页 |
4.3.5 酵母菌生长曲线测定 | 第71页 |
4.3.6 酵母菌线粒体提取 | 第71-72页 |
4.3.7 酵母菌扫描电镜观察 | 第72页 |
4.3.8 蛋白原核表达及纯化 | 第72-74页 |
4.3.9 体外蛋白结合实验(Pull-down) | 第74页 |
4.3.10 SDS-PAGE电泳 | 第74-76页 |
4.3.11 Western blot实验 | 第76-78页 |
4.4 结果与分析 | 第78-88页 |
4.4.1 Ghatp1的RNA编辑在酵母中的功能分析 | 第78-80页 |
4.4.2 Ghatp1的RNA编辑影响α与β亚基的互作 | 第80-85页 |
4.4.3 ATP合酶α亚基与β亚基的互作影响ATP产生 | 第85-88页 |
第五章 Ghatp1基因RNA编辑影响拟南芥表皮毛和根的发育 | 第88-100页 |
5.1 实验材料 | 第88页 |
5.2 试剂及仪器 | 第88页 |
5.3 实验方法 | 第88-92页 |
5.3.1 拟南芥原生质体制备及荧光观测 | 第88-90页 |
5.3.2 BN-PAGE分离线粒体复合物 | 第90-92页 |
5.4 结果与分析 | 第92-100页 |
5.4.1 Mito-TP-GhAtp1融合蛋白亚细胞定位检测 | 第92-94页 |
5.4.2 GhAtp1拟南芥过表达表型观测及ATP酶活测定 | 第94-97页 |
5.4.3 ATP对拟南芥表皮毛及根伸长的影响 | 第97-100页 |
第六章 讨论 | 第100-104页 |
6.1 棉花线粒体基因组中存在大量的RNA编辑位点 | 第100-101页 |
6.2 C1292和C1415位的编辑在高等植物中非常保守 | 第101页 |
6.3 C1292和C1415位的编辑影响ATP合酶α亚基与β亚基的互作 | 第101-102页 |
6.4 ATP合酶产生的能量对细胞的生长非常重要 | 第102-104页 |
第七章 结论 | 第104-106页 |
参考文献 | 第106-134页 |
附录 | 第134-152页 |
致谢 | 第152-154页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第154页 |