| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-15页 |
| 1.1 生物信息学 | 第11页 |
| 1.2 基因数据的发展 | 第11-12页 |
| 1.3 生物信息学上关于基因组学的研究 | 第12-13页 |
| 1.4 本文的研究内容和研究意义 | 第13-14页 |
| 1.5 本文结构安排 | 第14-15页 |
| 第二章 基因组GC含量与碱基、密码子和氨基酸使用偏好的关系 | 第15-34页 |
| 2.1 背景 | 第15-18页 |
| 2.1.1 基因组GC含量 | 第15-16页 |
| 2.1.2 碱基、密码子、氨基酸使用偏好 | 第16-17页 |
| 2.1.3 国内外研究现状 | 第17-18页 |
| 2.2 材料和方法 | 第18-23页 |
| 2.2.1 数据来源 | 第18页 |
| 2.2.2 计算工具 | 第18-19页 |
| 2.2.3 计算步骤 | 第19-21页 |
| 2.2.4 数据处理方法 | 第21-23页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第23-33页 |
| 2.3.1 基因组GC含量分布 | 第23-24页 |
| 2.3.2 基于碱基、密码子和氨基酸距离的热图 | 第24-27页 |
| 2.3.3 基因组GC含量差值和碱基、密码子和氨基酸距离的关系 | 第27-30页 |
| 2.3.4 基因组GC含量和碱基、密码子和氨基酸频率的关系 | 第30-33页 |
| 2.4 本章小结 | 第33-34页 |
| 第三章 基因组GC含量影响力的分析 | 第34-56页 |
| 3.1 背景 | 第34-36页 |
| 3.1.1 基因组GC含量和基因组长度 | 第34-35页 |
| 3.1.2 基因组GC含量影响力的强度和作用途径 | 第35-36页 |
| 3.2 材料和方法 | 第36-40页 |
| 3.2.1 数据来源 | 第36页 |
| 3.2.2 计算工具 | 第36页 |
| 3.2.3 计算步骤 | 第36-38页 |
| 3.2.4 数据处理方法 | 第38-40页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第40-55页 |
| 3.3.1 基因组GC含量和基因组长度的关系 | 第40-45页 |
| 3.3.2 门和基因组GC含量影响力的比较 | 第45-52页 |
| 3.3.3 基因组GC含量和tRN A基因使用频率的关系 | 第52-55页 |
| 3.4 本章小结 | 第55-56页 |
| 第四章 数据提取小工具 | 第56-59页 |
| 4.1 开发背景 | 第56页 |
| 4.2 程序设计 | 第56-59页 |
| 第五章 工作总结和展望 | 第59-61页 |
| 5.1 总结 | 第59-60页 |
| 5.2 展望 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-66页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第66-67页 |
