| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 前言 | 第14-29页 |
| 1.南太平洋环流区特点 | 第14-15页 |
| 2 国际综合大洋钻探计划 | 第15-16页 |
| 3 原核生物分类鉴定的研究进展 | 第16-18页 |
| 4 新菌的分类鉴定 | 第18-25页 |
| 4.1 遗传学分类鉴定 | 第21-23页 |
| 4.1.1 16S rRNA 基因序列分析 | 第22页 |
| 4.1.2 DNA-DNA 杂交（DNA-DNA Hybridization） | 第22页 |
| 4.1.3 DNA G+C 含量的测定 | 第22-23页 |
| 4.1.4 多位点序列分析 | 第23页 |
| 4.2 表型特征 | 第23-25页 |
| 4.2.1 形态学与生理生化特征 | 第23-24页 |
| 4.2.2 化学特征 | 第24-25页 |
| 5 原核生物分类技术的发展 | 第25-26页 |
| 5.1 表型检测技术的进步 | 第25页 |
| 5.2 基因组测序 | 第25-26页 |
| 6 海洋微生物资源的应用前景 | 第26-27页 |
| 7 本论文研究的目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 海洋细菌新种-太平洋海洋杆菌（Oceanobacillus pacificus sp. nov.）的分类鉴定 | 第29-51页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第29-31页 |
| 1.1 菌株 | 第29-30页 |
| 1.2 主要仪器 | 第30页 |
| 1.3 试剂及培养基 | 第30-31页 |
| 2. 实验方法 | 第31-41页 |
| 2.1 样品采集及处理 | 第31页 |
| 2.1.1 样品的采集 | 第31页 |
| 2.1.2 样品的处理 | 第31页 |
| 2.2 遗传学特征的分类鉴定 | 第31-34页 |
| 2.2.1 实验菌株 16S rDNA 克隆测序及系统进化树的构建 | 第31-33页 |
| 2.2.2 实验菌株的 DNA G+C 含量测定 | 第33-34页 |
| 2.3 表型特征的分类鉴定 | 第34-41页 |
| 2.3.1 形态学特征鉴定 | 第34-35页 |
| 2.3.2 生理生化特征鉴定 | 第35-38页 |
| 2.3.3 API 鉴定系统 | 第38-39页 |
| 2.3.4 化学分类特征鉴定 | 第39-41页 |
| 3. 实验结果及分析 | 第41-46页 |
| 3.1 遗传学特征的分类鉴定结果 | 第41-43页 |
| 3.1.1 XH204~T 16S rDNA 测序结果及系统发生树的构建 | 第41-42页 |
| 3.1.2 XH204~T DNA G+C 含量的测定 | 第42-43页 |
| 3.2 表型特征的分类鉴定结果 | 第43-46页 |
| 3.2.1 XH204~T形态学特征鉴定结果 | 第43页 |
| 3.2.2 XH204~T生理生化特征鉴定结果 | 第43-44页 |
| 3.2.3 化学分类特征 | 第44-46页 |
| 4. 讨论与应用 | 第46-50页 |
| 4.1 讨论 | 第46-49页 |
| 4.2 应用 | 第49-50页 |
| 4.2.1 脂肪酸的应用 | 第49页 |
| 4.2.2 碱性胞外酶的应用 | 第49-50页 |
| 5 小结 | 第50-51页 |
| 第三章 海洋细菌新种- 太平洋海藻杆菌 Algibacter pacificus sp.nov.的分类鉴定 | 第51-67页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第52页 |
| 1.1 菌株 | 第52页 |
| 1.2 主要仪器 | 第52页 |
| 1.3 实验试剂及培养基 | 第52页 |
| 2. 实验方法 | 第52-53页 |
| 2.1 菌株的分离、纯化及保藏 | 第52页 |
| 2.1.1 样品的采集 | 第52页 |
| 2.1.2 样品的处理 | 第52页 |
| 2.2 遗传学特征的分类鉴定 | 第52-53页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第53页 |
| 3. 实验结果 | 第53-62页 |
| 3.1 遗传学特征 | 第53-56页 |
| 3.1.1 SW096~T和 XH116 的 16S rDNA 测序结果、分析及系统进化树的构建 | 第53-55页 |
| 3.1.2 DNA G+C mol%含量的测定 | 第55-56页 |
| 3.2 表型特征 | 第56-62页 |
| 3.2.1 菌株 SW096~T、XH116 形态学特征鉴定结果 | 第56-57页 |
| 3.2.2 SW096~T和 XH116 的生理生化特征鉴定结果 | 第57-58页 |
| 3.2.3 化学分类特征 | 第58-62页 |
| 4 讨论 | 第62-66页 |
| 4.1 讨论 | 第62-64页 |
| 4.2 应用 | 第64-66页 |
| 4.2.1 色素的应用 | 第64-65页 |
| 4.2.2 几丁质酶的应用 | 第65-66页 |
| 5 小结 | 第66-67页 |
| 第四章 海洋细菌新种-太平洋弓形杆菌（Arcobacter pacificus sp. nov.）及海洋弓形杆菌（Arcobacter aquimaris sp.nov.）的分类鉴定 | 第67-81页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第68页 |
| 1.1 菌株 | 第68页 |
| 1.2 主要仪器 | 第68页 |
| 1.3 试剂及培养基 | 第68页 |
| 2. 实验方法 | 第68-69页 |
| 2.1 菌株的分离、纯化及保藏 | 第68页 |
| 2.2 遗传学特征的分类鉴定 | 第68页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第68-69页 |
| 3. 实验结果 | 第69-76页 |
| 3.1 遗传学特征 | 第69-70页 |
| 3.1.1 SW026~T和 SW028~T 16S rDNA 测序及系统进化树的构建 | 第69-70页 |
| 3.1.2 实验菌株的 DNA G+C mol%含量 | 第70页 |
| 3.2 表型特征 | 第70-76页 |
| 3.2.1 菌落形态及菌体形态 | 第70-71页 |
| 3.2.2 生理生化特征 | 第71-75页 |
| 3.2.3 化学分类特征 | 第75-76页 |
| 4. 讨论与应用 | 第76-79页 |
| 4.1 讨论 | 第76-79页 |
| 4.2 应用 | 第79页 |
| 5 小结 | 第79-81页 |
| 总结 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-92页 |
| 附录 溶液配方 | 第92-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 个人简历 | 第94页 |
| 发表的或正在撰写的学术论文 | 第94-95页 |
