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Pseudomonas mediterranea G-229-21T铁载体相关基因purL的克隆及功能分析

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
1 引言第13-51页
   ·铁的生理机能和铁的生物有效性第13页
   ·微生物铁载体的种类与结构第13-16页
   ·微生物铁载体的作用第16-21页
     ·微生物铁载体与植物的作用第16-18页
     ·铁载体的抗癌、抗病毒、抗氧化作用第18-19页
     ·类酚氧化酶活性第19-20页
     ·环境修复第20-21页
   ·微生物铁载体的合成过程第21-23页
   ·假单胞菌铁载体第23-25页
   ·微生物铁载体相关基因研究现状第25-37页
     ·Enterobactin 的合成及相关基因第26-27页
     ·Pyoverdine 的合成及相关基因第27-29页
     ·Pyochelin 的合成及相关基因第29-32页
     ·Vibriobactin 的合成及相关基因第32-34页
     ·Anguibactin 的合成及相关基因第34-35页
     ·Yersiniabactin 的合成及相关基因第35-37页
   ·微生物从铁载体获取铁的机制第37-40页
   ·转座子诱变法基因克隆第40-46页
     ·细菌转座子的插入机制和随机诱变作用第41-43页
     ·转座子标签技术第43-46页
   ·PurL 基因第46-49页
   ·立题依据、研究内容及技术路线第49-51页
     ·立题依据第49页
     ·研究内容第49-50页
     ·技术路线第50-51页
2. 材料与方法第51-68页
   ·菌株与质粒第51页
   ·培养基与培养液第51页
   ·实验试剂及仪器第51-54页
     ·铁载体检测(CAS 法)试剂第51-52页
     ·DNA 提取试剂第52页
     ·碱裂解法小量提取质粒试剂第52-53页
     ·CaC12 法制备新鲜的DH5α感受态细胞试剂第53页
     ·PCR 试剂第53页
     ·琼脂糖凝胶电泳试剂第53页
     ·实验仪器第53-54页
   ·实验方法第54-68页
     ·抗生素固体培养基的制备第54页
     ·铁载体定性检测第54-55页
     ·基因组DNA 的提取第55页
     ·PCR 引物第55-57页
     ·琼脂糖凝胶电泳第57页
     ·PCR 产物的纯化第57页
     ·DNA 凝胶回收第57-58页
     ·DNA 浓度的确定第58页
     ·碱裂解法小量提取质粒第58-59页
     ·CaC1_2 法制备新鲜的DH5α感受态细胞第59页
     ·突变株的筛选第59-62页
       ·抗药性实验第59-60页
       ·转座子诱变第60页
       ·铁载体合成能力变化突变株的复筛第60页
       ·种特异性引物PCR 验证第60-61页
       ·LuxA PCR 验证第61-62页
     ·PCR 产物与载体连接第62页
     ·克隆中插入片断的验证第62-64页
       ·质粒大小快速检测第62-63页
       ·酶切验证插入片断的大小第63页
       ·菌落PCR 验证插入片断的大小第63-64页
     ·TAIL-PCR 引物的设计第64-66页
       ·特异性引物的设计第64-65页
       ·随机兼并引物的设计第65-66页
     ·TAIL-PCR 反应体系的设计第66页
     ·TAIL-PCR 反应条件的设计第66-67页
     ·转座子Tn5-1063a 右侧翼及左侧翼序列的获得第67页
     ·启动子区的寻找第67-68页
     ·系统发育分析第68页
3 结果与分析第68-83页
   ·G-229-21T 铁载体产生能力检测第68页
   ·G-229-21TA 铁载体产生能力缺失检测第68-69页
   ·菌株基因组提取第69页
   ·特异性引物扩增验证第69-70页
   ·luxA PCR 扩增和测序验证第70-71页
   ·转座子Tn5-1063a 右侧翼序列的获得第71-72页
   ·转座子Tn5-1063a 左侧翼序列的获得第72-74页
   ·PurL 基因全序列的克隆第74-78页
     ·特异性扩增引物的设计第74页
     ·特异性扩增第74-77页
     ·ORF 分析第77页
     ·PurL 基因系统发育分析第77-78页
   ·启动子区的寻找第78-83页
     ·TAIL-PCR 扩增上游第78-79页
     ·获得66106p 片段第79-83页
4. 讨论第83-85页
   ·PurL 基因第83-84页
   ·PurL 基因与铁载体合成或运输过程的关系第84-85页
5 结论第85-87页
   ·结论第85页
   ·尚待完成的工作第85-87页
参考文献第87-105页
致谢第105-106页
攻读学位期间发表论文情况第106页

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