| 中文摘要 | 第4-7页 |
| 英文摘要 | 第7-10页 |
| 第一章 基于基因表达数据筛选神经干细胞促分化作用化合物的研究 | 第15-73页 |
| 一、前言 | 第15-27页 |
| (一)干细胞的分类 | 第15-18页 |
| 1.胚胎干细胞 | 第15页 |
| 2.成体干细胞 | 第15-18页 |
| (二)神经干细胞研究进展 | 第18-22页 |
| 1.神经干细胞的分布 | 第18页 |
| 2.神经干细胞的分化与分化调控 | 第18-20页 |
| 3．NSCs 的临床应用 | 第20-22页 |
| (三)高通量测序技术研究进展 | 第22-25页 |
| 1.高通量测序技术概况 | 第22-23页 |
| 2.Illumina测序技术方法简介 | 第23-25页 |
| (四)基于基因-药物数据库的药物筛选 | 第25-26页 |
| 1.药物的虚拟筛选 | 第25-26页 |
| 2.药物基因组学数据库 | 第26页 |
| (五)本研究的目的与意义 | 第26-27页 |
| 二、材料和方法 | 第27-41页 |
| (一)实验材料 | 第27-30页 |
| 1．细胞株 | 第27页 |
| 2.实验仪器 | 第27-28页 |
| 3.实验试剂 | 第28-29页 |
| 4．测序数据分析软件及数据库 | 第29-30页 |
| (二)实验方法 | 第30-41页 |
| 1.MSCs的分离培养和NSCs诱导分化 | 第30-31页 |
| 2.转录组测序 | 第31-37页 |
| 3.转录组测序数据分析 | 第37页 |
| 4.干预化合物选择 | 第37-38页 |
| 5.NSCs培养和诱导分化 | 第38-39页 |
| 6.Real-TimePCR检测诱导后基因表达 | 第39-40页 |
| 7.统计学分析 | 第40-41页 |
| 三、实验结果 | 第41-64页 |
| (一)MSCs分离培养及NSCs细胞实验 | 第41-42页 |
| 1.MSCs细胞培养 | 第41页 |
| 2.MSCs诱导分化为NSCs | 第41-42页 |
| (二)流式细胞仪分析MSCs和NSCs表面抗原结果 | 第42-43页 |
| (三)荧光显微镜观察 NSCs | 第43页 |
| (四)MSCs和NSCs转录组测序 | 第43-59页 |
| 1.MSCs和NSCs的总RNA提取和鉴定 | 第43-44页 |
| 2.转录组测序质控分析 | 第44-45页 |
| 3.MSCs和NSCs转录组基因表达差异分析 | 第45-57页 |
| 4.MSCs和NSCs转录组KEGG聚类分析 | 第57-58页 |
| 5.MSCs和NSCs转录组GO聚类分析 | 第58-59页 |
| 6.MSCs和NSCs表达差异基因蛋白质网络作用分析 | 第59页 |
| (五)促NSCs分化作用的药物筛选及验证实验 | 第59-64页 |
| 1.促NSCs分化作用的药物筛选 | 第59-60页 |
| 2.促NSCs分化作用的药物确定 | 第60-61页 |
| 3.药物干预NSCs培养结果 | 第61-62页 |
| 4.Real-TimePCR检测NSCs特异性基因表达 | 第62-64页 |
| 四、讨论 | 第64-72页 |
| (一)MSCs分化研究 | 第64-65页 |
| (二)转录组测序在MSCs分化研究中的应用 | 第65-70页 |
| 1.数据处理及生物信息分析 | 第65-67页 |
| 2.差异表达基因功能聚类分析 | 第67-70页 |
| (三)利用转录组数据分析筛选和验证靶向化合物 | 第70-72页 |
| 五、结论 | 第72-73页 |
| 第二章 基于基因表达数据筛选抑制Dami细胞增殖化合物的研究 | 第73-116页 |
| 一、前言 | 第73-80页 |
| (一)白血病的发病原因 | 第73页 |
| (二)白血病学流行病学研究 | 第73-74页 |
| (三)白血病的分类 | 第74-76页 |
| 1.急性髓性白血病 | 第74-75页 |
| 2.急性巨核细胞白血病 | 第75-76页 |
| (四)白血病的治疗 | 第76-79页 |
| 1.化学药物治疗 | 第76-78页 |
| 2.生物治疗 | 第78-79页 |
| （五）本研究意义 | 第79-80页 |
| 二、材料和方法 | 第80-92页 |
| (一)实验材料 | 第80-83页 |
| 1.细胞株 | 第80页 |
| 2.实验仪器 | 第80-81页 |
| 3.实验试剂 | 第81-82页 |
| 4.测序数据分析软件及数据库 | 第82-83页 |
| (二)实验方法 | 第83-92页 |
| 1.Dami细胞株培养和BMSCs分离培养 | 第83页 |
| 2.测定细胞的活力 | 第83页 |
| 3.检测细胞增殖 | 第83页 |
| 4.流式细胞仪检测细胞周期 | 第83-84页 |
| 5.氨磷汀药物干预Dami细胞细胞前后转录组测序 | 第84-90页 |
| 6.转录组测序数据分析 | 第90页 |
| 7.Real-TimePCR检测干预前后基因表达改变 | 第90-91页 |
| 8.统计学分析 | 第91页 |
| 9.药物靶向通路蛋白相互作用分析 | 第91-92页 |
| 三、实验结果 | 第92-109页 |
| (一)基因-药物匹配结果 | 第92-93页 |
| (二)Dami细胞株培养和BMSCs分离培养 | 第93页 |
| (三)氨磷汀干预细胞增殖实验 | 第93-95页 |
| 1.氨磷汀对Dami细胞增殖影响 | 第93-94页 |
| 2.氨磷汀对BMSCs细增殖的影响 | 第94-95页 |
| (四)氨磷汀干预Dami细胞和BMSCs凋亡结果 | 第95-96页 |
| 1.氨磷汀对Dami细胞凋亡影响 | 第95-96页 |
| 2.氨磷汀对BMSCs凋亡的影响 | 第96页 |
| (五)氨磷汀干预Dami细胞周期结果 | 第96-97页 |
| (六)氨磷汀干预前后 Dami 细胞转录组测序结果 | 第97-108页 |
| 1.总RNA提取和质检 | 第97页 |
| 2.转录组测序质控和分析 | 第97-98页 |
| 3.差异表达基因KEGG聚类分析 | 第98-107页 |
| 4.差异表达基因GO聚类分析 | 第107-108页 |
| (七)氨磷汀调控Dami细胞富集通路相关基因表达实验 | 第108-109页 |
| (八)氨磷汀干预Dami细胞内蛋白相互作用 | 第109页 |
| 四、讨论 | 第109-115页 |
| (一)干预药物筛选 | 第109-110页 |
| (二)实验证实药物对Dami细胞增殖有抑制作用 | 第110-111页 |
| (三)药物作用的基因调控通路 | 第111-115页 |
| 1.甾类激素生物合成信号通路的调控作用 | 第112-113页 |
| 2.造血细胞系统信号通路的调控作用 | 第113-114页 |
| 3.肌动蛋白细胞骨架调节信号通路的调控作用 | 第114页 |
| 4.细胞凋亡信号通路的调控作用 | 第114-115页 |
| (四)蛋白质相互作用网络 | 第115页 |
| 五、结论 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-129页 |
| 附录 | 第129-264页 |
| 1.英文缩写表 | 第129-131页 |
| 2.MSCs分化为NSCs表达下调基因表 | 第131-178页 |
| 3.MSCs分化为NSCs表达上调基因表 | 第178-231页 |
| 4.氨磷汀干预Dima细胞表达下调基因表 | 第231-239页 |
| 5.氨磷汀干预Dima细胞表达上调基因表 | 第239-264页 |
| 致谢 | 第264-265页 |
| 作者简介 | 第265-266页 |
| 在学校期间公开发表论文及著作情况 | 第266页 |
