| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 背景介绍 | 第12-18页 |
| 1.1 盐胁迫对棉花植株生长的影响 | 第12页 |
| 1.2 棉花耐盐性及其机理 | 第12-15页 |
| 1.2.1 棉花耐盐性 | 第12-13页 |
| 1.2.2 棉花耐盐机理 | 第13-14页 |
| 1.2.3 植物盐胁迫的应答和信号转导途径 | 第14-15页 |
| 1.3 棉花耐盐生理生化指标 | 第15-16页 |
| 1.3.1 游离脯氨酸含量与抗逆性的关系 | 第15页 |
| 1.3.2 超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化氢酶（POD）活性与抗逆性的关系 | 第15页 |
| 1.3.3 可溶性糖含量与抗逆性的关系 | 第15页 |
| 1.3.4 可溶性蛋白含量与抗逆性的关系 | 第15-16页 |
| 1.4 转录组学现状 | 第16-18页 |
| 1.4.1 转录组学研究简介 | 第16页 |
| 1.4.2 转录组学手段 | 第16-18页 |
| 第二章 毛棉幼苗盐胁迫下生理生化指标分析 | 第18-28页 |
| 2.1 实验材料 | 第18页 |
| 2.2 实验材料种植处理和实验方法 | 第18页 |
| 2.3 生理表型的结果和分析 | 第18-25页 |
| 2.3.1 游离脯氨酸含量变化 | 第18-20页 |
| 2.3.2 超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化氢酶（POD）活性变化 | 第20-22页 |
| 2.3.3 可溶性糖含量变化 | 第22-24页 |
| 2.3.4 可溶性蛋白含量变化 | 第24-25页 |
| 2.3.5 毛棉水培生理表型结果 | 第25页 |
| 2.4 讨论 | 第25-28页 |
| 2.4.1 盐胁迫对游离脯氨酸含量的影响 | 第25-26页 |
| 2.4.2 盐胁迫对超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化氢酶（POD）活性的影响 | 第26页 |
| 2.4.3 盐胁迫对可溶性糖含量的影响 | 第26页 |
| 2.4.4 盐胁迫对可溶性蛋白含量的影响 | 第26-28页 |
| 第三章 毛棉幼苗盐胁迫下的表达谱分析 | 第28-50页 |
| 3.1 实验材料 | 第28页 |
| 3.2 实验方法 | 第28-34页 |
| 3.2.1 实验材料的处理 | 第28页 |
| 3.2.2 RNA的提取 | 第28-30页 |
| 3.2.3 反转录cDNA | 第30页 |
| 3.2.4 实时荧光定量PCR（qRT-PCR） | 第30-31页 |
| 3.2.5 测序结果 | 第31页 |
| 3.2.6 测序数据的分析 | 第31-34页 |
| 3.3 棉花幼苗的表达谱分析与结果 | 第34-44页 |
| 3.3.1 RNA的提取 | 第34页 |
| 3.3.2 测序产出数据质量评估 | 第34-35页 |
| 3.3.3 数据拼接 | 第35-36页 |
| 3.3.4 基因注释 | 第36页 |
| 3.3.5 GO分类 | 第36-37页 |
| 3.3.6 KEGG分类 | 第37页 |
| 3.3.7 差异表达基因的分析 | 第37-41页 |
| 3.3.8 转录因子富集情况 | 第41-43页 |
| 3.3.9 激素信号通路 | 第43-44页 |
| 3.4 利用qRT-PCR对测序结果进行验证 | 第44-47页 |
| 3.5 讨论 | 第47-50页 |
| 3.5.1 差异基因响应抗盐 | 第47-48页 |
| 3.5.2 利用qRT-PCR进行基因筛选 | 第48-50页 |
| 第四章 全文讨论和结论 | 第50-54页 |
| 4.1 讨论 | 第50-52页 |
| 4.1.1 生理生化指标判定毛棉耐盐性 | 第50页 |
| 4.1.2 测序结果与差异基因分析 | 第50-51页 |
| 4.1.3 潜在抗盐基因的挖掘 | 第51-52页 |
| 4.2 结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录 | 第58-60页 |
