| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词表 | 第13-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-23页 |
| 1.1 研究目的和意义 | 第14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-22页 |
| 1.2.1 沙门氏菌耐药的相关研究 | 第14-15页 |
| 1.2.2 其它食源性病原菌耐药的相关研究 | 第15-18页 |
| 1.2.3 多黏菌素耐药的相关研究 | 第18-20页 |
| 1.2.4 食源性致病菌检测方法的相关研究 | 第20页 |
| 1.2.5 基因芯片应用的相关研究 | 第20-22页 |
| 1.3 研究内容和方法 | 第22-23页 |
| 第二章 畜禽源和人源沙门氏菌耐药性调查研究 | 第23-37页 |
| 2.1 前言 | 第23页 |
| 2.2 材料与方法 | 第23-26页 |
| 2.2.1 材料 | 第23-24页 |
| 2.2.2 方法 | 第24-26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-34页 |
| 2.3.1 沙门氏菌鉴定结果 | 第26页 |
| 2.3.2 畜禽源和人源沙门氏菌的耐药率 | 第26-28页 |
| 2.3.3 畜禽源和人源沙门氏菌的多重耐药 | 第28-29页 |
| 2.3.4 畜禽源和人源沙门氏菌的耐药谱 | 第29-30页 |
| 2.3.5 畜禽源和人源沙门氏菌mcr-1基因检出情况 | 第30-31页 |
| 2.3.6 携带mcr-1基因沙门氏菌的血清型 | 第31页 |
| 2.3.7 携带mcr-1基因沙门氏菌的耐药特征 | 第31-34页 |
| 2.4 讨论 | 第34-36页 |
| 2.4.1 动物源和人源沙门氏菌的耐药特征 | 第34页 |
| 2.4.2 沙门氏菌对多黏菌素的耐药 | 第34-35页 |
| 2.4.3 携带mcr-1基因沙门氏菌的流行和耐药特征 | 第35-36页 |
| 2.5 小结 | 第36-37页 |
| 第三章 沙门氏菌mcr-1基因的传播机制研究 | 第37-67页 |
| 3.1 前言 | 第37页 |
| 3.2 材料与方法 | 第37-46页 |
| 3.2.1 材料 | 第37-39页 |
| 3.2.2 方法 | 第39-46页 |
| 3.3 结果与分析 | 第46-63页 |
| 3.3.1 携带mcr-1基因沙门氏菌的MLST分型 | 第46-48页 |
| 3.3.2 携带mcr-1基因沙门氏菌的PFGE分型 | 第48-50页 |
| 3.3.3 携带mcr-1基因沙门氏菌的SNPs进化树分析 | 第50-52页 |
| 3.3.4 携带mcr-1基因沙门氏菌的质粒定位分析 | 第52-53页 |
| 3.3.5 沙门氏菌携带mcr-1基因质粒的接合转移 | 第53-55页 |
| 3.3.6 mcr-1基因的分子遗传环境分析 | 第55-61页 |
| 3.3.7 多黏菌素耐药相关双组分系统靶基因的突变 | 第61-63页 |
| 3.4 讨论 | 第63-66页 |
| 3.4.1 携带mcr-1基因的质粒特点 | 第63-64页 |
| 3.4.2 mcr-1基因的分子遗传环境特征 | 第64页 |
| 3.4.3 携带mcr-1基因沙门氏菌的分子遗传特征 | 第64-65页 |
| 3.4.4 沙门氏菌双组分系统相关靶基因的突变 | 第65-66页 |
| 3.5 小结 | 第66-67页 |
| 第四章 食源性耐药致病菌检测基因芯片研究 | 第67-109页 |
| 4.1 前言 | 第67页 |
| 4.2 材料与方法 | 第67-76页 |
| 4.2.1 材料 | 第67-70页 |
| 4.2.2 方法 | 第70-76页 |
| 4.3 结果与分析 | 第76-105页 |
| 4.3.1 基因芯片的布局和设计 | 第76-77页 |
| 4.3.2 样品DNA的PCR处理结果 | 第77-79页 |
| 4.3.3 多重PCR基因芯片检测方法的建立与特异性 | 第79-81页 |
| 4.3.4 随机引物PCR基因芯片检测方法的建立与特异性 | 第81-97页 |
| 4.3.5 多重PCR基因芯片灵敏度 | 第97-100页 |
| 4.3.6 随机引物PCR基因芯片灵敏度 | 第100-101页 |
| 4.3.7 随机引物PCR与多重PCR基因芯片检测结果的对比 | 第101-103页 |
| 4.3.8 随机引物PCR基因芯片对临床菌株的检测结果及验证 | 第103-105页 |
| 4.4 讨论 | 第105-108页 |
| 4.4.1 基因芯片探针的选择和设计 | 第105-106页 |
| 4.4.2 基因芯片DNA处理方法的选择 | 第106-107页 |
| 4.4.3 基因芯片检测技术优势和不足 | 第107-108页 |
| 4.5 小结 | 第108-109页 |
| 第五章 结论 | 第109-110页 |
| 创新点 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-120页 |
| 附录 | 第120-134页 |
| 致谢 | 第134-136页 |
| 作者简介 | 第136页 |
