| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 主要符号对照表 | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-24页 |
| 1.1 辣椒轻斑驳病毒 | 第11-18页 |
| 1.1.1 辣椒轻斑驳病毒的发生及危害 | 第11页 |
| 1.1.2 辣椒轻斑驳病毒的寄主范围 | 第11-12页 |
| 1.1.3 辣椒轻斑驳病毒的传播途径 | 第12页 |
| 1.1.4 辣椒轻斑驳病毒的寄主症状 | 第12页 |
| 1.1.5 辣椒轻斑驳病毒侵染寄主植物引起生理变化 | 第12-13页 |
| 1.1.6 辣椒轻斑驳病毒的基因组结构 | 第13-15页 |
| 1.1.7 辣椒轻斑驳病毒基因组各蛋白功能的研究 | 第15-16页 |
| 1.1.7.1 126 KDa/183 KDa基因功能 | 第15页 |
| 1.1.7.2 CP基因功能 | 第15-16页 |
| 1.1.7.3 MP基因功能 | 第16页 |
| 1.1.8 辣椒轻斑驳病毒致病性的分类情况 | 第16-17页 |
| 1.1.9 辣椒轻斑驳病毒相关病毒的进化关系 | 第17-18页 |
| 1.2 辣椒轻斑驳病毒检测和鉴定技术 | 第18-21页 |
| 1.2.1 生物学测定方法 | 第18页 |
| 1.2.2 电子显微镜检测技术 | 第18-19页 |
| 1.2.3 免疫学检测方法 | 第19-20页 |
| 1.2.4 分子生物学检测方法 | 第20-21页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第21-22页 |
| 1.4 研究内容及技术路线 | 第22-24页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第22-23页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 辣椒轻斑驳病毒分子检测 | 第24-33页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-25页 |
| 2.1.1 材料 | 第24-25页 |
| 2.1.1.1 供试病毒样品 | 第24-25页 |
| 2.1.1.2 生化及分子生物学试剂 | 第25页 |
| 2.1.1.3 主要仪器 | 第25页 |
| 2.2 方法 | 第25-28页 |
| 2.2.1 引物序列设计与合成 | 第25-26页 |
| 2.2.2 病毒总RNA的提取 | 第26页 |
| 2.2.3 cDNA合成 | 第26页 |
| 2.2.4 RT-PCR检测 | 第26-27页 |
| 2.2.5 序列测定及分析 | 第27-28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-31页 |
| 2.3.1 田间病株症状 | 第28页 |
| 2.3.2 烟草花叶病毒属病毒检测 | 第28-29页 |
| 2.3.2.1 Tobamovirus简并引物检测辣椒病株 | 第28-29页 |
| 2.3.2.2 TMV检测 | 第29页 |
| 2.3.3 序列测定及分析 | 第29页 |
| 2.3.3.1 烟草花叶病毒病的序列分析 | 第29页 |
| 2.3.4 PMMoV | 第29-31页 |
| 2.3.4.1 PMMoV的检测 | 第29页 |
| 2.3.4.2 PMMoV引物PCR产物序列同源性分析 | 第29-31页 |
| 2.4 小结与讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 辣椒轻斑驳分离物基因组克隆与结构特征分析 | 第33-48页 |
| 3.1 材料与方法 | 第33-38页 |
| 3.1.1 材料 | 第33-34页 |
| 3.1.1.1 供试样品及保存 | 第33页 |
| 3.1.1.2 菌株和质粒 | 第33页 |
| 3.1.1.3 生化及分子生物学试剂 | 第33-34页 |
| 3.1.1.4 主要仪器 | 第34页 |
| 3.1.2 方法 | 第34-38页 |
| 3.1.2.1 引物设计与合成 | 第34页 |
| 3.1.2.2 病毒总RNA的提取 | 第34页 |
| 3.1.2.3 cDNA合成 | 第34-35页 |
| 3.1.2.4 PCR扩增 | 第35页 |
| 3.1.2.5 割胶回收目的片段 | 第35-36页 |
| 3.1.2.6 纯化DNA连接克隆载体pMD-18T | 第36页 |
| 3.1.2.7 重组质粒转化大肠杆菌 | 第36页 |
| 3.1.2.8 用PCR技术鉴定阳性克隆 | 第36-37页 |
| 3.1.2.9 重组质粒的提取 | 第37页 |
| 3.1.2.10 阳性克隆的酶切验证 | 第37-38页 |
| 3.2 结果与分析 | 第38-46页 |
| 3.2.1 PMMoV全基因组克隆策略 | 第38页 |
| 3.2.2 PMMoV全基因组PCR扩增 | 第38页 |
| 3.2.3 酶切验证阳性克隆 | 第38-39页 |
| 3.2.4 PMMoV全基因序列测定及结构分析 | 第39-40页 |
| 3.2.4.1 PMMoV全基因组结构分析 | 第39-40页 |
| 3.2.5 同源性及聚类进化分析 | 第40-43页 |
| 3.2.6 PMMoV蛋白聚类进化分析 | 第43-46页 |
| 3.2.6.1 基于 126KDa/183KDa蛋白进化分析 | 第43-44页 |
| 3.2.6.2 基于蛋白CP进化分析 | 第44-45页 |
| 3.2.6.3 基于蛋白MP进化分析 | 第45-46页 |
| 3.2.6.4 PMMoV的CP氨基酸的突变分析 | 第46页 |
| 3.3 小结与讨论 | 第46-48页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第48-51页 |
| 4.1 结论 | 第48页 |
| 4.2 讨论 | 第48-51页 |
| 参考文献 | 第51-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 附录A 青海BYDV-GAV青稞分离物基因组克隆及结构特征分析 | 第57-68页 |
| 附录B PMMoV-Qh108-5 和PMMoV-Js615-2 基因组 | 第68-76页 |
| 作者简介 | 第76页 |
