| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 前言 | 第9-10页 |
| 第一部分 文献综述 | 第10-16页 |
| 1 肠道微生物 | 第10-11页 |
| 1.1 肠道微生物的概况 | 第10页 |
| 1.2 肠道共生菌的作用 | 第10-11页 |
| 1.2.1 对宿主免疫的作用 | 第10-11页 |
| 1.2.2 对宿主代谢的作用 | 第11页 |
| 1.3 影响肠道菌群组成的因素 | 第11页 |
| 2 肠道微生物的研究方法 | 第11-13页 |
| 2.2 传统分子生物技术 | 第12页 |
| 2.2.1 构建基因文库测序技术 | 第12页 |
| 2.2.2 全基因组鸟枪测序技术 | 第12页 |
| 2.3 遗传指纹图谱技术 | 第12页 |
| 2.4 高通量测序技术 | 第12-13页 |
| 3 重金属的生物活性 | 第13-15页 |
| 3.1 铜 | 第13-14页 |
| 3.2 汞 | 第14-15页 |
| 3.3 铅 | 第15页 |
| 4 研究目的与意义 | 第15-16页 |
| 第二部分 实验部分 | 第16-41页 |
| 实验一 盲肠病理组织学观察 | 第16-20页 |
| 1 材料与方法 | 第16-17页 |
| 1.1 实验动物 | 第16页 |
| 1.2 实验仪器 | 第16页 |
| 1.3 主要实验试剂 | 第16-17页 |
| 1.4 实验设计 | 第17页 |
| 1.5 组织石蜡包埋切片实验步骤 | 第17页 |
| 1.6 数据处理 | 第17页 |
| 2 结果与分析 | 第17-18页 |
| 3 讨论 | 第18-20页 |
| 实验二 基于高通量测序研究鸡盲肠菌群的组成及多样性 | 第20-41页 |
| 1 材料与方法 | 第20-22页 |
| 1.1 实验动物 | 第20页 |
| 1.2 实验设计 | 第20页 |
| 1.3 实验设备 | 第20页 |
| 1.4 主要试剂 | 第20页 |
| 1.5 实验方法 | 第20-21页 |
| 1.5.1 基因组DNA的提取和PCR扩增 | 第20-21页 |
| 1.6 数据分析 | 第21-22页 |
| 1.6.1 OTU分析 | 第21页 |
| 1.6.2 Alpha多样性分析 | 第21-22页 |
| 1.6.3 Beta多样性分析 | 第22页 |
| 2 结果与分析 | 第22-36页 |
| 2.1 16S rRNA V4区基因PCR扩增结果 | 第22页 |
| 2.2 高通量测序结果 | 第22-36页 |
| 2.2.1 序列数结果 | 第22页 |
| 2.2.2 肠道菌群结构组成 | 第22-24页 |
| 2.2.3 Alpha Diversity多样性分析 | 第24-26页 |
| 2.2.4 不同处理组盲肠菌群的统计学分析及生物标志物 | 第26-29页 |
| 2.2.5 基于门水平，不同处理组对鸡盲肠微生物的影响 | 第29-32页 |
| 2.2.6 基于属水平，不同处理组对鸡盲肠微生物的影响 | 第32-36页 |
| 3 讨论 | 第36-41页 |
| 3.1 盲肠物种注释分析 | 第36-37页 |
| 3.2 铜对盲肠微生物的影响 | 第37-38页 |
| 3.3 汞对盲肠微生物的影响 | 第38-39页 |
| 3.4 铅对盲肠微生物的影响 | 第39-41页 |
| 第三部分 全文总结 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-48页 |
| 致谢 | 第48页 |
