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绵羊FecB突变高通量分型技术的建立及巴美肉羊多羔候选基因的筛选

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第11-38页
    1.1 巴美肉羊概况第11-13页
        1.1.1 巴美肉羊的由来和发展历程第11页
        1.1.2 巴美肉羊的产区和分布第11-12页
        1.1.3 巴美肉羊的品种特性第12页
        1.1.4 巴美肉羊的繁殖性能第12页
        1.1.5 以巴美肉羊为父本开展经济杂交的育肥效果第12-13页
        1.1.6 巴美肉羊的的育种模式第13页
    1.2 绵羊多羔主效基因第13-19页
        1.2.1 绵羊BMPR1B基因的发现和定位第14页
        1.2.2 绵羊BMPR1B基因结构和蛋白结构第14-15页
        1.2.3 绵羊BMPR1B表达研究第15页
        1.2.4 绵羊BMPR1B基因对高繁殖力的影响第15-17页
        1.2.5 绵羊BMPR1B影响高繁殖力的效应机制研究第17-18页
        1.2.6 FecB突变检测的研究进展第18-19页
    1.3 全基因组测序的发展第19-26页
        1.3.1 全基因组测序在畜禽中的应用第20-26页
    1.4 家养动物选择信号研究进展第26-37页
        1.4.1 选择信号种类第27页
        1.4.2 选择信号的检测方法第27-31页
        1.4.3 家养动物选择信号研究第31-36页
        1.4.4 家养动物选择信号应考虑的关键问题第36-37页
    1.5 本研究总体目标第37-38页
第二章 绵羊多羔主效基因FecB突变的高通量分型技术的建立及应用第38-51页
    1 前言第38页
    2 实验材料第38-40页
        2.1 试验样本第38-40页
        2.2 主要仪器和试剂第40页
    3 实验方法第40-42页
        3.1 引物设计第40-41页
        3.2 RFLP和SSCP检测第41页
        3.3 Taqman探针法:第41页
        3.4 SNaPshot第41-42页
        3.5 数据分析第42页
    4 结果第42-48页
        4.1 FecB分型方法比较第42-43页
        4.2 FecB分型结果第43-44页
            4.2.1 SNaPshot检测第43-44页
            4.2.2 Taqman探针法检测第44页
        4.3 FecB高通量分型方法的应用第44-46页
        4.4 FecB突变在中国地方绵羊品种中的分布第46-47页
        4.5 FecB突变在培育品种和杂交群体中分布情况第47页
        4.6 巴美肉羊品种FecB基因突变检测第47-48页
    5 讨论第48-51页
第三章 巴美肉羊重测序第51-58页
    1 前言第51页
    2 试验材料第51页
    3 试验方法第51-55页
        3.1 文库的构建第51-52页
        3.2 上机测序第52-53页
        3.3 质控过滤(QC)第53页
        3.4 序列比对第53页
        3.5 SNP calling第53-54页
        3.6 数据统计第54页
        3.7 SNP和indel统计第54页
        3.8 测序原始数据质控第54-55页
    4 结果第55-57页
        4.1 羊血液基因组DNA提取第55-56页
        4.2 巴美肉羊重测序分析第56-57页
    5 讨论第57-58页
第四章 巴美肉羊多羔基因挖掘第58-66页
    1 前言第58页
    2 材料与方法第58-59页
        2.1 数据来源第58页
        2.2 研究方法第58-59页
    3 结果第59-64页
        3.1 巴美肉羊多羔相关的选择信号第59-62页
        3.2 系统发生谱分析第62-63页
        3.3 选择区域候选基因的GO富集第63页
        3.4 功能位点分析第63-64页
    4 讨论第64-66页
全文结论第66-67页
参考文献第67-77页
致谢第77-78页
博士、博士后期间发表和待发表论文第78-79页
个人简介第79页

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