基于组学数据的阿尔兹海默症染色体区段研究和细胞重编程研究
| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第8-11页 |
| 1. 绪论 | 第11-31页 |
| 1.1 阿尔兹海默症病理及阶段 | 第11-13页 |
| 1.2 阿尔兹海默症组学相关研究 | 第13-15页 |
| 1.3 诱导性多能干细胞相关因子 | 第15-22页 |
| 1.4 诱导性多能干细胞的转化策略 | 第22-28页 |
| 1.5 诱导性多能干细胞在阿尔兹海默症上的应用 | 第28-31页 |
| 2. 阿尔兹海默症19号染色体区段的研究 | 第31-41页 |
| 2.1 研究背景 | 第31-32页 |
| 2.2 数据与方法 | 第32-33页 |
| 2.2.1 脑部转录组数据的收集 | 第32页 |
| 2.2.2 预处理和差异分析 | 第32-33页 |
| 2.2.3 染色体区段富集 | 第33页 |
| 2.3 结果 | 第33-39页 |
| 2.3.1 Chr19p基因在AD大脑中的变化 | 第33-34页 |
| 2.3.2 著性扰动基因的相关信号通路 | 第34-36页 |
| 2.3.3 疾病各阶段的显著性扰动基因 | 第36-38页 |
| 2.3.4 基因组与转录组的相关性 | 第38页 |
| 2.3.5 数据集的独立验证 | 第38-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-41页 |
| 3. 细胞重编程因子的初步研究 | 第41-57页 |
| 3.1 研究背景 | 第41-42页 |
| 3.2 数据与方法 | 第42-47页 |
| 3.2.1 数据的整理和收集 | 第42-43页 |
| 3.2.2 mRNA表达分析 | 第43-44页 |
| 3.2.3 miRNA表达分析 | 第44页 |
| 3.2.4 甲基化芯片分析 | 第44-45页 |
| 3.2.5 差异基因的获取 | 第45页 |
| 3.2.6 数据集之间的整合 | 第45-46页 |
| 3.2.7 基因间的关联 | 第46页 |
| 3.2.8 miRNA和基因间的调控 | 第46-47页 |
| 3.3 结果 | 第47-55页 |
| 3.3.1 多能性状态比较中差异基因的整合 | 第47-48页 |
| 3.3.2 基因的功能注释 | 第48页 |
| 3.3.3 交集基因的表达趋势 | 第48-49页 |
| 3.3.4 交集基因的分类效果 | 第49-50页 |
| 3.3.5 多能性相关基因间的关联 | 第50-51页 |
| 3.3.6 重编程中甲基化的变化 | 第51-53页 |
| 3.3.7 miRNA在重编程中的表现 | 第53页 |
| 3.3.8 PPI相关的分析 | 第53-54页 |
| 3.3.9 蛋白质与DNA的相互作用 | 第54页 |
| 3.3.10 DNA与DNA的相互作用 | 第54页 |
| 3.3.11 数据间的整合 | 第54-55页 |
| 3.4 讨论 | 第55-57页 |
| 4. 结论 | 第57-59页 |
| 附录 | 第59-77页 |
| 参考文献 | 第77-91页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第91页 |
