| 中文摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第1章 文献综述 | 第17-45页 |
| 1.1 植物冷害机理的研究进展 | 第17-32页 |
| 1.1.1 低温冷害的类型及其对玉米的影响 | 第17-18页 |
| 1.1.2 植物低温信号转导途径 | 第18-22页 |
| 1.1.3 植物抗冷相关基因 | 第22-29页 |
| 1.1.4 植物抗冷生理研究 | 第29-32页 |
| 1.2 植物microRNA的研究进展 | 第32-42页 |
| 1.2.1 植物microRNA的生物合成 | 第32-37页 |
| 1.2.2 植物microRNA的作用机制 | 第37-39页 |
| 1.2.3 玉米microRNA的研究 | 第39-42页 |
| 1.2.4 植物microRNA的研究方法 | 第42页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第42-45页 |
| 第2章 玉米自交系的形态学、细胞学及生理生化特征比较分析 | 第45-65页 |
| 2.1 材料与方法 | 第45-49页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第45页 |
| 2.1.2 试验试剂 | 第45页 |
| 2.1.3 试验仪器 | 第45-46页 |
| 2.1.4 溶液配制 | 第46页 |
| 2.1.5 试验方法 | 第46-49页 |
| 2.2 结果与分析 | 第49-61页 |
| 2.2.1 形态学对比分析 | 第49-52页 |
| 2.2.2 超微结构对比分析 | 第52-56页 |
| 2.2.3 生理生化指标测定 | 第56-57页 |
| 2.2.4 脂肪酸含量比较 | 第57-58页 |
| 2.2.5 ABA (脱落酸) 含量分析 | 第58-59页 |
| 2.2.6 一氧化氮含量分析 | 第59页 |
| 2.2.7 冷胁迫条件下生理相关基因的表达情况分析 | 第59-61页 |
| 2.3 讨论 | 第61-64页 |
| 2.3.1 细胞、形态与玉米抗冷性分析 | 第61页 |
| 2.3.2 生理生化指标与玉米抗冷性分析 | 第61-63页 |
| 2.3.3 植物内源信号分子与玉米抗冷性分析 | 第63-64页 |
| 2.4 结论 | 第64-65页 |
| 第3章 冷胁迫下两个玉米自交系的miRNA表达谱比较分析 | 第65-97页 |
| 3.1 材料与方法 | 第65-70页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第65页 |
| 3.1.2 试剂配制 | 第65-66页 |
| 3.1.3 试验方法 | 第66-70页 |
| 3.2 结果与分析 | 第70-91页 |
| 3.2.1 RNA质量检测 | 第70-72页 |
| 3.2.2 测序数据质量控制及产出 | 第72-73页 |
| 3.2.3 small RNA分类注释 | 第73-75页 |
| 3.2.4 miRNA鉴定、预测及保守性分析 | 第75-80页 |
| 3.2.5 miRNA表达量分析 | 第80-82页 |
| 3.2.6 miRNA差异表达分析 | 第82-86页 |
| 3.2.7 miRNA靶基因预测及注释 | 第86-88页 |
| 3.2.8 差异表达miRNA靶基因GO分析 | 第88-91页 |
| 3.3 讨论 | 第91-95页 |
| 3.3.1 测序质量控制及miRNA鉴定标准 | 第91-92页 |
| 3.3.2 冷处理后下调表达的miRNA | 第92-93页 |
| 3.3.3 冷处理后上调表达的miRNA | 第93-95页 |
| 3.3.4 预测的miRNA靶基因参与的代谢调控过程 | 第95页 |
| 3.4 结论 | 第95-97页 |
| 第4章 miRNA靶基因降解组测序及RACE验证 | 第97-113页 |
| 4.1 材料与方法 | 第97-101页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第97-98页 |
| 4.1.2 RNA文库构建及测序 | 第98页 |
| 4.1.3 生物信息学分析 | 第98页 |
| 4.1.4 5’ RLM-RACE | 第98-101页 |
| 4.2 结果与分析 | 第101-110页 |
| 4.2.1 RNA质量检测 | 第101-102页 |
| 4.2.2 测序结果统计 | 第102页 |
| 4.2.3 非编码RNA注释 | 第102-107页 |
| 4.2.4 降解位点检测 | 第107-109页 |
| 4.2.5 降解产物的RLM-RACE验证 | 第109-110页 |
| 4.3 讨论 | 第110-111页 |
| 4.4 结论 | 第111-113页 |
| 第5章 冷处理差异表达miRNA及其靶基因的验证分析 | 第113-133页 |
| 5.1 材料与方法 | 第113-123页 |
| 5.1.1 miRNA的qRT-PCR | 第113-115页 |
| 5.1.2 靶基因的qRT-PCR | 第115-116页 |
| 5.1.3 Northern blot | 第116-123页 |
| 5.2 结果与分析 | 第123-128页 |
| 5.2.1 冷处理条件下miRNA的Northern blot分析 | 第123-125页 |
| 5.2.2 冷处理条件下miRNA及其靶基因表达情况qRT-PCR分析 | 第125-128页 |
| 5.3 讨论 | 第128-131页 |
| 5.3.1 冷胁迫上调表达miRNA及其靶基因功能 | 第128-129页 |
| 5.3.2 冷胁迫下调表达miRNA及其靶基因功能 | 第129页 |
| 5.3.3 冷胁迫下部分miRNA在不同自交系中表达模式可能存在差异 | 第129-131页 |
| 5.4 结论 | 第131-133页 |
| 第6章 玉米miRNA转化拟南芥的功能分析 | 第133-153页 |
| 6.1 材料与方法 | 第133-144页 |
| 6.1.1 试验材料 | 第133-134页 |
| 6.1.2 试验试剂 | 第134-135页 |
| 6.1.3 试验仪器 | 第135页 |
| 6.1.4 溶液配制 | 第135-137页 |
| 6.1.5 试验方法 | 第137-144页 |
| 6.2 结果与分析 | 第144-150页 |
| 6.2.1 玉米miRNA载体的构建 | 第144-147页 |
| 6.2.2 玉米miRNA转化拟南芥及筛选 | 第147-148页 |
| 6.2.3 转基因拟南芥低温萌芽分析 | 第148-149页 |
| 6.2.4 MiRNA对拟南芥冷响应过程中根长的影响 | 第149-150页 |
| 6.3 讨论 | 第150-152页 |
| 6.4 结论 | 第152-153页 |
| 全文结论 | 第153-155页 |
| 参考文献 | 第155-171页 |
| 附录一 预测新miRNA成熟体序列 | 第171-173页 |
| 附录二 预测新miRNA表达量统计 | 第173-175页 |
| 附录三 预测新miRNA前体序列 | 第175-179页 |
| 附录四 归一化miRNA表达量统计 | 第179-191页 |
| 附录五 差异表达miRNA表达量统计 | 第191-203页 |
| 附录六 所有miRNA预测靶基因 | 第203-215页 |
| 附录七 所有miRNA靶基因注释 | 第215-223页 |
| 附录八 冷处理差异表达miRNA靶基因注释 | 第223-227页 |
| 附录九 材料间差异表达miRNA靶基因注释 | 第227-235页 |
| 附录十 本研究所用引物 | 第235-238页 |
| 作者简介及科研成果 | 第238-240页 |
| 致谢 | 第240页 |
