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湖南地区南方水稻黑条矮缩病毒的检测及遗传多样性分析

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
第一章 文献综述第9-23页
   ·南方水稻黑条矮缩病毒第9-17页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒概述第9页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的致病特征第9-10页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的发生及危害第10-11页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的寄主范围和传毒介体第11-12页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的基因组和蛋白功能研究第12-13页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的检测方法第13-14页
       ·血清学检测第13-14页
       ·分子生物学检测第14页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的发生特点及流行原因第14-15页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的防治第15-16页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的重组和分子多样性第16-17页
   ·实时荧光定量PCR技术(Real-time qPCR)第17-21页
     ·荧光定量PCR技术原理第17-18页
     ·荧光定量PCR的分类第18-19页
       ·探针类第18-19页
       ·非探针类第19页
     ·荧光定量PCR的方法第19-20页
       ·绝对定量第19页
       ·相对定量第19-20页
     ·荧光定量PCR的特点第20页
     ·荧光定量PCR技术在植物病毒中的应用第20-21页
   ·本课题的研究目的和意义第21-23页
第二章 南方水稻黑条矮缩病毒的序列分析第23-43页
   ·实验材料和方法第23-28页
     ·实验材料第23页
       ·实验材料第23页
       ·主要试剂第23页
       ·培养基第23页
       ·主要仪器设备第23页
     ·实验方法第23-28页
       ·南方水稻黑条矮缩病毒的总RNA的抽提第24页
       ·RT-PCR检测第24页
       ·PCR扩增第24-26页
       ·DNA片段的回收第26-27页
       ·DNA片段的克隆第27页
       ·序列拼接、确认及提交第27-28页
   ·结果与分析第28-40页
     ·SRBSDV检测结果第28-30页
       ·SRBSDV症状表现第28-30页
     ·SRBSDV S9部分序列克隆分析第30-32页
       ·引物设计第30页
       ·PCR扩增检测第30-31页
       ·序列的拼接、确认第31-32页
     ·S9 ORF序列分析第32-36页
       ·突变位点分析第32-33页
       ·核酸遗传距离分析第33-36页
       ·重组分析第36页
     ·SRBSDV S10部分序列克隆分析第36-38页
       ·引物设计第36页
       ·PCR扩增检测第36-37页
       ·序列的拼接、确认第37-38页
     ·S10序列分析第38-40页
       ·突变位点分析第38页
       ·核酸距离分析第38-40页
       ·重组分析第40页
   ·小结与讨论第40-43页
第三章 SRBSDV定量检测第43-55页
   ·实验材料第43页
     ·实验材料第43页
     ·主要试剂第43页
     ·主要仪器设备第43页
   ·实验方法第43-47页
     ·样品的准备第43-44页
     ·看家基因(Actin gene)以及SRBSDV qPCR引物的设计,筛选第44页
     ·样品总RNA的抽提以及cDNA的准备第44-45页
     ·SRBSDV引物特异性检测第45页
     ·qPCR体系优化第45-46页
     ·SRBSDV的qPCR检测第46-47页
   ·实验结果与分析第47-52页
     ·样品症状描述第47-48页
     ·SRBSDV引物特异性结果分析第48-50页
     ·qPCR结果分析第50-52页
   ·小结与讨论第52-55页
论文总结第55-57页
   ·论文总结第55-57页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的遗传多样性分析第55页
     ·SRBSDV qPCR分析第55-57页
参考文献第57-63页
附录1 论文所用重要缩写词及中文全称第63-64页
附录2 常用缓冲液及培养基配方第64-65页
附录3 常用生化试剂及仪器第65-67页
致谢第67-68页
作者简介第68-69页
发表论文附录第69页

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