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基于二代测序数据研究神经母细胞瘤中的RNA编辑现象

史彩萍硕士学位论文答辩委员会成员名单第1-6页
论文摘要第6-7页
ABSTRACT第7-10页
第一章 绪论第10-18页
 第一节 神经母细胞瘤简介第10-12页
 第二节 RNA编辑背景知识简介第12-15页
  1 RNA编辑的原理第12-13页
  2 RNA编辑的特征第13页
  3 RNA编辑的研究方法和工具第13-15页
 第三节 国内外研究现状第15-16页
  1 RNA编辑的研究第15页
  2 RNA编辑对疾病的影响第15-16页
  3 神经母细胞瘤中RNA编辑的研究现状第16页
 第四节 本文研究内容第16-18页
第二章 材料与方法第18-24页
 第一节 数据资源描述第18-19页
 第二节 本文分析方法第19-24页
  1 读段比对第19-20页
  2 单核苷酸突变的获取第20-21页
  3 RNA编辑类型的确定第21页
  4 RNA编辑度的计算第21页
  5 Alu重复区域第21-22页
  6 RNA编辑事件注释第22页
  7 GO分析和Pathway分析第22-23页
  8 基因表达量的计算第23-24页
第三章 分析流程的建立与验证第24-30页
 第一节 分析流程的建立第24-29页
  1 造成假阳性的原因分析第24页
  2 假阳性位点过滤条件的选择第24-26页
  3 分析流程的建立第26-29页
 第二节 分析流程的验证第29-30页
第四章 神经母细胞瘤中的RNA编辑分析第30-45页
 第一节 不同个体之间RNA编辑事件的差异性第30-31页
 第二节 RNA编辑事件特征描述第31-34页
 第三节 不同期神经母细胞瘤中RNA编辑位点差别分析第34-36页
 第四节 不同诊断年龄组病人中RNA编辑位点差别分析第36-37页
 第五节 高危组与低、中危组神经细胞瘤中RNA编辑度的分析第37-40页
 第六节 RNA编辑与高危组病人EFS_d和OS_d的关系第40-43页
  1 RNA编辑事件与高危组病人EFS_d的关系第41-42页
  2 RNA编辑事件与高危组病人OS_d的关系第42-43页
 第七节 外显子区域RNA编辑事件的分析第43-45页
第五章 总结与讨论第45-48页
 第一节 总结第45-46页
 第二节 讨论第46-48页
附录第48-54页
 附录一 不同样本中RNA编辑事件个数情况第48-51页
 附录二 GO分析和Pathway分析结果第51-53页
 附录三 科研成果第53-54页
参考文献第54-58页
后记第58页

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