| 中文摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1 引言 | 第10-20页 |
| ·植物 miRNA 的特点 | 第10-11页 |
| ·植物 miRNA 的生物合成 | 第11-12页 |
| ·植物 miRNA 的作用机制 | 第12-13页 |
| ·植物 miRNA 的生物学功能 | 第13-16页 |
| ·miRNA 与植物的生长发育相关 | 第13-14页 |
| ·miRNA 参与植物的逆境胁迫 | 第14-16页 |
| ·miRNA 的鉴定方法 | 第16-18页 |
| ·传统克隆测序 | 第16-17页 |
| ·计算机预测方法 | 第17页 |
| ·高通量测序的方法鉴定 miRNA | 第17-18页 |
| ·展望 | 第18页 |
| ·本研究的立题依据与目的意义 | 第18-20页 |
| 2 试验材料与方法 | 第20-31页 |
| ·试验材料 | 第20-21页 |
| ·植物材料 | 第20页 |
| ·菌株与质粒 | 第20页 |
| ·培养基 | 第20页 |
| ·酶与各种生化试剂 | 第20页 |
| ·主要仪器 | 第20页 |
| ·生物信息分析所用的数据库 | 第20页 |
| ·生物信息分析所用的生物软件 | 第20-21页 |
| ·试验方法 | 第21-31页 |
| ·试验材料制备 | 第21页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第21-22页 |
| ·miRNA 文库构建 | 第22-23页 |
| ·样品的制备 | 第22页 |
| ·数据的初级分析流程 | 第22页 |
| ·高级分析流程 | 第22-23页 |
| ·Conserved miRNA 鉴定 | 第23页 |
| ·Novel miRNA 鉴定 | 第23页 |
| ·miRNA 的 Real-time PCR 鉴定 | 第23-26页 |
| ·小 RNA 提取 | 第23-24页 |
| ·miRcute miRNA cDNA 第一链的合成 | 第24-25页 |
| ·Real-time PCR 测定 | 第25-26页 |
| ·靶基因的 Real-time PCR 检测 | 第26-31页 |
| ·总 RNA 提取 | 第26页 |
| ·第一链 cDNA 的合成 | 第26页 |
| ·Real-time PCR 测定 | 第26-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-42页 |
| ·Solexa 测序结果初步统分析 | 第31-34页 |
| ·玉米胚中保守的 miRNA 及丰度分析 | 第34-37页 |
| ·新的 miRNA 的鉴定 | 第37-38页 |
| ·新的 miRNA 的靶基因预测及 GO 分析 | 第38-40页 |
| ·Real time PCR 验证差异表达的 miRNA 家族 | 第40-41页 |
| ·Real time PCR 验证 miRNA 的靶基因的表达情况 | 第41页 |
| ·miRNA 的靶基因切割位点的 5'RACE 验证 | 第41-42页 |
| 4 讨论 | 第42-45页 |
| 5 结论 | 第45-46页 |
| 6 进一步研究设想 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-57页 |
| 附录 | 第57-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第75页 |
