摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
英文缩略词 | 第8-13页 |
第1章 绪论 | 第13-21页 |
·GATA1 通过形成不同蛋白质复合体对靶基因进行选择性调控 | 第13-14页 |
·ChIP-seq 技术是研究转录因子复合体的新方法 | 第14-15页 |
·GATA1 乙酰化修饰在红系分化中发挥重要作用 | 第15-16页 |
·EDAG 是调控造血干细胞增殖分化的重要转录调节因子 | 第16-18页 |
·本论文的研究内容及意义 | 第18-21页 |
第2章 EDAG 通过募集 p300 增强 GATA1 的乙酰化和转录活性 | 第21-55页 |
·实验材料 | 第21-24页 |
·菌株、质粒和细胞 | 第21页 |
·主要仪器 | 第21-22页 |
·主要试剂和抗体 | 第22-23页 |
·常用配置的溶液 | 第23-24页 |
·实验方法 | 第24-30页 |
·细胞总蛋白的提取 | 第24-25页 |
·哺乳动物细胞转染 | 第25页 |
·荧光素酶报告基因实验 | 第25页 |
·免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation) | 第25-26页 |
·慢病毒的包装与浓缩 | 第26页 |
·脐带血 CD34~+细胞分离 | 第26-27页 |
·慢病毒感染 CD34~+细胞 | 第27页 |
·间接免疫荧光 | 第27-28页 |
·Western blot | 第28页 |
·细胞核质分离 | 第28-29页 |
·染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP) | 第29页 |
·荧光定量 PCR | 第29-30页 |
·GST 沉淀实验(GST pull-down) | 第30页 |
·统计学方法 | 第30页 |
·实验结果 | 第30-51页 |
·EDAG 在细胞内可与多种蛋白质存在相互作用 | 第30-31页 |
·EDAG/p300/GATA1 和 EDAG/Hsp70/GATA1 形成独立复合体 | 第31-32页 |
·EDAG/p300/GATA1 复合体特性的研究 | 第32-37页 |
·EDAG 募集 p300 增强其对 GATA1 的乙酰化修饰及转录活性 | 第37-39页 |
·EDAG 调控 GATA1 乙酰化及转录活性依赖于 p300 的乙酰转移酶活性 | 第39-41页 |
·EDAG 不能增强 p300 酶活性突变体对 GATA1 乙酰化及转录活性的调控作用 | 第41-42页 |
·EDAG 调控 GATA1 乙酰化及转录活性依赖于 EDAG/p300/GATA1 复合体的形成 | 第42-43页 |
·EDAG/p300/GATA1 复合体在红系分化过程中发生动态变化 | 第43-44页 |
·EDAG 与 GATA1 共结合到 GATA1 靶基因调控区 | 第44-45页 |
·敲低 EDAG 使 GATA1 与靶基因调控区的结合减弱 | 第45页 |
·红系分化中 EDAG 与 GATA1 的靶基因结合增强 | 第45-46页 |
·EDAG 与 GATA1 在小鼠体内共结合在 GATA1 靶基因调控区 | 第46-47页 |
·EDAG 对 GATA1 靶基因的调控具有选择性 | 第47-48页 |
·EDAG 促进 Hsp70 入核并且保护 GATA1 免受 Caspase-3 的切割 | 第48-51页 |
·讨论 | 第51-53页 |
·本章小结 | 第53-55页 |
第3章 基于 ChIP-seq 的 EDAG 全基因组结合谱的分析 | 第55-67页 |
·实验材料 | 第55页 |
·实验所用细胞 | 第55页 |
·主要仪器 | 第55页 |
·试剂及抗体 | 第55页 |
·实验方法 | 第55-57页 |
·脐带血 CD34~+细胞分离 | 第55页 |
·CD34~+细胞体外扩增培养和诱导分化 | 第55页 |
·联苯胺染色 | 第55页 |
·染色质免疫沉淀(ChIP) | 第55-56页 |
·Western blot | 第56页 |
·ChIP 样本的高通量测序 (high-throughput sequencing) | 第56页 |
·生物信息学分析 | 第56页 |
·荧光定量 PCR | 第56-57页 |
·统计学方法 | 第57页 |
·结果 | 第57-63页 |
·ChIP DNA 样品的检测及 EDAG 抗体的富集情况 | 第57-58页 |
·高通量测序前已知位点的 QPCR 检测 | 第58页 |
·ChIP 样品的高通量测序及生物信息学分析 | 第58-60页 |
·EDAG 结合基因的 QPCR 验证 | 第60-61页 |
·将 EDAG 的 ChIP-seq 结果与基因表达谱相整合 | 第61页 |
·将 EDAG 结合的基因进行 Gene ontology(GO)注释 | 第61-62页 |
·将 EDAG 结合的基因群与 GATA1 结合的靶基因群相整合 | 第62页 |
·EDAG/p300/GATA1 能共同结合在染色体上 | 第62-63页 |
·讨论 | 第63-65页 |
·本章小结 | 第65-67页 |
结论 | 第67-69页 |
参考文献 | 第69-75页 |
附录 | 第75-79页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第79-81页 |
致谢 | 第81页 |