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EDAG/p300/GATA1复合体作用机制研究

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
英文缩略词第8-13页
第1章 绪论第13-21页
   ·GATA1 通过形成不同蛋白质复合体对靶基因进行选择性调控第13-14页
   ·ChIP-seq 技术是研究转录因子复合体的新方法第14-15页
   ·GATA1 乙酰化修饰在红系分化中发挥重要作用第15-16页
   ·EDAG 是调控造血干细胞增殖分化的重要转录调节因子第16-18页
   ·本论文的研究内容及意义第18-21页
第2章 EDAG 通过募集 p300 增强 GATA1 的乙酰化和转录活性第21-55页
   ·实验材料第21-24页
     ·菌株、质粒和细胞第21页
     ·主要仪器第21-22页
     ·主要试剂和抗体第22-23页
     ·常用配置的溶液第23-24页
   ·实验方法第24-30页
     ·细胞总蛋白的提取第24-25页
     ·哺乳动物细胞转染第25页
     ·荧光素酶报告基因实验第25页
     ·免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation)第25-26页
     ·慢病毒的包装与浓缩第26页
     ·脐带血 CD34~+细胞分离第26-27页
     ·慢病毒感染 CD34~+细胞第27页
     ·间接免疫荧光第27-28页
     ·Western blot第28页
     ·细胞核质分离第28-29页
     ·染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)第29页
     ·荧光定量 PCR第29-30页
     ·GST 沉淀实验(GST pull-down)第30页
     ·统计学方法第30页
   ·实验结果第30-51页
     ·EDAG 在细胞内可与多种蛋白质存在相互作用第30-31页
     ·EDAG/p300/GATA1 和 EDAG/Hsp70/GATA1 形成独立复合体第31-32页
     ·EDAG/p300/GATA1 复合体特性的研究第32-37页
     ·EDAG 募集 p300 增强其对 GATA1 的乙酰化修饰及转录活性第37-39页
     ·EDAG 调控 GATA1 乙酰化及转录活性依赖于 p300 的乙酰转移酶活性第39-41页
     ·EDAG 不能增强 p300 酶活性突变体对 GATA1 乙酰化及转录活性的调控作用第41-42页
     ·EDAG 调控 GATA1 乙酰化及转录活性依赖于 EDAG/p300/GATA1 复合体的形成第42-43页
     ·EDAG/p300/GATA1 复合体在红系分化过程中发生动态变化第43-44页
     ·EDAG 与 GATA1 共结合到 GATA1 靶基因调控区第44-45页
     ·敲低 EDAG 使 GATA1 与靶基因调控区的结合减弱第45页
     ·红系分化中 EDAG 与 GATA1 的靶基因结合增强第45-46页
     ·EDAG 与 GATA1 在小鼠体内共结合在 GATA1 靶基因调控区第46-47页
     ·EDAG 对 GATA1 靶基因的调控具有选择性第47-48页
     ·EDAG 促进 Hsp70 入核并且保护 GATA1 免受 Caspase-3 的切割第48-51页
   ·讨论第51-53页
   ·本章小结第53-55页
第3章 基于 ChIP-seq 的 EDAG 全基因组结合谱的分析第55-67页
   ·实验材料第55页
     ·实验所用细胞第55页
     ·主要仪器第55页
     ·试剂及抗体第55页
   ·实验方法第55-57页
     ·脐带血 CD34~+细胞分离第55页
     ·CD34~+细胞体外扩增培养和诱导分化第55页
     ·联苯胺染色第55页
     ·染色质免疫沉淀(ChIP)第55-56页
     ·Western blot第56页
     ·ChIP 样本的高通量测序 (high-throughput sequencing)第56页
     ·生物信息学分析第56页
     ·荧光定量 PCR第56-57页
     ·统计学方法第57页
   ·结果第57-63页
     ·ChIP DNA 样品的检测及 EDAG 抗体的富集情况第57-58页
     ·高通量测序前已知位点的 QPCR 检测第58页
     ·ChIP 样品的高通量测序及生物信息学分析第58-60页
     ·EDAG 结合基因的 QPCR 验证第60-61页
     ·将 EDAG 的 ChIP-seq 结果与基因表达谱相整合第61页
     ·将 EDAG 结合的基因进行 Gene ontology(GO)注释第61-62页
     ·将 EDAG 结合的基因群与 GATA1 结合的靶基因群相整合第62页
     ·EDAG/p300/GATA1 能共同结合在染色体上第62-63页
   ·讨论第63-65页
   ·本章小结第65-67页
结论第67-69页
参考文献第69-75页
附录第75-79页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第79-81页
致谢第81页

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