| 致谢 | 第1-6页 |
| 前言 | 第6-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 目录 | 第13-15页 |
| 缩略词 | 第15-16页 |
| 第一部分 文献综述 | 第16-33页 |
| 1 立枯丝核菌遗传多样性的研究方法 | 第16-24页 |
| ·立枯丝核菌遗传多样性的研究方法及其应用 | 第16-22页 |
| ·菌丝融合法 | 第16-17页 |
| ·同工酶法 | 第17-18页 |
| ·脂肪酸法 | 第18-20页 |
| ·分子标记法 | 第20-22页 |
| ·研究立枯丝核菌遗传多样性方法的差异 | 第22-24页 |
| 2 rDNA-ITS研究立枯丝核菌的遗传多样性 | 第24-29页 |
| ·利用rDNA-ITS研究R.solani遗传多样性的方法 | 第24-26页 |
| ·直接测序 | 第24-25页 |
| ·限制性片段长度多态性(RFLP) | 第25-26页 |
| ·直接测序和RFLP数据处理 | 第26页 |
| ·rDNA-ITS在R.solani遗传多样性研究中的应用 | 第26-29页 |
| ·直接测序在研究R.solani遗传多样性中的应用 | 第26-28页 |
| ·RFLP在研究R.solani遗传多样性中的应用 | 第28-29页 |
| 3 SSR标记在立枯丝核菌遗传多样性研究中的应用 | 第29-32页 |
| ·SSR标记的定义及搜索 | 第29-30页 |
| ·SSR标记在立枯丝核菌中的应用 | 第30-32页 |
| 4 本研究的目的及意义 | 第32-33页 |
| 第二部分 研究内容 | 第33-65页 |
| 第一章 浙江省水稻立枯丝核菌5.8s rDNA-ITS区间多样性研究 | 第33-43页 |
| 1 引言 | 第33-34页 |
| 2 材料与方法 | 第34-38页 |
| ·供试菌株 | 第34页 |
| ·水稻纹枯病菌基因组DNA的提取 | 第34-37页 |
| ·水稻纹枯病菌5.8S rDNA-ITS扩增和序列测序 | 第37页 |
| ·数据处理 | 第37-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-40页 |
| ·浙江省水稻纹枯病菌种5.8S rDNA-ITS序列多态性 | 第38-39页 |
| ·浙江省水稻纹枯病菌5.8S rDNA-ITS序列进化分析 | 第39页 |
| ·浙江省水稻纹枯病菌种群5.8S rDNA-ITS序列单倍型分析 | 第39-40页 |
| 4 讨论 | 第40-43页 |
| 第二章 基于Rhizoctonia solani AG3全基因组序列的SSR挖掘 | 第43-53页 |
| 1 引言 | 第43-44页 |
| 2 材料与方法 | 第44-45页 |
| ·R.solani AG3及稻瘟菌全基因组SSR分析 | 第44页 |
| ·SSR引物设计及电子PCR验证 | 第44页 |
| ·供试R.solani菌株及培养条件 | 第44-45页 |
| ·DNA提取,PCR扩增及测序验证 | 第45页 |
| 3 结果与分析 | 第45-51页 |
| ·R.solani AG3及稻瘟菌全基因组SSR的分布 | 第45-48页 |
| ·R.solani AG3全基因组SSR引物设计及电子验证 | 第48页 |
| ·SSR在不同标准融合群菌株中的验证 | 第48-50页 |
| ·序列测定 | 第50-51页 |
| ·水稻来源R.solani群体的扩增 | 第51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| 第三章 利用SSR对浙江省水稻R.solani遗传多样性研究 | 第53-63页 |
| 1 引言 | 第53-54页 |
| 2. 材料与方法 | 第54-55页 |
| ·实验菌株及培养方法 | 第54页 |
| ·DNA提取SSR标记的PCR扩增 | 第54页 |
| ·微卫星标记遗传信息分析 | 第54页 |
| ·不同地区遗传信息分析 | 第54-55页 |
| ·AMOVA、PCoA及群体遗传分化分析 | 第55页 |
| ·群体分析 | 第55页 |
| ·HW平衡及配子平衡检测 | 第55页 |
| ·地理分隔模型检测 | 第55页 |
| 3 结果与分析 | 第55-61页 |
| ·SSR标记在浙江省水稻R.solani菌株中的扩增情况 | 第55-56页 |
| ·浙江省水稻立枯丝核在不同地区的遗传多样性 | 第56-57页 |
| ·不同地区的群体AMOVA分析 | 第57页 |
| ·不同地区的群体的PcoA及群体分化分析 | 第57页 |
| ·不同地区来源菌株的群体分化研究 | 第57-58页 |
| ·HW及配子平衡分析 | 第58-59页 |
| ·地理分隔模型检测 | 第59-61页 |
| 4 讨论 | 第61-63页 |
| 第四章 总结与展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-72页 |
| 附录 | 第72-98页 |
| 作者简历 | 第98页 |
| 攻读硕士学位期间主要科研成果 | 第98页 |
