| 提要 | 第1-6页 |
| 第1章 引言 | 第6-17页 |
| ·研究背景 | 第6-7页 |
| ·蛋白质与DNA 的相互作用 | 第7-11页 |
| ·蛋白质与蛋白质的相互作用 | 第11-14页 |
| ·转录因子间的协同调控 | 第14-15页 |
| ·生物信息学概述 | 第15-16页 |
| ·研究的目的与意义 | 第16-17页 |
| 第2章 材料与方法 | 第17-27页 |
| ·应用的数据集 | 第17-22页 |
| ·拟南芥转录因子数据库（DATF） | 第17-18页 |
| ·JARSPAR 数据库 | 第18-20页 |
| ·拟南芥全基因组上游转录调控区数据库 | 第20-21页 |
| ·PIR 蛋白质序列数据库 | 第21-22页 |
| ·PWMSA 算法简介 | 第22-24页 |
| ·BLAST 简介 | 第24-26页 |
| ·编程实现 | 第26-27页 |
| 第3章 结果 | 第27-41页 |
| ·实验流程设计 | 第27-28页 |
| ·获取高可信度转录因子的TFBS | 第28-31页 |
| ·在JARSPAR 中寻找DATF 中转录因子的同源蛋白 | 第31-34页 |
| ·预测高可信度转录因子的调控基因 | 第34-37页 |
| ·预测低可信度转录因子的调控基因 | 第37-38页 |
| ·预测转录因子的协同调控 | 第38-40页 |
| ·实验结果 | 第40-41页 |
| 第4章 讨论 | 第41-43页 |
| ·关于实验材料与实验方法的讨论 | 第41页 |
| ·后续工作的比较和分析 | 第41-43页 |
| 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 摘要 | 第47-49页 |
| ABSTRACT | 第49-51页 |