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猪伪狂犬病毒EP0基因生物信息学分析及TK蛋白的同源模建

中文摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
缩略词表第8-9页
目录第9-11页
第一章 文献综述第11-44页
 1 流行现状及危害第11-13页
 2 伪狂犬病病毒的分子生物学特性第13-21页
   ·伪狂犬病病毒的主要理化和生物学特性第13-14页
   ·伪狂犬病病毒的分子生物学特性第14-21页
 3 伪狂犬病毒的潜伏感染第21-24页
   ·伪狂犬病毒潜伏感染的分子机理第21-23页
   ·潜伏感染的检测方法第23-24页
 4 伪狂犬病的诊断第24-27页
   ·病原学诊断技术第24-26页
   ·血清学诊断技术第26-27页
 5 伪狂犬病的免疫与防治第27-34页
   ·伪狂犬病疫苗研究进展第27-32页
   ·伪狂犬病的防制措施第32-34页
 6 生物信息学在病毒研究中的应用第34-37页
   ·生物信息学在病毒研究中的应用第35页
   ·多重序列对齐第35-36页
   ·预测序列的高级结构第36页
   ·蛋白质分子进化分析第36-37页
 7 计算机辅助药物设计和蛋白质结构预测第37-43页
   ·计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug Design, CADD)第37-40页
   ·蛋白质结构预测的意义和同源模建的基本过程第40-43页
 8 实验意义第43-44页
第二章 PRV EP0基因的克隆和生物信息学分析第44-74页
 1 材料第44-47页
   ·细胞、毒株、载体和菌株第44-45页
   ·主要试剂及溶液配制第45-47页
   ·主要仪器第47页
 2 方法第47-54页
   ·病毒基因组 DNA的抽提第47-48页
   ·PRV-EP0基因的PCR扩增第48-49页
   ·PRV-EP0基因的克隆第49-50页
   ·重组质粒的鉴定第50-51页
   ·EP0基因的序列测定第51-52页
   ·EP0基因的生物信息学分析第52-54页
 3 结果分析第54-68页
   ·PRV-EP0的PCR扩增第54-55页
   ·PRV-EP0基因的克隆第55页
   ·重组质粒菌落的PCR法鉴定第55-56页
   ·基因测序第56-57页
   ·PRV-EP0基因的序列分析第57-61页
   ·PRV-EP0基因氨基酸序列分析第61-68页
 4 讨论第68-74页
   ·关于PRV-EP0克隆第68-70页
   ·关于PRV-EP0生物信息学分析第70-74页
第三章 PRV TK基因的克隆与其蛋白三维结构的模建及其配体设计的研究第74-89页
 1 材料第74页
   ·材料第74页
   ·硬件和软件第74页
 2 方法第74-79页
   ·猪伪狂犬病病毒 TK基因的氨基酸序列的克隆第74-76页
   ·PRV-TK蛋白的三维结构的同源模建及其配体的研究第76-79页
 3 结果和讨论第79-89页
   ·猪伪狂犬病病毒 TK基因的氨基酸序列的克隆第79-81页
   ·PRV-TK蛋白的三维结构的同源模建及其配体的研究第81-84页
   ·靶蛋白活性区的预测,配体的设计第84-86页
   ·靶蛋白的配体的分子对接及活性位点分析第86-89页
结论第89-90页
 1 PRV EP0基因生物信息学分析第89页
 2 PRV TK蛋白生物学功能的研究第89-90页
参考文献第90-96页
致谢第96-97页
附录一 伪狂犬病毒 EP0和TK基因测序结果第97-101页

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