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破囊壶菌不同生长时期及氮源胁迫转录组学研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 前言第10-20页
    1.1 多不饱和脂肪酸第10-11页
    1.2 二十二碳六烯酸(DHA)第11-13页
        1.2.1 DHA的理化性质第11-12页
        1.2.2 DHA的生理功能及应用第12-13页
    1.3 DHA的来源第13页
    1.4 破囊壶菌概述第13-15页
    1.5 破囊壶菌的DHA合成机制第15-16页
    1.6 转录组第16-18页
    1.7 课题研究目的及意义第18页
    1.8 课题研究思路及技术路线第18-20页
第2章 不同破囊壶菌生长及脂肪酸合成研究第20-27页
    2.1 实验材料第20-22页
        2.1.1 菌种第20页
        2.1.2 培养基第20-21页
        2.1.3 菌种活化及培养条件第21页
        2.1.4 仪器及试剂第21-22页
    2.2 实验方法第22-23页
        2.2.1 破囊壶菌生长曲线的测定第22页
        2.2.2 破囊壶菌油脂的提取和测定分析第22-23页
    2.3 结果与讨论第23-25页
        2.3.1 不同破囊壶菌的生长趋势比较研究第23-25页
        2.3.2 不同破囊壶菌合成油脂含量及组分的比较研究第25页
    2.4 本章小结第25-27页
第3章 破囊壶菌De Novo转录组分析第27-45页
    3.1 实验材料第27页
        3.1.1 菌种第27页
        3.1.2 试剂仪器第27页
    3.2 实验方法第27-32页
        3.2.1 破囊壶菌总RNA的提取第27-28页
        3.2.2 转录组文库的构建第28页
        3.2.3 De novo组装第28-30页
        3.2.4 转录组生物信息学分析及基因功能注释第30-31页
        3.2.5 Unigene的CDS预测第31页
        3.2.6 Unigene的SSR检测第31-32页
    3.3 结果与讨论第32-43页
        3.3.1 RNA质量检测结果第32页
        3.3.2 测序数据过滤分析第32-34页
        3.3.3 De novo组装第34-36页
        3.3.4 转录组生物信息学分析及基因功能注释第36-41页
        3.3.5 Unigene的CDS预测第41-42页
        3.3.6 Unigene的SSR检测第42-43页
    3.4 本章小结第43-45页
第4章 不同生长周期破囊壶菌合成DHA代谢机理研究第45-65页
    4.1 实验材料第45页
        4.1.1 菌种第45页
        4.1.2 试剂仪器第45页
    4.2 实验方法第45-47页
        4.2.1 破囊壶菌生物量的测定第45页
        4.2.2 破囊壶菌油脂的提取与测定第45页
        4.2.3 破囊壶菌总RNA的提取第45页
        4.2.4 转录组文库构建和序列组装第45-46页
        4.2.5 转录组生物信息学分析第46页
        4.2.6 差异表达基因检测第46页
        4.2.7 差异表达基因GO功能分析第46页
        4.2.8 差异表达基因Pathway功能分析第46-47页
    4.3 结果与讨论第47-64页
        4.3.1 破囊壶菌不同生长周期的油脂含量、组分的测定与分析第47-49页
        4.3.2 RNA质量检测结果第49-51页
        4.3.3 测序饱和度和Reads随机性第51-53页
        4.3.4 基于基因表达水平的分析第53-64页
    4.4 本章小结第64-65页
第5章 不同氮源胁迫对破囊壶菌合成DHA影响的研究第65-83页
    5.1 实验材料第65页
        5.1.1 菌种和培养基第65页
        5.1.2 主要试剂及仪器第65页
    5.2 实验方法第65-66页
        5.2.1 不同氮源培养破囊壶菌第65-66页
        5.2.2 破囊壶菌生物量的测定第66页
        5.2.3 破囊壶菌油脂的提取与测定第66页
        5.2.4 De novo转录组的测定、组装与分析第66页
    5.3 结果与讨论第66-81页
        5.3.1 不同氮源对破囊壶菌生长的影响第66-74页
        5.3.2 不同氮源胁迫对破囊壶菌的油脂含量、组分的测定与分析第74-78页
        5.3.3 PKU#Mn16不同氮源胁迫培养的破囊壶菌转录组测定与分析第78-80页
        5.3.4 PKU#Sw7不同氮源胁迫培养的破囊壶菌转录组测定与分析第80-81页
    5.4 本章小结第81-83页
第6章 结论与展望第83-84页
参考文献第84-89页
致谢第89-90页
攻读硕士学位期间的研究成果第90页

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