基于线粒体基因组对有翅昆虫起源的探讨
摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第9-16页 |
1.1 有翅昆虫的起源 | 第9-12页 |
1.1.1 有翅亚纲基部的三种昆虫 | 第9-10页 |
1.1.2 有翅昆虫的系统发生史 | 第10-12页 |
1.2 分子标记在系统发生研究中的应用 | 第12-15页 |
1.2.1 线粒体基因片段标记 | 第12-13页 |
1.2.2 核基因片段标记 | 第13页 |
1.2.3 线粒体基因和核基因联用 | 第13-14页 |
1.2.4 线粒体全基因标记 | 第14-15页 |
1.3 本研究的意义 | 第15-16页 |
第二章 线粒体基因组全序列的结构分析 | 第16-31页 |
2.1 引言 | 第16页 |
2.2 材料与方法 | 第16-20页 |
2.2.1 实验材料 | 第16页 |
2.2.2 实验方法 | 第16-20页 |
2.3 实验结果 | 第20-27页 |
2.3.1 线粒体基因结构和碱基组成 | 第20-22页 |
2.3.2 蛋白编码序列 | 第22-24页 |
2.3.3 tRNA基因 | 第24-25页 |
2.3.4 rRNA基因 | 第25页 |
2.3.5 非编码区 | 第25-27页 |
2.4 讨论 | 第27-31页 |
2.4.1 基因结构 | 第27-29页 |
2.4.2 蛋白编码基因 | 第29页 |
2.4.3 控制区 | 第29-30页 |
2.4.4 其他主要非编码区 | 第30-31页 |
第三章 蜉蝣目、蜻蜓目及襀翅目的系统发生关系 | 第31-46页 |
3.1 引言 | 第31页 |
3.2 材料与方法 | 第31-36页 |
3.2.1 物种选择 | 第31-34页 |
3.2.2 序列比对与数据集选定 | 第34-35页 |
3.2.3 序列密码子饱和度检验 | 第35页 |
3.2.4 模型筛选 | 第35页 |
3.2.5 系统发生树的构建 | 第35页 |
3.2.6 多组外群构建系统发生树 | 第35-36页 |
3.3 结果 | 第36-42页 |
3.3.1 最原始的系统发生树 | 第36页 |
3.3.2 最终的系统发生树 | 第36-37页 |
3.3.3 改变外群的系统发生关系 | 第37-38页 |
3.3.4 蜻蜓目内部的系统发生关系 | 第38-39页 |
3.3.5 蜉蝣目内部的系统发生关系 | 第39-42页 |
3.4 讨论 | 第42-46页 |
3.4.1 长枝吸引对系统关系构建的影响 | 第42页 |
3.4.2 外群的选择对系统树构建的影响 | 第42-43页 |
3.4.3 蜉蝣目、蜻蜓目与新翅类的关系 | 第43页 |
3.4.4 襀翅目在新翅类中的分类地位 | 第43-44页 |
3.4.5 蜻蜓目内部的系统发生关系 | 第44页 |
3.4.6 蜉蝣目内部的系统发生关系 | 第44-46页 |
参考文献 | 第46-57页 |
附录 | 第57-92页 |
致谢 | 第92-93页 |
攻读学位期间取得的研究成果 | 第93-95页 |