摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
Chapter 1 Introduction | 第9-13页 |
1.1 Gyrodactylids | 第9页 |
1.2 State of systematics knowledge in Gyrodactylidae | 第9-10页 |
1.3 Mitochondrial genome | 第10-11页 |
1.4 Gyrodactylus parvae, Gyrodactylus variegatus, and Paragyrodactylus variegatus | 第11-13页 |
Chapter 2 Sequencing and comparative analysis of mitochondrial genomes ofGyrodactylus variegatus, Gyrodactylus parvae, and Paragyrodactylusvariegatus | 第13-41页 |
2.1 Material and methods | 第13-15页 |
2.1.1 Specimen collection and DNA extraction | 第13页 |
2.1.2 PCR and sequencing | 第13-14页 |
2.1.3 Sequence analysis | 第14-15页 |
2.2 Results and Discussion | 第15-41页 |
2.2.1 General features of Gyrodactylus parvae and Gyrodactylus variegatusmitochondrial genomes | 第15页 |
2.2.2 General features of Paragyrodactylus variegatus mitochondrial genome | 第15-20页 |
2.2.3 Base composition | 第20-22页 |
2.2.4 Protein coding genes and codon usage | 第22-24页 |
2.2.5 Transfer RNA gene | 第24-27页 |
2.2.6 Ribosomal RNA genes | 第27-33页 |
2.2.7 Synonymous and nonsynonymous substitutions and genetic distance | 第33-35页 |
2.2.8 The major non-coding region | 第35-37页 |
2.2.9 Evolution of gene arrangements | 第37-41页 |
Chapter 3 Phylogenetic reconstruction of Gyrodactylidae | 第41-47页 |
3.1 Phylogenetic methods and data | 第41-43页 |
3.2 Phylogenetic relationships within Gyrodactylidae | 第43-47页 |
Conclusion | 第47-49页 |
References | 第49-59页 |
致谢 | 第59-61页 |
攻读硕士学位期间科研成果 | 第61页 |