WaspBase数据库构建以及寄生蜂基因家族扩张与收缩分析
| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-22页 |
| 1 测序技术的发展 | 第11-14页 |
| 1.1 第一代测序技术 | 第11页 |
| 1.2 第二代测序技术 | 第11-12页 |
| 1.3 第三代测序技术 | 第12-13页 |
| 1.4 第四代测序技术 | 第13页 |
| 1.5 应用和发展趋势 | 第13-14页 |
| 2 昆虫基因组与转录组研究进展 | 第14-17页 |
| 2.1 昆虫基因组研究进展 | 第14-15页 |
| 2.2 昆虫转录组研究进展 | 第15-17页 |
| 2.3 小结 | 第17页 |
| 3 昆虫数据库研究进展 | 第17-20页 |
| 3.1 数据库的功能 | 第17-18页 |
| 3.2 基因组数据库的分类 | 第18页 |
| 3.3 昆虫基因组数据库的现状 | 第18-19页 |
| 3.4 小结 | 第19-20页 |
| 4 寄生蜂基因组的现状 | 第20-21页 |
| 5 研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 寄生蜂基因组与转录组数据库构建 | 第22-43页 |
| 1 引言 | 第22页 |
| 2 数据 | 第22-23页 |
| 3 数据库功能 | 第23-26页 |
| 3.1 BLAST序列比对模块 | 第24-25页 |
| 3.2 Search查询模块 | 第25页 |
| 3.3 JB rowse可视化模块 | 第25页 |
| 3.4 Tools工具模块 | 第25页 |
| 3.5 DownLoad数据下载模块 | 第25-26页 |
| 3.6 Wasp People人物展示模块 | 第26页 |
| 4 数据库构建 | 第26-41页 |
| 4.1 数据库技术概述 | 第26-28页 |
| 4.2 数据库的Web实现 | 第28-41页 |
| 5 讨论与展望 | 第41-43页 |
| 第三章 基因组水平的寄生蜂基因家族扩张与收缩分析 | 第43-51页 |
| 1 引言 | 第43页 |
| 2 材料与方法 | 第43-45页 |
| 2.1 寄生蜂基因组数据 | 第43-44页 |
| 2.2 系统发育树的构建 | 第44页 |
| 2.3 TreeFam聚类 | 第44-45页 |
| 2.4 CAFé分析 | 第45页 |
| 3 结果与分析 | 第45-49页 |
| 3.1 寄生蜂的基因家族进化 | 第45-46页 |
| 3.2 茧蜂科共同收缩和扩张的基因家族 | 第46-47页 |
| 3.3 小蜂总科共同收缩和扩张的基因家族 | 第47-49页 |
| 4 讨论与小结 | 第49-51页 |
| 全文总结 | 第51-53页 |
| 1 总结 | 第51页 |
| 2 创新点 | 第51页 |
| 3 展望 | 第51-53页 |
| 作者简介 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 附录 | 第58-60页 |
