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聚酮合酶基因簇cluster 9和Aureothin生物合成基因簇中调控因子AurD的研究

摘要第7-8页
Abstract第8-9页
缩略语第10-12页
第一章 前言第12-23页
    1 微生物活性天然产物的简介第12-13页
    2 聚酮类化合物的生物合成第13-17页
        2.1 I型聚酮类化合物的生物合成第14-16页
        2.2 II型聚酮类化合物的生物合成第16-17页
        2.3 III型聚酮类化合物生物合成第17页
    3 基因组编辑技术第17-19页
        3.1 PCR-targeting技术第17-18页
        3.2 大范围核酸内切酶I-SecI第18页
        3.3 CRISPR/Cas9介导的基因组编辑技术第18-19页
    4 SARP家族调控蛋白第19-20页
    5 链霉菌蛋白表达系统第20-21页
    6 本研究的目的和意义第21-23页
        6.1 聚酮合酶基因簇(cluster9)的研究第21页
        6.2 Aureothin生物合成基因簇中调控因子AurD的研究第21-23页
第二章 材料与方法第23-41页
    1 实验材料第23-31页
        1.1 实验用的菌株和质粒第23-25页
        1.2 实验用的引物第25-27页
        1.3 生化试剂第27-30页
        1.4 培养基第30-31页
        1.5 主要仪器第31页
    2 实验方法第31-41页
        2.1 菌种培养及保藏第31-32页
        2.2 链霉菌总DNA提取第32页
        2.3 大肠杆菌质粒的小量抽提第32-33页
        2.4 PCR扩增基因片段第33页
        2.5 DNA片段回收(AxygenDNA凝胶回收试剂盒)第33-34页
        2.6 醋酸钠纯化DNA第34页
        2.7 酶连反应第34页
        2.8 CaCl法制备大肠杆菌感受态细胞及DNA转化第34页
        2.9 PCR-targeting中制备大肠杆菌电转感受细胞及DNA转化第34-35页
        2.10 大肠杆菌和链霉菌属间接和转移第35页
        2.11 链霉菌发酵和产物萃取第35-36页
        2.12 发酵产物的TLC检测第36页
        2.13 发酵产物的HPLC检测第36-37页
        2.14 目的蛋白的表达纯化第37-38页
        2.15 PCR-targeting方法构建缺失突变菌株第38-39页
        2.16 CRISPR/Cas9-CodA(sm)方法构建缺失突变菌株第39-41页
第三章 聚酮合酶基因簇cluster9的研究第41-55页
    1 前言第41页
    2 异源表达菌株的验证第41-42页
    3 利用PCR-targeting技术构建核心pks缺失突变菌株第42-47页
        3.1 重组BAC质粒pZSQ003的构建及验证第42-45页
        3.2 缺失突变菌株S.albus::pZSQ003的构建及验证第45-46页
        3.3 发酵产物的检测第46-47页
    4 利用CRISPR/Cas9-CodA(sm)技术构建核心pks缺失突变菌株第47-53页
        4.1 敲除质粒pZSQ010的构建及验证第48-50页
        4.2 缺失突变菌株S.albus::6C2Δ064pks的筛选及验证第50-52页
        4.3 发酵产物的检测第52-53页
    5 讨论第53-55页
第四章 Aureothin生物合成基因簇中调控因子AurD的研究第55-67页
    1 前言第55页
    2 AurD的生物信息学分析第55-56页
    3 aurD基因缺失突变菌株及其超表达质粒的验证第56-58页
    4 aurD基因的原位回补第58-61页
        4.1 aurD基因的原位回补质粒的构建第58-60页
        4.2 原位回补菌株的构建及其发酵产物的检测第60-61页
    5 AurD蛋白的表达第61-66页
        5.1 大肠杆菌宿主中表达AurD蛋白第61-63页
        5.2 链霉菌中表达AurD蛋白第63-66页
    6 讨论第66-67页
参考文献第67-76页
硕士期间发表文章第76-77页
致谢第77页

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