| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词 | 第13-14页 |
| 第一部分 文献综述 | 第14-50页 |
| 第一章 SNP芯片及其在作物育种中的应用 | 第16-26页 |
| 1.1 简述基因芯片 | 第16-17页 |
| 1.2 SNP及其特点 | 第17页 |
| 1.3 高通量SNP分型的检测方法 | 第17-19页 |
| 1.4 SNP芯片在作物育种中的应用进展 | 第19-26页 |
| 第二章 关联分析的原理及应用 | 第26-34页 |
| 2.1 关联分析的原理 | 第26-27页 |
| 2.2 关联分析的优点 | 第27-28页 |
| 2.3 实施关联分析的方法 | 第28-30页 |
| 2.4 关联分析在作物研究中的应用 | 第30-34页 |
| 第三章 大豆异黄酮的研究进展 | 第34-50页 |
| 3.1 大豆异黄酮概述 | 第34-35页 |
| 3.2 大豆异黄酮的生理功能 | 第35-37页 |
| 3.2.1 大豆异黄酮在人体中的功能 | 第35-36页 |
| 3.2.2 异黄酮在植物中的生理功能 | 第36-37页 |
| 3.3 大豆异黄酮的生物合成途径 | 第37-38页 |
| 3.4 大豆异黄酮的遗传统计学研究 | 第38-45页 |
| 3.5 大豆异黄酮的分子遗传学研究 | 第45-48页 |
| 3.5.1 结构基因的研究 | 第45-46页 |
| 3.5.2 调控异黄酮转录因子的研究 | 第46-48页 |
| 本研究的目的和意义 | 第48-50页 |
| 第二部分 研究报告 | 第50-110页 |
| 第四章 SNP芯片的开发及大豆种质资源的遗传解析 | 第52-76页 |
| 4.1 材料与方法 | 第53-56页 |
| 4.1.1 Affymetrix芯片的设计 | 第53-54页 |
| 4.1.2 SNP分型 | 第54-55页 |
| 4.1.3 大豆材料和表型数据收集 | 第55页 |
| 4.1.4 多态性参数计算 | 第55-56页 |
| 4.1.5 群体结构分析 | 第56页 |
| 4.1.6 系统发育分析 | 第56页 |
| 4.1.7 全基因组人工选择信号的检测 | 第56页 |
| 4.2 结果与分析 | 第56-74页 |
| 4.2.1 NJAU 355K SoySNP芯片的开发 | 第56-59页 |
| 4.2.2 野生大豆和栽培大豆的遗传多样性分析 | 第59-61页 |
| 4.2.3 群体结构分析及野生和栽培大豆的生态区域和粒重分布模式分析 | 第61-66页 |
| 4.2.4 全基因组人工选择信号的鉴定 | 第66-74页 |
| 4.3 讨论 | 第74-76页 |
| 第五章 大豆籽粒异黄酮含量的全基因组关联分析 | 第76-90页 |
| 5.1 材料与方法 | 第76-78页 |
| 5.1.1 材料与田间试验设计 | 第76页 |
| 5.1.2 异黄酮含量测定与数据分析 | 第76-77页 |
| 5.1.3 基因分型和质量控制 | 第77页 |
| 5.1.4 全基因组关联分析 | 第77-78页 |
| 5.2 结果与分析 | 第78-87页 |
| 5.2.1 大豆籽粒异黄酮含量的表型变异 | 第78-80页 |
| 5.2.2 大豆籽粒总异黄酮及其主要组分含量间的相关分析 | 第80-81页 |
| 5.2.3 大豆异黄酮含量的全基因组关联分析 | 第81-87页 |
| 5.3 讨论 | 第87-90页 |
| 第六章 候选基因GMMYB29的功能初步研究 | 第90-110页 |
| 6.1 材料与方法 | 第90-96页 |
| 6.1.1 植物材料及处理 | 第90-91页 |
| 6.1.2 菌株与载体 | 第91页 |
| 6.1.3 主要试剂 | 第91页 |
| 6.1.4 基因表达水平的测定 | 第91-92页 |
| 6.1.5 组织异黄酮提取 | 第92-93页 |
| 6.1.6 亚细胞定位 | 第93-94页 |
| 6.1.7 双荧光素酶报告系统构建 | 第94-95页 |
| 6.1.8 农杆菌介导的大豆毛状根转化系统 | 第95-96页 |
| 6.2 结果与分析 | 第96-106页 |
| 6.2.1 基因的序列分析 | 第96-99页 |
| 6.2.2 亚细胞定位 | 第99页 |
| 6.2.3 诱导表达分析 | 第99-100页 |
| 6.2.4 组织表达分析与异黄酮类物质的积累 | 第100-101页 |
| 6.2.5 GmMYB29调控异黄酮合成关键基因启动子的瞬时表达活性分析 | 第101-103页 |
| 6.2.6 发根农杆菌介导的大豆毛状根遗传转化 | 第103-106页 |
| 6.3 讨论 | 第106-110页 |
| 全文结论 | 第110-112页 |
| 本研究创新点 | 第112-114页 |
| 参考文献 | 第114-134页 |
| 附录 | 第134-144页 |
| 攻读学位期间发表与待发表的论文 | 第144-146页 |
| 致谢 | 第146页 |
