摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
缩略语表 | 第12-13页 |
1 前言 | 第13-27页 |
1.1 健康人肠道菌群构成 | 第13-14页 |
1.2 健康人肠道菌群的构成、功能及核心肠道菌群 | 第14-16页 |
1.3 影响肠道菌群群落结构的因素 | 第16-20页 |
1.3.1 基因型对肠道菌群的影响 | 第16-17页 |
1.3.2 年龄及身体质量指数(BMI)对肠道菌群的影响 | 第17-18页 |
1.3.3 饮食对肠道菌群的影响 | 第18-20页 |
1.3.4 抗生素对肠道菌群的影响 | 第20页 |
1.4 肠道菌群与疾病 | 第20-21页 |
1.5 分子生物学与生物信息学技术在肠道菌群研究中的应用 | 第21-25页 |
1.6 蒙古族历史及生活习俗概述 | 第25-26页 |
1.7 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
2 材料和方法 | 第27-36页 |
2.1 材料 | 第27-32页 |
2.1.1 样品来源 | 第27-30页 |
2.1.2 本试验选用的参考菌株及扩增引物 | 第30-32页 |
2.1.3 本研究采用的试剂盒及常用试剂 | 第32页 |
2.1.4 仪器设备 | 第32页 |
2.2 试验方法 | 第32-36页 |
2.2.1 粪便样品采集及保存 | 第32页 |
2.2.2 粪便中细菌宏基因组DNA的提取 | 第32-33页 |
2.2.3 细菌16S rRNA V1-V3可变区扩增 | 第33页 |
2.2.4 PCR产物纯化、平衡及测序 | 第33-34页 |
2.2.5 高质量序列的提取 | 第34页 |
2.2.6 测序结果的生物信息学处理 | 第34-35页 |
2.2.7 肠道常见菌属的荧光定量(q-PCR)研究 | 第35-36页 |
2.2.8 数据的统计分析及图表绘制 | 第36页 |
2.2.9 核酸序列登录号 | 第36页 |
3 结果与分析 | 第36-92页 |
3.1 测序深度及样品测序量说明 | 第36-43页 |
3.2 蒙古族肠道菌群构成 | 第43-47页 |
3.2.1 蒙古族肠道菌群在门水平上的构成 | 第43-45页 |
3.2.2 蒙古族肠道菌群在属水平上的构成 | 第45-47页 |
3.3 蒙古族健康志愿者核心肠道菌群及其功能与代谢通路研究 | 第47-53页 |
3.4 肯特牧区,中央省和乌兰巴托市蒙古族志愿者肠道菌群差异性分析 | 第53-72页 |
3.4.1 基于α多样性的3地健康志愿者肠道菌群比较分析 | 第53-64页 |
3.4.2 基于β多样性的3地健康志愿者肠道菌群比较分析 | 第64-69页 |
3.4.3 基于菌属水平的3地健康志愿者肠道菌群差异性分析 | 第69-72页 |
3.5 乌兰巴托市、中央省及肯特牧区蒙古族居民饮食调查 | 第72-74页 |
3.6 饮食变化对蒙古族志愿者肠道菌群的影响 | 第74-90页 |
3.6.1 肯特牧区蒙古族志愿者一年四季肠道菌群多样性变化 | 第75-80页 |
3.6.2 乌兰巴托地区蒙古族志愿者一年四季肠道菌群多样性变化 | 第80-85页 |
3.6.3 中央省蒙古族志愿者一年四季肠道菌群多样性变化 | 第85-89页 |
3.6.4 基于α多样性四季饮食变换对蒙古族肠道菌群的影响 | 第89-90页 |
3.7 饮食与肠道菌群关联性分析 | 第90-92页 |
4 讨论 | 第92-97页 |
致谢 | 第97-98页 |
参考文献 | 第98-109页 |
附录 | 第109-117页 |
作者简介 | 第117-119页 |