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蒙古族肠道核心菌群及其与饮食关联性研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略语表第12-13页
1 前言第13-27页
    1.1 健康人肠道菌群构成第13-14页
    1.2 健康人肠道菌群的构成、功能及核心肠道菌群第14-16页
    1.3 影响肠道菌群群落结构的因素第16-20页
        1.3.1 基因型对肠道菌群的影响第16-17页
        1.3.2 年龄及身体质量指数(BMI)对肠道菌群的影响第17-18页
        1.3.3 饮食对肠道菌群的影响第18-20页
        1.3.4 抗生素对肠道菌群的影响第20页
    1.4 肠道菌群与疾病第20-21页
    1.5 分子生物学与生物信息学技术在肠道菌群研究中的应用第21-25页
    1.6 蒙古族历史及生活习俗概述第25-26页
    1.7 本研究的目的和意义第26-27页
2 材料和方法第27-36页
    2.1 材料第27-32页
        2.1.1 样品来源第27-30页
        2.1.2 本试验选用的参考菌株及扩增引物第30-32页
        2.1.3 本研究采用的试剂盒及常用试剂第32页
        2.1.4 仪器设备第32页
    2.2 试验方法第32-36页
        2.2.1 粪便样品采集及保存第32页
        2.2.2 粪便中细菌宏基因组DNA的提取第32-33页
        2.2.3 细菌16S rRNA V1-V3可变区扩增第33页
        2.2.4 PCR产物纯化、平衡及测序第33-34页
        2.2.5 高质量序列的提取第34页
        2.2.6 测序结果的生物信息学处理第34-35页
        2.2.7 肠道常见菌属的荧光定量(q-PCR)研究第35-36页
        2.2.8 数据的统计分析及图表绘制第36页
        2.2.9 核酸序列登录号第36页
3 结果与分析第36-92页
    3.1 测序深度及样品测序量说明第36-43页
    3.2 蒙古族肠道菌群构成第43-47页
        3.2.1 蒙古族肠道菌群在门水平上的构成第43-45页
        3.2.2 蒙古族肠道菌群在属水平上的构成第45-47页
    3.3 蒙古族健康志愿者核心肠道菌群及其功能与代谢通路研究第47-53页
    3.4 肯特牧区,中央省和乌兰巴托市蒙古族志愿者肠道菌群差异性分析第53-72页
        3.4.1 基于α多样性的3地健康志愿者肠道菌群比较分析第53-64页
        3.4.2 基于β多样性的3地健康志愿者肠道菌群比较分析第64-69页
        3.4.3 基于菌属水平的3地健康志愿者肠道菌群差异性分析第69-72页
    3.5 乌兰巴托市、中央省及肯特牧区蒙古族居民饮食调查第72-74页
    3.6 饮食变化对蒙古族志愿者肠道菌群的影响第74-90页
        3.6.1 肯特牧区蒙古族志愿者一年四季肠道菌群多样性变化第75-80页
        3.6.2 乌兰巴托地区蒙古族志愿者一年四季肠道菌群多样性变化第80-85页
        3.6.3 中央省蒙古族志愿者一年四季肠道菌群多样性变化第85-89页
        3.6.4 基于α多样性四季饮食变换对蒙古族肠道菌群的影响第89-90页
    3.7 饮食与肠道菌群关联性分析第90-92页
4 讨论第92-97页
致谢第97-98页
参考文献第98-109页
附录第109-117页
作者简介第117-119页

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