| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| Chapter 1 Review | 第11-21页 |
| 1.1 Intestinal microbiota | 第11-15页 |
| 1.1.1 Formation process of intestinal microbiota | 第11页 |
| 1.1.2 The distribution of intestinal microbiota | 第11-12页 |
| 1.1.3 Functions of intestinal microflora | 第12-13页 |
| 1.1.4 Intestinal microbiota and disease | 第13-15页 |
| 1.2 Methods for Analysis of the Intestinal Microflora | 第15-17页 |
| 1.2.1 Classical approaches | 第15-16页 |
| 1.2.2 Molecular technologies | 第16-17页 |
| 1.3 Research progress of amphibian intestinal microbiota | 第17-18页 |
| 1.4 Chemical pollutant cadmium | 第18-21页 |
| 1.4.1 Sources of cadmium in the environment | 第18-19页 |
| 1.4.2 The effects of cadmium on amphibians | 第19页 |
| 1.4.3 Effects of cadmium on gut microbiota | 第19-21页 |
| Chapter 2 Comparative analysis of intestinal bacterial communities of threetadpole species | 第21-33页 |
| 2.1 Introduction | 第21-22页 |
| 2.2 Materials and methods | 第22-24页 |
| 2.2.1 Animals collection | 第22页 |
| 2.2.2 Sampling procedures | 第22-23页 |
| 2.2.3 DNA extraction and high-throughput sequencing | 第23-24页 |
| 2.2.4 Statistical analyses | 第24页 |
| 2.3 Results | 第24-30页 |
| 2.3.1 General analyses of the dataset and diversity estimates | 第24-25页 |
| 2.3.2 OTU distribution among three tadpole species | 第25-26页 |
| 2.3.3 Composition of Bacterial Community | 第26-28页 |
| 2.3.4 Relationships among three tadpole species gut bacterial communities | 第28-30页 |
| 2.4 Discussion | 第30-33页 |
| Chapter 3 Changes in intestinal microbiota of Rana chensinensis duringmetamorphosis | 第33-49页 |
| 3.1 Introduction | 第33-34页 |
| 3.2 Materials and methods | 第34-37页 |
| 3.2.1 Animals and sample collection | 第34-35页 |
| 3.2.2 Tadpole and intestinal morphology | 第35页 |
| 3.2.3 Genomic DNA extraction and PCR amplification | 第35-36页 |
| 3.2.4 DNA sequencing and processing of sequencing data | 第36-37页 |
| 3.2.5 Statistical analyses | 第37页 |
| 3.3 Results | 第37-44页 |
| 3.3.1 Tadpole Morphological measurement | 第37-38页 |
| 3.3.2 Sequencing depth and taxonomic diversity of intestinal microbiota | 第38-40页 |
| 3.3.3 OTUs distribution across different developmental stages | 第40-41页 |
| 3.3.4 Composition of the intestinal microbiota at various taxonomic levels | 第41-43页 |
| 3.3.5 Comparison of dominant bacterial communities between pre-metamorphosis(G26 and G32) and metamorphosis (G42 and G46) | 第43页 |
| 3.3.6 Effects of morphological changes on intestinal microbiota | 第43-44页 |
| 3.4 Discussion | 第44-49页 |
| Chapter 4 The effect of cadmium exposure on diversity of intestinalmicrobial community of Rana chensinensis tadpoles | 第49-65页 |
| 4.1 Introduction | 第49-50页 |
| 4.2 Material and methods | 第50-54页 |
| 4.2.1 Animals husbandry | 第50-51页 |
| 4.2.2 Cadmium exposure | 第51页 |
| 4.2.3 Sample collection | 第51-52页 |
| 4.2.4 DNA extraction and PCR amplification | 第52页 |
| 4.2.5 Illumina Miseq and sequence processing | 第52-53页 |
| 4.2.6 Statistical analyses | 第53-54页 |
| 4.3 Results | 第54-60页 |
| 4.3.1 Sequencing and Classification | 第54-56页 |
| 4.3.2 OTU Distribution under Different Cadmium Concentration Exposure | 第56-57页 |
| 4.3.3 Composition of the intestinal microbiota at various taxonomic levels | 第57-59页 |
| 4.3.4 Comparison of dominant microbial communities among three exposure groups | 第59-60页 |
| 4.4 Discussion | 第60-65页 |
| Chapter 5 Conclusion | 第65-67页 |
| References | 第67-85页 |
| 致谢 | 第85-87页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第87页 |
