基于有限元模型的肿瘤细胞生长的模拟计算及并行化研究
摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-16页 |
1.1 研究意义 | 第10-11页 |
1.2 国内外研究现状 | 第11-14页 |
1.2.1 连续细胞模型 | 第11-13页 |
1.2.2 离散的细胞模型 | 第13-14页 |
1.2.3 肿瘤生长模拟的并行化 | 第14页 |
1.3 主要研究工作和内容 | 第14-15页 |
1.4 论文组织框架 | 第15页 |
1.5 本章小结 | 第15-16页 |
第二章 相关理论知识及技术研究 | 第16-30页 |
2.1 有限元方法 | 第16-17页 |
2.2 网格划分 | 第17-22页 |
2.2.1 有限元网格划分原则及方法 | 第17-19页 |
2.2.2 Delaunay 三角剖分 | 第19-21页 |
2.2.3 三角网格的正则度 | 第21-22页 |
2.3 非线性方程组的数值求解 | 第22-24页 |
2.4 并行计算 | 第24-28页 |
2.4.1 并行编程模型 | 第24-25页 |
2.4.2 有限元并行方法 | 第25-28页 |
2.5 HYPRE 并行库介绍 | 第28-29页 |
2.6 本章小结 | 第29-30页 |
第三章 肿瘤生长模拟计算设计 | 第30-53页 |
3.1 无血管肿瘤生长的有限元模型 | 第30-34页 |
3.1.1 肿瘤生长能量公式 | 第30-31页 |
3.1.2 肿瘤生长的有限元建模 | 第31-34页 |
3.2 细胞生长模拟 | 第34-38页 |
3.2.1 系统方程的装配 | 第34-36页 |
3.2.2 非线性方程求解 | 第36-38页 |
3.3 细胞分裂模拟 | 第38-41页 |
3.4 有限元网格处理 | 第41-52页 |
3.4.1 网格处理评价标准 | 第41页 |
3.4.2 网格细化 | 第41-43页 |
3.4.3 网格优化 | 第43-45页 |
3.4.4 分裂面网格重三角化 | 第45-52页 |
3.5 本章小结 | 第52-53页 |
第四章 肿瘤生长模拟计算实现 | 第53-63页 |
4.1 模拟计算系统框架 | 第53-56页 |
4.2 模拟计算流程 | 第56-57页 |
4.3 并行计算框架 | 第57-61页 |
4.4 本章小结 | 第61-63页 |
第五章 实验结果及分析 | 第63-73页 |
5.1 实验环境 | 第63-64页 |
5.2 肿瘤生长模拟 | 第64-69页 |
5.2.1 单细胞生长分裂模拟 | 第64-66页 |
5.2.2 多细胞生长模拟 | 第66-68页 |
5.2.3 细胞生长周期实验 | 第68-69页 |
5.3 网格处理效果实验 | 第69-70页 |
5.4 并行计算性能测试 | 第70-72页 |
5.5 本章小结 | 第72-73页 |
总结与展望 | 第73-75页 |
参考文献 | 第75-79页 |
攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第79-80页 |
致谢 | 第80-81页 |
附件 | 第81页 |