| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第1章 前言 | 第13-23页 |
| 1.1 细菌的致病性及其影响因素 | 第13-15页 |
| 1.1.1 细菌的致病性 | 第13页 |
| 1.1.2 细菌致病性的影响因素 | 第13-15页 |
| 1.1.2.1 侵袭力 | 第13-14页 |
| 1.1.2.2 细菌毒素 | 第14页 |
| 1.1.2.3 细菌侵入的数量 | 第14页 |
| 1.1.2.4 细菌侵入机体的途径 | 第14-15页 |
| 1.2 副溶血性弧菌的生物学特性及其主要毒力因子 | 第15-19页 |
| 1.2.1 生物学特性 | 第15-16页 |
| 1.2.2 副溶血弧菌的主要毒力因子 | 第16-19页 |
| 1.2.2.1 溶血毒素 | 第16-17页 |
| 1.2.2.2 粘附因子 | 第17-18页 |
| 1.2.2.3 胞外蛋白酶 | 第18页 |
| 1.2.2.4 尿素酶(Ure) | 第18页 |
| 1.2.2.5 Ⅲ型分泌系统 | 第18-19页 |
| 1.2.2.6 其他毒力因子 | 第19页 |
| 1.3 碱基突变对生物性状的影响 | 第19-21页 |
| 1.3.1 碱基突变的诱因 | 第19-20页 |
| 1.3.2 碱基突变对生物个体的影响 | 第20-21页 |
| 1.4 技术路线、研究内容及意义 | 第21-23页 |
| 1.4.1 技术路线 | 第21页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第21-22页 |
| 1.4.2.1 菌株鉴定、筛选及毒力评价 | 第21页 |
| 1.4.2.2 基因组测序、分析及差异位点分析 | 第21-22页 |
| 1.4.2.3 全基因组中毒力基因分析及其与突变位点相关基因的差异表达分析 | 第22页 |
| 1.4.3 研究意义 | 第22-23页 |
| 第2章 菌株鉴定、筛选及毒力评价 | 第23-41页 |
| 2.1 引言 | 第23页 |
| 2.2 材料与仪器 | 第23-24页 |
| 2.2.1 菌种与材料 | 第23-24页 |
| 2.2.2 仪器与设备 | 第24页 |
| 2.3 实验方法 | 第24-30页 |
| 2.3.1 菌株的分离与培养 | 第24-25页 |
| 2.3.2 生化鉴定 | 第25页 |
| 2.3.3 细菌总DNA的提取及PCR验证 | 第25-26页 |
| 2.3.4 系统发育树的构建及在线比对 | 第26页 |
| 2.3.5 生长曲线的绘制 | 第26-27页 |
| 2.3.6 耐压菌株的筛选 | 第27页 |
| 2.3.7 菌株体外毒力测定 | 第27-28页 |
| 2.3.7.1 溶血性测定 | 第27页 |
| 2.3.7.2 生物被膜形成能力测定 | 第27-28页 |
| 2.3.8 菌株体内毒力测定 | 第28-30页 |
| 2.3.8.1 小鼠急性毒性实验 | 第28-29页 |
| 2.3.8.2 小鼠肝脏与脾脏组织切片和HE染色 | 第29-30页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第30-39页 |
| 2.4.1 生化鉴定结果 | 第30-31页 |
| 2.4.2 基因型鉴定结果 | 第31-34页 |
| 2.4.3 耐压菌株的筛选结果及菌株的生长曲线 | 第34-35页 |
| 2.4.4 菌株体外毒力测定结果 | 第35-36页 |
| 2.4.4.1 溶血性测定结果 | 第35-36页 |
| 2.4.4.2 生物被膜形成能力的比较 | 第36页 |
| 2.4.5 菌株体内毒力测定结果 | 第36-39页 |
| 2.4.5.1 小鼠急性毒性实验 | 第36-37页 |
| 2.4.5.2 病理组织学变化 | 第37-39页 |
| 2.5 本章小结 | 第39-41页 |
| 第3章 基因组测序及分析 | 第41-56页 |
| 3.1 引言 | 第41页 |
| 3.2 材料与仪器 | 第41-42页 |
| 3.2.1 菌株与材料 | 第41页 |
| 3.2.2 仪器与设备 | 第41-42页 |
| 3.3 实验方法 | 第42-45页 |
| 3.3.1 基因组DNA的提取及检测 | 第42页 |
| 3.3.2 基因组测序和预处理 | 第42页 |
| 3.3.3 基因组拼接、预测和注释 | 第42-43页 |
| 3.3.4 构建全基因组的系统发育树 | 第43-44页 |
| 3.3.5 COG分类 | 第44页 |
| 3.3.6 两株菌全基因组差异位点分析 | 第44-45页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第45-55页 |
| 3.4.1 DNA样品质量检测结果 | 第45-46页 |
| 3.4.2 reads质量满足基因组分析 | 第46-48页 |
| 3.4.3 基因组拼接结果和预测 | 第48-50页 |
| 3.4.4 C4菌株的进化分析 | 第50-51页 |
| 3.4.5 基因的COG分类 | 第51-53页 |
| 3.4.6 非编码区基因位点发生突变 | 第53-55页 |
| 3.5 本章总结 | 第55-56页 |
| 第4章 毒力基因及突变位点相关基因的差异表达分析 | 第56-68页 |
| 4.1 引言 | 第56页 |
| 4.2 材料与仪器 | 第56-57页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第56-57页 |
| 4.2.2 仪器与设备 | 第57页 |
| 4.3 实验方法 | 第57-60页 |
| 4.3.1 基因组中毒力相关基因分析 | 第57页 |
| 4.3.2 全基因组RNA的提取 | 第57页 |
| 4.3.3 RNA中基因组DNA的去除 | 第57-58页 |
| 4.3.4 cDNA的合成 | 第58页 |
| 4.3.5 实时荧光定量PCR | 第58-60页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第60-67页 |
| 4.4.1 菌株中毒力相关基因的分布 | 第60-64页 |
| 4.4.2 主要毒力因子的差异表达 | 第64-65页 |
| 4.4.3 突变位点邻近基因的差异表达 | 第65-67页 |
| 4.5 本章总结 | 第67-68页 |
| 第5章 结论、创新点与展望 | 第68-71页 |
| 5.1 结论 | 第68-69页 |
| 5.2 创新点 | 第69页 |
| 5.3 展望 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-77页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |