摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
Chapter 1 Introduction | 第11-31页 |
1.1 ER stress | 第11-13页 |
1.1.1 Defenition of ER stress | 第11页 |
1.1.2 Disturbance of ER function | 第11页 |
1.1.3 Homeostasis of Disturbed ER | 第11-12页 |
1.1.4 Downstream effects of Disturbed ER functions | 第12页 |
1.1.5 Quality Control Process | 第12页 |
1.1.6 Signal Transduction Pathways involved in UPR | 第12-13页 |
1.2 The UPR | 第13-17页 |
1.2.1 ATF6 | 第13页 |
1.2.2 IRE1α | 第13-14页 |
1.2.3 PERK | 第14-15页 |
1.2.4 Sustained ER stress and apoptosis | 第15-17页 |
1.3 miRNAs-An overview | 第17-20页 |
1.4 Important Proteins of RNAi pathway | 第20-22页 |
1.4.1 Drosha | 第20页 |
1.4.2 DGCR8 | 第20页 |
1.4.3 Dicer | 第20-21页 |
1.4.4 Argonnate Proteins | 第21页 |
1.4.5 GW 182 proteins | 第21-22页 |
1.5 miR-3648-An overview | 第22-24页 |
1.6 miRNAs and ER stress | 第24-27页 |
1.7 APC2-An overview | 第27-31页 |
Chapter 2 Materials and Methods | 第31-51页 |
2.1 Cell lines | 第31页 |
2.2 Antibodies | 第31-32页 |
2.3 Primers for plasmid construction | 第32-33页 |
2.4 Primers for qRT-PCR | 第33页 |
2.5 Probes | 第33页 |
2.6 Antsense oligonucleotides | 第33-34页 |
2.7 Methods | 第34-50页 |
2.7.1 Bioinformatic Analysis | 第34页 |
2.7.2 Construction of plasmids | 第34-37页 |
2.7.3 The culturing and subculturing of cells | 第37页 |
2.7.4 Plasmid transfections | 第37-38页 |
2.7.5 Antagomir transfections | 第38页 |
2.7.6 TG,TM,H_2O_2 and UV treatments | 第38-39页 |
2.7.7 RNA extraction | 第39页 |
2.7.8 Dnasel Treatment | 第39-40页 |
2.7.9 RNA precipitation | 第40页 |
2.7.10 cDNA synthesis | 第40-41页 |
2.7.11 Real-Time-PCR | 第41页 |
2.7.12 Protein sample preparation for western blotting | 第41-42页 |
2.7.13 Western Blotting | 第42-45页 |
2.7.14 miRNA isolation | 第45-46页 |
2.7.15 Northern Blot | 第46-48页 |
2.7.16 Luciferase Reporter Assays | 第48-49页 |
2.7.17 Colonogenic assay | 第49页 |
2.7.18 Soft agar assays | 第49-50页 |
2.7.19 MTT Assays | 第50页 |
2.8 Reproducibility of Results | 第50页 |
2.9 Statistical Analysis | 第50-51页 |
Chapter 3 Results | 第51-73页 |
3.1 Upregulation of miR-3648 upon ER stress | 第51-53页 |
3.2 Induction of miR-3648 at transcriptional level | 第53-54页 |
3.3 Expression pattern of miR-3648 in human cell lines | 第54-55页 |
3.4 miR-3648 binding with 3'UTR of mRNAs | 第55-58页 |
3.4.1 Bioinformatic Analysis | 第55-56页 |
3.4.2 miR -3648 directly targeted the 3'UTR of APC2 | 第56-57页 |
3.4.3 Luciferase activity is unaffected after mutating the 3'UTR of APC2 | 第57-58页 |
3.5 Downregulation of APC2 after overexpressing miR-3648 | 第58-59页 |
3.6 Upregulation of APC2 after inhibiting miR-3648 | 第59-60页 |
3.7 miR-3648 regulated APC2 via ER stress | 第60-64页 |
3.7.1 Down regulation of APC2 with ER stress | 第60-61页 |
3.7.2 APC2 is downregulated with miR-3648 overexpression followed by ER stress | 第61-62页 |
3.7.3 APC2 levels are regulated with miR-3648 inhibition followed by ER stress | 第62-63页 |
3.7.4 ER stress decreased the Luciferase activity | 第63-64页 |
3.8 Wnt/β-catenin responsive genes are induced upon ER stress | 第64-65页 |
3.9 Relationship of miR-3648 and APC2 with H_2O_2 and UV stress | 第65-66页 |
3.10 miR-3648 modulation affected cell growth | 第66-67页 |
3.11 miR-3648 modulation affected colony formation | 第67-69页 |
3.12 miR-3648 modulation affected anchorage independent growth of cells | 第69-71页 |
3.13 Graphical Presentation of the Thesis | 第71-73页 |
Chapter 4 Discussions | 第73-75页 |
4.2 Conclusions | 第74-75页 |
Chapter 5 References | 第75-83页 |
Acknowledgements | 第83-85页 |
List of Publications | 第85页 |