蛋白质关系网络中的络合物发现算法的研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-14页 |
| ·研究背景 | 第9页 |
| ·络合物发现的研究现状 | 第9-12页 |
| ·基于密度的方法 | 第9-10页 |
| ·层次聚类算法 | 第10-11页 |
| ·图切割算法 | 第11页 |
| ·基于核心-附属结构的方法 | 第11-12页 |
| ·存在问题及解决 | 第12页 |
| ·本文工作 | 第12-13页 |
| ·本文结构 | 第13-14页 |
| 2 蛋白质关系网络性质及应用 | 第14-19页 |
| ·复杂网络的特征及度量指标 | 第14-15页 |
| ·蛋白质关系网络的性质 | 第15-17页 |
| ·蛋白质关系网络中的应用 | 第17-18页 |
| ·本章小结 | 第18-19页 |
| 3 基于core结构融合的络合物发现算法 | 第19-28页 |
| ·三种网络网络介绍 | 第19-20页 |
| ·算法流程 | 第20-22页 |
| ·基于三种网络的候选core抽取 | 第20-21页 |
| ·候完备候选core集合 | 第21页 |
| ·过滤候选core集合 | 第21页 |
| ·判定attachment蛋白质 | 第21-22页 |
| ·实验设计 | 第22-26页 |
| ·结果分析 | 第26页 |
| ·本章小结 | 第26-28页 |
| 4 基于监督学习络合物发现算法 | 第28-51页 |
| ·特征设计 | 第28-29页 |
| ·权重网络构建 | 第29-30页 |
| ·Regression模型 | 第30-31页 |
| ·算法流程 | 第31-34页 |
| ·构造训练集训练模型 | 第32-33页 |
| ·完全子图发现算法 | 第33页 |
| ·完全子图的扩张 | 第33页 |
| ·候选络合物过滤 | 第33-34页 |
| ·语料来源和评价指标 | 第34-37页 |
| ·实验语料来源 | 第34-35页 |
| ·评价指标 | 第35-37页 |
| ·实验描述及实验结果 | 第37-50页 |
| ·不同参数间的结果对比 | 第37-41页 |
| ·不同特征集的结果对比 | 第41-44页 |
| ·与其他方法的对比 | 第44-47页 |
| ·预测结果的统计学检验 | 第47-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |