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决明种子转录组学分析及胰蛋白酶抑制剂基因的克隆与功能研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第1章 绪论第15-22页
    1.1 决明的生物学特性第15-16页
    1.2 决明子的药理学作用第16-18页
        1.2.1 降血脂作用第16页
        1.2.2 降压作用第16-17页
        1.2.3 保肝作用第17页
        1.2.4 抑菌作用第17页
        1.2.5 对免疫系统作用第17页
        1.2.6 明目作用第17-18页
        1.2.7 其它作用第18页
    1.3 决明的生物活性成分第18-19页
        1.3.1 蒽醌第18页
        1.3.2 黄酮类第18页
        1.3.3 蛋白质和氨基酸第18页
        1.3.4 脂肪和脂肪酸第18-19页
        1.3.5 胰蛋白酶抑制剂第19页
        1.3.6 其它成分第19页
    1.4 决明的生物活性成分相关基因第19-20页
    1.5 转录组测序第20页
    1.6 本文的研究目的和意义第20-22页
第2章 决明种子转录组学分析第22-51页
    2.1 材料与方法第22-24页
        2.1.1 植物材料第22页
        2.1.2 决明种子RNA的提取第22页
        2.1.3 转录组测序第22-23页
        2.1.4 序列组装第23页
        2.1.5 基因表达分析第23页
        2.1.6 基因功能注释、GO分类和代谢路径分析第23-24页
        2.1.7 SSR检测与引物设计第24页
    2.2 结果与讨论第24-49页
        2.2.1 决明种子RNA提取第24-25页
        2.2.2 决明种子转录组组装第25-26页
        2.2.3 基于对公共数据库检索的功能注释第26-31页
        2.2.4 决明转录组中蒽醌生物合成及调控相关基因第31-38页
        2.2.5 萜类生物合成基因第38-42页
        2.2.6 黄酮类化合物生物合成基因第42-45页
        2.2.7 脂类生物合成相关基因第45-48页
        2.2.8 脂转移蛋白第48页
        2.2.9 SSR第48-49页
    2.4 本章小结第49-51页
第3章 决明定量PCR内参基因的选择与评价第51-69页
    3.1 材料与方法第51-53页
        3.1.1 植物组织的准备第51-52页
        3.1.2 生长激素和非生物胁迫第52页
        3.1.3 决明总RNA的提取与cDNA的制备第52页
        3.1.4 引物设计和标准曲线分析第52页
        3.1.5 qPCR扩增第52-53页
        3.1.6 决明候选内参基因稳定性分析第53页
        3.1.7 WRKY基因在不同组织和不同胁迫条件下的表达水平分析第53页
    3.2 结果与分析第53-67页
        3.2.1 RNA的提取第53-54页
        3.2.2 候选内参基因的选择和引物设计第54页
        3.2.3 决明内参候选基因的引物特异性与扩增效率第54-57页
        3.2.4 决明内参基因的初步筛选第57-58页
        3.2.5 决明内参候选基因的表达谱第58-59页
        3.2.6 内参候选基因表达稳定性分析第59-66页
        3.2.7 WRKY基因在不同决明组织以及不同胁迫条件下的表达水平分析第66-67页
    3.3 本章小结第67-69页
第4章 决明胰蛋白酶抑制剂基因CoTI1的克隆、结构建模及功能鉴定第69-93页
    4.1 材料与方法第69-74页
        4.1.1 CoTI1的3'RACE第69-70页
        4.1.2 CoTI1 CDS全长克隆第70-71页
        4.1.3 CoTI1序列分析与分子建模第71页
        4.1.4 CoTI1原核表达载体的构建第71-72页
        4.1.5 CoTI1原核表达第72页
        4.1.6 CoTI1蛋白纯化第72页
        4.1.7 CoTI1活性检测第72-73页
        4.1.8 CoTI1定点突变第73-74页
        4.1.9 CoTI1表达模式分析第74页
    4.2 结果与讨论第74-91页
        4.2.1 CoTI1 cDNA的克隆第74-75页
        4.2.2 CoTI1氨基酸序列分析第75-76页
        4.2.3 CoTI1序列比对分析第76页
        4.2.4 CoTI1系统发育分析第76-77页
        4.2.5 CoTI1的结构建模第77-80页
        4.2.6 CoTI1与胰蛋白酶的相互作用分析第80页
        4.2.7 CoTI1原核表达载体的构建第80-84页
        4.2.8 CoTI1原核表达第84-85页
        4.2.9 CoTI1蛋白纯化第85-86页
        4.2.10 CoTI1原核表达蛋白的活性检测第86-87页
        4.2.11 CoTI1的定点突变第87-90页
        4.2.12 CoTI1的表达模式分析第90-91页
    4.3 本章小结第91-93页
第5章 决明莽草酸激酶基因CoSK的克隆、结构建模和表达模式第93-109页
    5.1 材料与方法第93-95页
        5.1.1 CoSK的3'RACE第93-94页
        5.1.2 CoSK的5'RACE第94页
        5.1.3 CoSK的CDS全长克隆第94页
        5.1.4 CoSK序列分析与分子建模第94-95页
        5.1.5 CoSK表达模式分析第95页
    5.2 结果与讨论第95-107页
        5.2.1 CoSK的克隆和序列分析第95-97页
        5.2.2 CoSK氨基酸序列分析第97页
        5.2.3 CoSK系统发育分析第97-98页
        5.2.4 CoSK序列比对分析第98页
        5.2.5 CoSK的转运肽和亚细胞定位第98-99页
        5.2.6 CoSK分子建模第99-101页
        5.2.7 CoSK的不稳定性第101-104页
        5.2.8 CoSK和底物的相互作用分析第104-105页
        5.2.9 CoSK可能的催化机制第105-106页
        5.2.10 CoSK的组织表达模式第106-107页
        5.2.11 CoSK下游代谢产物的转运第107页
    5.3 本章小结第107-109页
第6章 决明巴豆酰辅酶A羧化酶基因MCCase的克隆、序列分析和表达模式第109-119页
    6.1 材料与方法第109-111页
        6.1.1 决明MCCase的3'RACE第109-110页
        6.1.2 决明MCCase的5'RACE第110页
        6.1.3 决明MCCase的CDS全长克隆第110-111页
        6.1.4 决明MCCase的序列分析第111页
        6.1.5 决明MCCase的组织差异表达分析第111页
    6.2 结果与讨论第111-118页
        6.2.1 决明MCCase cDNA的克隆第111-112页
        6.2.2 决明MCCase氨基酸序列分析第112-113页
        6.2.3 决明MCCase系统发育分析第113-114页
        6.2.4 决明MCCase序列比对分析第114-115页
        6.2.5 决明MCCase三级结构预测第115-117页
        6.2.6 决明MCCase组织差异表达分析第117-118页
    6.3 本章小结第118-119页
结论第119-121页
参考文献第121-130页
致谢第130-131页
攻读硕士学位期间发表的学术论文及科研成果第131页

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