| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 中英文缩略词表 | 第13-15页 |
| 前言 | 第15-18页 |
| 第1章 NDM-1 基因流行状况的研究 | 第18-27页 |
| 引言 | 第18页 |
| 材料与方法 | 第18-21页 |
| 1.材料 | 第18-20页 |
| 1.1 临床标本收集 | 第18-19页 |
| 1.2 主要试剂 | 第19页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第19页 |
| 1.4 本研究所用试剂配方方法 | 第19-20页 |
| 2 研究方法 | 第20-21页 |
| 2.1 bla_(NDM-1) 基因筛查 | 第20-21页 |
| 2.2 细菌鉴定及药物敏感性试验 | 第21页 |
| 结果 | 第21-25页 |
| 1. bla_(NDM-1) 基因筛选结果 | 第21-22页 |
| 2. bla_(NDM-1) 基因阳性菌株药敏实验结果 | 第22-23页 |
| 3. 碳青霉烯酶表型筛选改良Hodge实验结果 | 第23-24页 |
| 4. bla_(NDM-1) 基因阳性菌株患者的临床资料 | 第24-25页 |
| 讨论 | 第25-27页 |
| 第2章 NDM-1 耐药菌株感染的危险因素和预后分析 | 第27-38页 |
| 引言 | 第27页 |
| 材料与方法 | 第27-28页 |
| 1.材料 | 第27-28页 |
| 1.1 病例组和对照组 | 第27页 |
| 1.2 菌株来源 | 第27-28页 |
| 2.方法 | 第28页 |
| 结果 | 第28-36页 |
| 1 三组患者人群感染菌株的药物敏感性 | 第28-29页 |
| 2 三组病例科室、性别及年龄分布 | 第29-30页 |
| 3 三组病例的住院时间、基础疾病、危险因素、临床结局等资料的比较 | 第30-36页 |
| 讨论 | 第36-38页 |
| 第3章 质粒编码NDM-1 酶的传播特征和周围基因环境 | 第38-63页 |
| 引言 | 第38页 |
| 材料和方法 | 第38-49页 |
| 1.实验材料 | 第38-41页 |
| 1.1 菌株来源 | 第38页 |
| 1.2 主要试剂及器材 | 第38-39页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第39页 |
| 1.4 本研究所用试剂配方方法 | 第39-41页 |
| 2 研究方法 | 第41-49页 |
| 2.1 运用Southern blot技术对含bla_(NDM-1)基因质粒进行定位分析 | 第41-45页 |
| 2.2 质粒接合试验 | 第45-46页 |
| 2.3 质粒DNA高通量测序 | 第46-47页 |
| 2.4 测序序列质量评价及统计 | 第47页 |
| 2.5 质粒基因组的拼装 | 第47-48页 |
| 2.6 比较基因组分析 | 第48-49页 |
| 结果 | 第49-60页 |
| 1 含bla_(NDM-1)基因菌株质粒提取情况 | 第49-50页 |
| 2 Southern blot对含bla_(NDM-1)质粒进行定位结果 | 第50-51页 |
| 3 质粒接合实验结果 | 第51页 |
| 4 质粒基因组测序 | 第51-54页 |
| 4.1 质粒基因组建库结果 | 第51-52页 |
| 4.2 质粒测序质量评价 | 第52-53页 |
| 4.3 质粒基因组拼装 | 第53页 |
| 4.4 质粒基因组注释 | 第53-54页 |
| 5 质粒基因组比较 | 第54-60页 |
| 5.1 p11106与p12与pNDM-BTR比较 | 第55页 |
| 5.2 p11106和p12与pSARB26_02 比较 | 第55-56页 |
| 5.3 p11106和p12与pKOX105（HM126016）基因组比较 | 第56-57页 |
| 5.4 p11106和p12与pMR3-OXA181（KM660724）基因组比较 | 第57页 |
| 5.5 p11106和p12与pIMP-SH1506（KT989598）基因组比较 | 第57-58页 |
| 5.6 p11106和p12与pIMP-FJ1503（KU051710）基因组比较 | 第58页 |
| 5.7 p11106和p12与pIMP-KP1495（KU051710）基因组比较 | 第58-59页 |
| 5.8 质粒基因组比较总结 | 第59-60页 |
| 讨论 | 第60-63页 |
| 结论与展望 | 第63-65页 |
| 1 结论 | 第63页 |
| 2 本研究的主要创新性 | 第63-64页 |
| 3 展望 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 攻读学位期间的研究成果及荣誉 | 第71-74页 |
| 综述 | 第74-84页 |
| 参考文献 | 第82-84页 |
