| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第9-14页 |
| 文献综述 长链非编码RNA及其在生殖领域的研究进展 | 第14-26页 |
| 1 长链非编码RNA的发现 | 第14-15页 |
| 2 长链非编码RNA的分类 | 第15-16页 |
| 3 长链非编码RNA的功能 | 第16-20页 |
| 3.1 长链非编码RNA调控转录状态 | 第16页 |
| 3.2 长链非编码RNA调控DNA甲基化 | 第16-17页 |
| 3.3 长链非编码RNA调控组蛋白状态 | 第17-18页 |
| 3.4 长链非编码RNA与X染色体沉默 | 第18-19页 |
| 3.5 长链非编码RNA与基因印迹 | 第19页 |
| 3.6 长链非编码RNA调控mRNA及蛋白的稳定性 | 第19-20页 |
| 3.7 长链非编码RNA调控miRNA激活 | 第20页 |
| 4 长链非编码RNA在生殖领域的研究进展 | 第20-25页 |
| 4.1 长链非编码RNA与性激素响应 | 第20-21页 |
| 4.2 长链非编码RNA与配子发生 | 第21-22页 |
| 4.2.1 长链非编码RNA在精子发生中的作用 | 第21-22页 |
| 4.2.2 长链非编码RNA在卵子发生中的作用 | 第22页 |
| 4.3 长链非编码RNA与乳腺发育 | 第22-23页 |
| 4.4 长链非编码RNA与胎盘形成 | 第23-24页 |
| 4.5 长链非编码RNA与生殖疾病 | 第24页 |
| 4.6 长链非编码RNA与初情期启动 | 第24-25页 |
| 5 展望 | 第25-26页 |
| 引言 | 第26-28页 |
| 1 材料与方法 | 第28-40页 |
| 1.1 试验材料 | 第28-29页 |
| 1.1.1 动物饲养及样品采集时间 | 第28页 |
| 1.1.2 主要仪器 | 第28页 |
| 1.1.3 主要试剂 | 第28页 |
| 1.1.4 参考数据库及分析软件 | 第28-29页 |
| 1.2 试验方法 | 第29-34页 |
| 1.2.1 阴门开启观察 | 第29页 |
| 1.2.2 样品采集 | 第29页 |
| 1.2.3 石蜡切片制作 | 第29-30页 |
| 1.2.4 苏木素-伊红（Haematoxylin-Eosin，HE）染色 | 第30页 |
| 1.2.5 RNA提取及质量检测 | 第30-31页 |
| 1.2.6 测序文库的构建 | 第31页 |
| 1.2.7 文库质检及测序 | 第31页 |
| 1.2.8 下丘脑组织cDNA获得 | 第31-33页 |
| 1.2.9 荧光定量PCR引物 | 第33-34页 |
| 1.2.10 实时荧光定量PCR | 第34页 |
| 1.3 数据分析方法 | 第34-40页 |
| 1.3.1 原始序列数据 | 第34-35页 |
| 1.3.2 测序数据质量评估 | 第35页 |
| 1.3.3 生物信息学分析 | 第35-40页 |
| 2 结果 | 第40-58页 |
| 2.1 大鼠外阴及卵巢组织学观察 | 第40页 |
| 2.2 下丘脑组织总RNA质量 | 第40-41页 |
| 2.3 测序数据质量评估 | 第41-42页 |
| 2.4 测序数据产出 | 第42-43页 |
| 2.5 参考基因组比对分析 | 第43-45页 |
| 2.5.1 Reads与参考基因组比对情况统计 | 第43-44页 |
| 2.5.2 Reads在染色体上密度分布 | 第44-45页 |
| 2.5.3 Reads在已知基因类型的分布情况 | 第45页 |
| 2.6 RNA-seq整体质量评估 | 第45页 |
| 2.7 候选长链非编码RNA筛选 | 第45-47页 |
| 2.8 LncRNAs与mRNAs表达水平、保守性及结构比较 | 第47-48页 |
| 2.9 差异lncRNAs及mRNAs筛选 | 第48-50页 |
| 2.10 LncRNA靶基因预测 | 第50页 |
| 2.11 差异lncRNAs靶基因及mRNAs转录本GO分析 | 第50-53页 |
| 2.12 差异lncRNAs靶基因及mRNAs转录本KEGG分析 | 第53-57页 |
| 2.13 差异表达lncRNA的荧光定量PCR验证 | 第57-58页 |
| 3 讨论 | 第58-63页 |
| 3.1 试验动物选择 | 第58页 |
| 3.2 LncRNA测序方法的选择 | 第58-59页 |
| 3.3 RNA-seq测序质量 | 第59页 |
| 3.4 RNA-seq整体评估 | 第59-60页 |
| 3.5 LncRNA筛选 | 第60页 |
| 3.6 LncRNA靶基因预测 | 第60-61页 |
| 3.7 差异lncRNA靶基因及mRNA GO及KEGG富集分析 | 第61-63页 |
| 4 结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-76页 |
| 附录 | 第76-102页 |
| 致谢 | 第102-104页 |
| 个人简历 | 第104-105页 |
