| 摘要 | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-22页 |
| 1.1 欧李种质资源与育种研究进展 | 第11-13页 |
| 1.1.1 欧李概述 | 第11页 |
| 1.1.2 欧李种质资源分布与收集 | 第11页 |
| 1.1.3 欧李种质资源遗传多样性与分类 | 第11-12页 |
| 1.1.4 欧李品种选育 | 第12-13页 |
| 1.2 果实苹果酸代谢研究 | 第13-18页 |
| 1.2.1 苹果酸的特性与生理功能 | 第13页 |
| 1.2.2 果实中苹果酸代谢途径与积累模式 | 第13-14页 |
| 1.2.3 果实中苹果酸代谢关键酶及其基因研究进展 | 第14-18页 |
| 1.3 转录组学研究 | 第18-20页 |
| 1.3.1 转录组学概念 | 第18页 |
| 1.3.2 转录组学研究方法 | 第18页 |
| 1.3.3 测序技术的发展 | 第18-20页 |
| 1.3.4 转录组测序技术在高等植物上的应用 | 第20页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第20-22页 |
| 第二章 欧李果实转录组测序分析 | 第22-67页 |
| 2.1 试验材料 | 第22页 |
| 2.2 试验方法 | 第22-30页 |
| 2.2.1 试验设计 | 第22页 |
| 2.2.2 欧李果实转录组cDNA文库构建 | 第22-24页 |
| 2.2.3 欧李果实RNA-seq信息分析 | 第24-30页 |
| 2.2.3.1 测序产量统计 | 第24-25页 |
| 2.2.3.2 组装结果分析 | 第25-26页 |
| 2.2.3.3 Unigenes功能注释及COG分类 | 第26-27页 |
| 2.2.3.4 Unigene(KEGG)代谢通路分析 | 第27页 |
| 2.2.3.5 预测编码蛋白框(CDS) | 第27页 |
| 2.2.3.6 Unigene表达差异分析 | 第27-29页 |
| 2.2.3.7 差异Unigene的GO和Pathway分析 | 第29-30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-63页 |
| 2.3.1 欧李转录组测序产量统计 | 第30-31页 |
| 2.3.2 欧李转录组测序组装 | 第31-33页 |
| 2.3.3 欧李Unigene功能注释 | 第33-35页 |
| 2.3.3.1 注释结果汇总 | 第33页 |
| 2.3.3.2 NR分类 | 第33-34页 |
| 2.3.3.3 COG分类 | 第34-35页 |
| 2.3.3.4 Unigene的GO分类 | 第35页 |
| 2.3.4 欧李Unigene代谢通路分析 | 第35-40页 |
| 2.3.5 预测编码蛋白框(CDS) | 第40-42页 |
| 2.3.5.1 CDS核酸序列统计 | 第40-41页 |
| 2.3.5.2 CDS蛋白质序列 | 第41-42页 |
| 2.3.6 不同欧李品种Unigene表达差异分析 | 第42页 |
| 2.3.7 差异表达基因的GO功能分析 | 第42-51页 |
| 2.3.7.1 差异表达基因的GO功能分类 | 第42-44页 |
| 2.3.7.2 差异表达基因的GO功能富集 | 第44-51页 |
| 2.3.8 差异表达基因的Pathway分析 | 第51-60页 |
| 2.3.9 欧李Unigene SSR分析 | 第60-63页 |
| 2.3.9.1 SSR分布 | 第60页 |
| 2.3.9.2 转录组SSR基序重复类型 | 第60-63页 |
| 2.3.10 苹果酸代谢途径的Unigene筛选与表达差异分析 | 第63页 |
| 2.4 讨论 | 第63-67页 |
| 第三章 欧李果实苹果酸积累关键酶基因的克隆与序列分析 | 第67-90页 |
| 3.1 试验材料 | 第67-68页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第67页 |
| 3.1.2 菌株及主要生化试剂 | 第67页 |
| 3.1.3 试剂的配制 | 第67-68页 |
| 3.2 试验方法 | 第68-72页 |
| 3.2.1 总RNA的提取及检测 | 第68-69页 |
| 3.2.2 RT-PCR扩增目的基因片段 | 第69-71页 |
| 3.2.3 基因全长的克隆 | 第71-72页 |
| 3.3 结果与分析 | 第72-88页 |
| 3.3.1 欧李果实总RNA的提取 | 第72-73页 |
| 3.3.2 欧李MDH基因的克隆和分析 | 第73-77页 |
| 3.3.3 欧李ME基因的克隆和分析 | 第77-82页 |
| 3.3.4 欧李VHA基因的克隆和分析 | 第82-88页 |
| 3.4 讨论 | 第88-90页 |
| 第四章 欧李果实苹果酸积累关键酶基因表达与酶活性分析 | 第90-98页 |
| 4.1. 试验材料 | 第90页 |
| 4.2 试验方法 | 第90-93页 |
| 4.2.1 欧李果实酸含量的测定 | 第90-91页 |
| 4.2.2 酶活性测定 | 第91-92页 |
| 4.2.3 苹果酸积累酶基因的荧光定量分析 | 第92-93页 |
| 4.3 结果与分析 | 第93-96页 |
| 4.3.1 欧李果实中苹果酸积累动态 | 第93-94页 |
| 4.3.2 欧李果实苹果酸积累关键酶基因的表达分析 | 第94页 |
| 4.3.3 欧李果实苹果酸积累关键酶活性的变化 | 第94-95页 |
| 4.3.4 欧李果实苹果酸积累关键酶活性、基因表达与苹果酸含量的关系 | 第95-96页 |
| 4.4 讨论 | 第96-98页 |
| 研究结论 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-106页 |
| Abstract | 第106-108页 |
| 附录 | 第110-122页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第122-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
