Mo17和大刍草的基因组组装、重复序列注释及基因组比较分析

摘要	第1-7页
Abstract	第7-9页
缩略词表	第9-10页
1 前言	第10-19页
·玉米简介	第10页
·测序技术简介	第10-12页
·基因组组装	第12-15页
·序列组装算法	第12-14页
·其它辅助组装方法	第14页
·由数据类型划分的基因组组装的类型	第14-15页
·基因组序列之间的变异分析	第15-17页
·基于参考基因组和重测序数据检测变异	第15-17页
·基于已组装好的基因组之间的序列比对分析	第17页
·本研究的目的和内容	第17-19页
2 材料和方法	第19-28页
·本研究的数据来源	第19页
·本研究所用到的软件	第19-22页
·数据预处理	第22-23页
·基因组组装	第23-26页
·重复序列注释	第26页
·SNP和InDel的识别和注释	第26页
·PAV检测	第26-28页
3 结果和分析	第28-47页
·数据量与质量	第28-31页
·基因组组装	第31-33页
·基因组质量评估	第33-37页
·重复序列注释	第37-40页
·SNP和InDel的识别和注释	第40-43页
·PAV的检测	第43-47页
4 讨论	第47-49页
参考文献	第49-56页
附录 硕士期间发表的论文	第56-57页
致谢	第57页